Instytut partycypuje również w kształceniu w specjalnościach: systemy komputerowe, zautomatyzowane systemy dowodzenia, a od roku akademickiego 2014/2015 profiluje kolejne trzy specjalności: informatyczne systemy zarządzania w medycynie, inżynieria diagnozowania medycznego (na kierunku informatyka w medycynie) oraz bezpieczeństwo informacyjne (na kierunku kryptologia i cyberbezpieczeństwo).
Zajęcia praktyczne ze studentami odbywają się w laboratoriach Wydziału Cybernetyki wyposażonych w nowoczesny sprzęt komputerowy. Studenci korzystają ze stanowisk roboczych PC z oprogramowaniem umożliwiającym dostęp do Internetu oraz do systemów informatycznych wykorzystywanych w procesie nauczania.
Prace naukowe i badawcze w Instytucie Systemów Informatycznych prowadzone są w zakresie:
■ projektowania informatycznych systemów wspomagania decyzji
■ modelowania i algorytmizacji procesów decyzyjnych w sytuacjach konfliktowych i kryzysowych
■ modelowania i projektowania komputerowych systemów wspomagania decyzji medycznych
■ budowy modeli symulacyjnych złożonych systemów (technicznych, informacyjnych, ekonomicznych, walki)
■ metod i narzędzi projektowania systemów informatycznych
■ metod i narzędzi projektowania baz danych
■ systemów baz danych i hurtowni danych
■ projektowania systemów rozproszonych
■ budowy inteligentnych systemów ochrony obiektów
■ modelowania i symulacji mobilnych sieci telekomunikacyjnych
■ zastosowania metod sztucznej inteligencji i badań operacyjnych
■ inżynierii oprogramowania
■ informatycznych systemów zarządzania
■ efektywności, eksploatacji i usprawniania systemów informatycznych
■ niezawodności oprogramowania
■ systemów mobilnych
■ analizy i projektowania fotonicznych systemów transmisji danych.
W celu pozyskiwania i realizacji zadań badawczych powołano w Instytucie Systemów Informatycznych dwa zespoły: Zespól Badawczy Modelowania, Symulacji i Wspomagania Decyzji w Sytuacjach Kryzysowych i Konfliktowych (pod kierownictwem dr. hab. inż. Andrzeja Najgebauera) oraz Zespół Badawczy Analiz Numerycznych i Przetwarzania Informacji Wizyjnych w Systemach Wspomagania Decyzji w Medycynie (pod kierownictwem prof. dr. hab. inż. Andrzeja Walczaka). W oparciu o odpowiedni zasób kadrowy i bazę sprzętową, zespoły te oferują usługi w zakresie prac projektowych i wdrożeniowych, wykonują badania, analizy i ekspertyzy w zakresie swoich specjalności.
Instytut Systemów Informatycznych współpracuje z Instytutem Badań Systemowych PAN, Akademią Górniczo-Hutniczą w Krakowie, SAS Institute Polska, Biurem Informacji Kredytowej, Politechniką Warszawską, Szkołą Główną Służby Pożarniczej, Akademią Obrony Narodowej, Uniwersytetem Białostockim, Politechniką Rzeszowską, Wyższą Szkołą Informatyki i Zarządzania w Rzeszowie, Wojskowym Instytutem Łączności, Przemysłowym Instytutem Telekomunikacji, Centrum Techniki Morskiej, Southampton University w Wielkiej Brytanii oraz Instytutem Fizyki Uniwersytetu Kijowskiego.