Podstawą zjawiska MRJ jest oddziaływanie spinów jądrowych z polami magnetycznymi:
stałym polem magnetycznym Bz, które jest wytwarzane magnesami,
zmiennym polem magnetycznym Bxy, skierowanym prostopadle do osi z
zmiennymi polami lokalnymi generowanymi przez sąsiednie jądra atomów oraz znajdujące się na nich chmury elektronowe.