Rada jest organem zarządzającym w okresie dwuletnim między sesjami Zgromadzenia. W jej skład wchodzą, wybierani przez Zgromadzenie na okres dwóch lat, przedstawiciele:
• 10 państw posiadających flotę morską o największym tonażu,
• 10 państw o największych obrotach w handlu morskim,
• 20 państw mających szczególne znaczenie dla żeglugi lub transportu morskiego, których wybór do Rady zapewnia reprezentowanie w niej wszystkich regionów geograficznych świata.
W ramach IMO działają następujące komitety:
1. Komitet Bezpieczeństwa na Morzu (Maritime Safety Committee - MSC) zajmujący się sprawami technicznymi związanymi z bezpieczeństwem na morzu.
2. Komitet Ochrony Środowiska Morskiego (Marinę Environment Protection Committee - MEPC) prowadzący działalność w zakresie spraw związanych z zapobieganiem i kontrolą zanieczyszczeń środowiska morskiego przez statki.
3. Komitet Prawny (Legał Committee - LEG) rozpatrujący wszelkie sprawy prawne wynikające z zakresu działalności IMO.
4. Komitet Ułatwień (Facilitation Committee - FAL) działający w dziedzinach związanych z ułatwieniami międzynarodowego handlu morskiego i przewozu pasażerów. Działalność ta ma na celu ograniczenie formalności, uproszczenie wymaganej dokumentacji i usprawnienie obsługi statków w portach.
5. Komitet Współpracy Technicznej (Technical Co-Operation Committee -TC) koordynujący prace IMO w zakresie zapewnienia pomocy technicznej w dziedzinie gospodarki morskiej, zwłaszcza krajom rozwijającym się.
Komitety MSC i MEPC realizują swoje zadania poprzez podkomitety, które zostały powołane w celu wykonania prac w określonych dziedzinach. Obecnie działają podkomitety do spraw:
• Bezpieczeństwa Żeglugi (Sub-Committee on Safety of Navigation - NAV),
• Cieczy i Gazów Przewożonych Luzem (Sub-Committee on Bulk Liąuids and Gases - BLG),
• Konstrukcji i Wyposażenia Statku (Sub-Committee on Ship Design and Eąuipment - DE),
• Ochrony Przeciwpożarowej (Sub-Committee on Fire-Protection - FP),
• Przewozu Towarów Niebezpiecznych, Ładunków Stałych i Kontenerów (Sub-Committee on the Carriage of Dangerous Goods Solid Cargoes and Containers - DSC),
19