36 A. KOZIK [4]
charakterystyczne m.in. dla enzymów allosterycznych (21, 22). Często stosowany, półilościowy sposób charakteryzowania kooperatywności w układach białko-ligand polega na podaniu tzw. współczynnika Hilla (23) tj. współczynnika nH w równaniu
(równanie 5)
nk [L]"H 1 + k [Lp
przy czym nH ^ n. W przypadku kooperatywności ujemnej nH < 1, w przypadku kooperatywności dodatniej nH>l.
III. Chromatograficzne sączenie molekularne
III-l. Najprostsze zastosowania
W przypadkach, gdy tworzenie kompleksu białko-ligand jest procesem bardzo powolnym (24), izotermę wiązania można wyznaczyć w bardzo prosty sposób. Białko inkubuje się z ligandem do ustalenia równowagi, po czym oddziela się ligand wolny od białka zawierającego ligand związany (ryc. 1A). Z ilości ligandu we frakcji białkowej oblicza się wartości r i [L], odnoszące się do wyjściowej mieszaniny inkubacyjnej. Stanowią one współrzędne pojedynczego punktu izotermy.
Metodą tą wyznaczano m.in. parametry oddziaływania hormonów sterydowych z receptorami, przy zastosowaniu chromatografii na żelach Sephadex, zarówno kolumnowej (25—27) jak i cienkowarstwowej (28).
Jeżeli w trakcie chromatografii może występować częściowa dysocja-cja kompleksu białko-ligand, mierzone wartości r są systematycznie zaniżane. Powoduje to nie tylko błędy w oszacowaniu parametrów wiązania,
— — —~ — — —-— — | ||||
Objętość eluatu
Ryc. 1. Profile wymywania w metodach chromatograficznego sączenia molekularnego, wykorzystywanych do wyznaczania parametrów oddziaływania ligand-białko. A. Prosty rozdział ligandu związanego z białkiem od ligandu wolnego, B. Metoda Hummela i Dryera, C. Technika analizy czołowej. Z zakreskowanych obszarów na Ryc. A i B oblicza się ilość ligandu związanego z białkiem.