W I R U S Y
Wirus →
to stosunkowo mały patogen
zbudowany z jednego typu
kwasu nukleinowego (DNA
lub RNA, chociaż są wirusy.
WIRUSY
• Są takie, które w swoim cyklu życiowym
przechodzą przez fazę DNA oraz RNA.
• Są to cząstki, które nie mogą się namnażać
na sztucznym podłożu.
• Nie posiadają własnej maszynerii
przemiany materii. Wirus może istnieć
pozakomórkowo, jednak wtedy nie zachodzą
w nim żadne przemiany metaboliczne.
• Oprócz wirusów istnieją inne bezkomórkowe
czynniki infekcyjne - złożone tylko z RNA
wiroidy, wirusoidy oraz białkowe priony
Wyjaśnienie znaczenia
używanych pojęć:
• Wirus - bardzo ogólne określenie, można go używać we wszystkich
etapach replikacji wirusa.
• Wirion - pełna cząsteczka wirusa występująca pozakomórkowo, pełni
funcje spoczynkową,
jest cząsteczką zawierającą kwas nukleinowy, otoczoną
przez białka i niekiedy posiadającą pewne inne komponenty
makrocząsteczkowe
• Wiroid - zbudowany z jednoniciowego RNA, pozbawiony otoczki
zewnętrznej, może ulegać samodzielnej replikacji, replikacja
przebiega w jądrze komórkowym
• Wirusoid - cząstka satelitarnego RNA, bez kapsydu, nie może
samodzielnie się replikować, musi do tego celu wykorzystywać wirus
pomocniczy. Wirusoid wnika do kapsydu wirusa pomocniczego i dzięki
temu może być przenoszony z jednego gospodarza do drugiego.
• Priony - infekcyjne cząsteczki białka
• Transpozon - ruchomy element genetyczny; fragment DNA, który
może się przemieszczać w obrębie materiału genetycznego.
• Primer - starter RNA, potrzebny do zainicjowania replikacji.
• ssDNA/RNA - jednoniciowe DNA/RNA.
• dsDNA/RNA - dwuniciowe DNA/RNA.
• (-) - nić o ujemnej polarności.
• (+) - nić o dodatniej polarności.
PRIONY
( ang.proteinaceous infectious particle)
POJĘCIE WPROWADZONE 1982 ROKU przez STANLEYA
PRUSINERA (NOBEL 1997r.) dla infekcyjnych cząsteczek
białkowych pozbawionych kwasu nukleinowego.
EPIDEMIOLOGIA:
Powodują choroby układu nerwowego:
• zwierząt (m.in. owiec i kóz – trząsawka, gąbczasta
encefalopatia bydła BSE )
• oraz człowieka (m.in. chorobę Creutzfelda-Jacoba – CJD
dotyczy osób po 60 rż. (Anglia 1995 r.) ; choroba Kuru –
plemię FORE - Papui- Nowej Gwinei rytualne jedzenie
mózgu zmarłych).
• Źródłem zakażeń były też leki gonadotropina i preparat
hormonu wzrostu przygotowany z przysadek ludzkich
( Anglia 1995 r przypadki nazwane wariantem v CJD – do
2004 r. zanotowano 160 takich przypadków u młodych ludzi)
DEKONTOMINACJA: Priony są odporne na na rutynowo
stosowane techniki sterylizacji. Zaleca się stosowanie
sprzętu jednorazowego do zabiegów.
BUDOWA I METABOLIZM PRIONU
Pod względem budowy chemicznej priony są oligomerami
białkowymi i mają takie same sekwencje aminokwasowe
jak białko PrP
c
– (ang. Prion protein-cellular – komórkowe
białko prionowe) występujące w zdrowych komórkach
ludzi i zwierząt.
PRIONY są formami patologicznymi PrP
c
znanymi jako PrP
cS
lub produktami zmutowanego genu komórkowego.
Patologiczne białko różni się od PrP
c
strukturą
drugorzędową i wynikającymi z niej właściwościami
fizykochemicznymi. Jest oporne na działanie proteinazy K,
degradującej całkowicie PrP
c
Struktura przestrzenna PrP
cS
ułatwia polimeryzację i
wytrącanie się w postaci nierozpuszczalnych włókien
amyloidowych, co wydaje się bezpośrednią przyczyną
degradacji włókien nerwowych. Teoria Prusinera zakłada ,
że tworzenie potomnych białek prionowych polega na
łączeniu się cząstek patologicznego białka PrP
cS
z cząstką
normalnego białka komórkowego PrP
c
i wymuszaniu jego
zmiany w formy patologiczne
ELEMENTY STRUKTURY WIRUSA
GENOM WIRUSA to DNA lub RNA
zawierające pełną informację o
budowie, właściwościach i innych
cechach przekazywanych
potomnym generacjom wirusów.
Zazwyczaj występuje w postaci
jednej cząstki pojedynczej lub
podwójnej nici nukleotydów,
może być liniowy lub kolisty.
CD. ELEMENTY STRUKTURY
WIRUSA
Wirusy zawierające pojedynczą nić
RNA zostały podzielone ze względu
na sposób replikacji genomu na:
• Wirusy o polarności dodatniej
• Wirusy o polarności ujemnej
U niektórych wirusów kwas
nukleinowy jest podzielony na
segmenty, np. wirus grypy ma 8
odcinków, reowirusy 10 – 12
odcinków.
CD. ELEMENTY STRUKTURY
WIRUSA
GENOM wraz białkami DNA lub RNA stanowią
RDZEŃ, osłonięty jednostkami białkowymi
KAPSOMERAMI tworzącymi KAPSYD
CAŁOŚĆ NOSI NAZWĘ
NUKLEOKAPSYDU
Niektóre wirusy mają dodatkową strukturę
LIPIDOWĄ, dwuwarstwową osłonkę zewnętrzną ,
w której zakotwiczone są wypustki
glikoproteinowe tzw. PEPLOMERY kodowane przez
genom wirusa.
CD. ELEMENTY STRUKTURY
WIRUSA
Osłonka pochodzi z błony
cytoplazmatycznej lub jądrowej komórki
i jest nabywana w cyklu replikacyjnym,
w procesie dojrzewania potomnych
cząstek wirusowych lub ich uwalniania z
komórki.
• Zawartość lipidów w osłonce powoduje,
że wirusy te są wrażliwe na
rozpuszczalniki organiczne.
• Glikoproteinowe wypustki pełnią ważną
funkcję w adsorpcji i wnikaniu wirusów
do wrażliwych komórek, mają także
właściwości immunogenne.
SYMETRIA PRZESTRZENNA
WIRUSA
Wyróżnia się cztery zasadnicze formy
wirusów:
•Bryłowe – będące najczęściej
dwudziestościanami, lub dwunastościanami.
•Spiralne – (helikoidalne), mające zwykle
postać dłuższej, lub krótszej pałeczki, lub
nieregularnych splotów
•O budowie złożonej .
BAKTERIOFAGI, czyli fagi, mają
specyficzną postać:
• W bakteriofagu wyróżnia się część
główkową i ogonek.
• Osłona białkowa w dolnej części
bakteriofaga przechodzi w nurkowaty
ogonek, zakończony nitkowatymi
wyrostkami („czółkami”), które
umożliwiają mu przytwierdzenie się
do powierzchni komórek bakterii. Na
końcu ogonka znajduje się enzym
rozkładający ścianę k
POSTACIE FUNKCJONALNE
WIRUSÓW
• Pozakomórkowa ( spoczynkowa) –
określana jako WIRION
• Wewnątrzkomórkowa ( aktywna) –
którą jest wirusowy genom
pozbawiony białkowego płaszcza.
W środowisku pozakomórkowym
wirusy są szczególnie wrażliwe na
oddziaływanie czynników
fizycznych i chemicznych.
WRAŻLIWOŚĆ NA CZYNNIKI
FIZYCZNE I CHEMICZNE
1. NISKIE TEMPERATURY – szczególnie
stan głębokiego zamrożenia (-95°C)
sprzyjają utrzymywaniu się aktywności
zakaźnej, natomiast temperatury
podwyższone unieczynniają je w
krótkim czasie. Do wyjątków należy
HBV wytrzymujący temperaturę 60°C
12 godzin. W temperaturze pokojowej
większość wirusów ulega nieznacznej
inaktywacji.
WRAŻLIWOŚĆ NA CZYNNIKI
FIZYCZNE I CHEMICZNE
2. WYSUSZENIE MATERIAŁU
zawierającego wirusy w
temperaturze pokojowej prowadzi
do do szybkiego unieczynnienia,
natomiast gdy przeprowadza się
je w niskiej temperaturze
LIOFILIZACJA – zostaje zachowana
zarówno zakaźność, jak i cechy
antygenowe wirusa.
WRAŻLIWOŚĆ NA CZYNNIKI
FIZYCZNE I CHEMICZNE
3. DZIAŁANIE ULTRADZWIĘKÓW
doprowadza do mechanicznego
uszkodzenia wirusów.
4. INAKTYWACJĘ wirusów
powodują także
PROMIENIOWANIE JONIZUJACE I
NIEJONIZUJACE UV –
fotochemiczne uszkodzenie
kwasu nukleinowego.
WRAŻLIWOŚĆ NA CZYNNIKI
FIZYCZNE I CHEMICZNE
5.
pH środowiska – najbardziej
odpowiednie jest środowisko zbliżone
do obojętnego. Niektóre np.
retrowirusy, wirusy kleszczowego
zapalenia mózgu tolerują środowisko
soku żołądkowego.
6.
Wrażliwość na eter ( rozpuszczalnik
lipidów umożliwia rozróżnić wirusy
osłonkowe i bezosłonkowe. Detergenty
powodują rozpad osłonek lipidowej i
kapsydów.
Replikacja wirusa-
proces namnażania się
wirusów prowadzący do powstania cząstek potomnych.
- odbywa się dopiero po wprowadzeniu jego
materiału genetycznego do komórki gospodarza.
Gdy wirus znajdzie się w komórce rozpoczyna się
jego reprodukcja. Proces ten związany jest z
infekowaniem komórki gospodarza. W związku z
małą wielkością wirus zawiera jedynie bardzo
podstawowe informacje dotyczące jego genomu,
regulacji reprodukcji oraz budowy otoczki białkowej.
Wobec tego podczas procesu reprodukcji jest on w
dużym stopniu zależny od metabolicznych i
strukturalnych cech gospodarza, dostosowując je w
pewnym stopniu do swoich potrzeb. Wirus zdolny
jest do wprowadzania dziedzicznych (korzystnych
lub destruktywnych) zmian w genomie gospodarza.
Proces ten jest zjawiskiem wieloetapowym.
ETAPY REPLIKACJI
Aby mogło dojść do zakażenia komórki i zapoczątkowania
cyklu replikacji komórka musi być w odpowiedniej fazie
podziału i posiadać na powierzchni receptory
adsorpcyjne.
1. ADSORPCJA
2. Drugi etap to PRZENIKANIE (PENATRACJA) wirusa przez
błonę komórkową do przestrzeni cytoplazmatycznej.
Zachodzi na zasadzie:
a. Pinocytozy
b. Endocytozy ( wiropeksji)
c. Fuzji wirusowj osłonki z błoną komórkową
d. Translokacji
3. Faza EKLIPSY lub UTAJNIENIA ( właściwa replikacja
genomu)
4. FORMOWANIE POTOMNYCH WIRIONÓW
5. UWOLNIENIE ( przez egzocytozę lub lizę komórek
gospodarza)
Ad.1
ADSORPCJA jest procesem fizykochemicznym,
w którym ujawniają się różnice ładunków i
przyciągające siły cząsteczkowe między
powierzchniowymi receptorami wirusowymi
(GLIKOPROTEINAMI)
→ ze specyficznymi receptorami
komórkowymi (GLIKOPROTEINAMI lub
GLIKOLIPIDAMI).
To precyzyjne oddziaływanie powoduje że
określone wirusy zakażają tylko pewien typ
komórek lub tkanek
Ad.2 a,b
Pinocytoza i endocytoza
Są procesami, w których w miejsca przyłączenia wirusa z
receptorem dochodzi do uwypuklenia błony komórkowej. Wirus
zostaje nią otoczony i zamknięty w pęcherzyku, w którym
wędruje w głąb cytoplazmy. Podlega w nim przemianie
chemicznej doprowadzającej do pozbycia się zewnętrznej
osłonki lipidowej- ODPŁASZCZANIE i UWOLNIENIE KAPSYDU.
UWOLNIONY KWAS NUKLEINOWY JEST TRANSPORTOWANY
DO ODPOWIEDNIEGO MIEJSCA W KOMÓRCE GDZIE NASTĘPUJE
JEGO REPLIKACJA – DLA NIEKTÓRYCH WIRUSÓW JEST TO JĄDRO
A DLA INNYCH CYTOPLAZMA.
Niektóre wirusy ( np. paramyksowirusy ) maja specyficzne białko
tzw.BIAŁKO FUZJI, które w momencie przechodzenia przez
błonę komórkową doprowadza do FUZJI (zlania) się lipidów
osłonki wirusowej z błoną komórkową. Do cytoplazmy dostaje
się NUKLEOKAPSYD, z którego po odbiałczeniu uwalnia się
kwas nukleidowy.
TRANSLOKACJA zachodzi prawdopodobnie w przypadku małych
wirusów o symetrii ikosahedralnej i polega na bezpośrednim
przejściu wirusa przez błonę cytoplazmatyczną.
Ad. 3
FAZA EKLIPSY
lub utajnienia jest to WŁAŚCIWA REPLIKACJA
GENOMU WIRUSOWEGO, prowadząca do syntezy kwasu
nukleinowego i wirionowych białek.
• Okres ten trwa różnie długo dla rozmaitych wirusów i
przebiega w różny sposób w zależności od charakteru i
budowy kwasu nukleinowego.
• Białka mogą być syntetyzowane w jądrze np. retrowirusy,
adenowirusy, herpeswirusy; lub w cytoplazmie np.
pokswirusy, pikornawirusy, hepadnawirusy.
• Zazwyczaj w pierwszej kolejności są syntetyzowane
enzymy niezbędne do replikacji kwasu nukleinowego i białek
regulacyjnych
• Kolejny etap to translacja białek strukturalnych
tworzących kapsyd
W następstwie zakażenia niektórymi wirusami ustaje w
komórkach syntetyzowanie białek i kwasów nukleinowych, a
cały wysiłek procesów syntezy w komórce jest
skoncentrowany na syntezie składników wirusa.
Ad.4 i 5
Formowanie potomnych wirionów i
uwalnianie
oznacza koniec fazy EKLIPSY.
Wirusy osłonkowe w procesie
dojrzewania, przy przejściu przez błonę
jądrową lub cytoplazmatyczną zostają
otoczone warstwą lipidową i wzbogacone
w składniki polisacharydowe (m.in..
ortomyksowirusy, paramyksowirusy,
togawirusy).
UWOLNIENIE powstałych cząstek zachodzi na
drodze pączkowania – EGZOCYTOZY lub
rozpadu – LIZY komórek gospodarza,
czasami odbywa się przez kanaliki
komórkowe lub wodniczki z nimi związane.
KLASYFIKACJA WIRUSÓW
Wirusy można sklasyfikować w oparciu o:
• organizację posiadanego przez nie materiału genetycznego. Materiał
genetyczny wirusów może występować w kilku formach: DNA jedno- lub
dwuniciowe, RNA jedno- lub dwuniciowe oraz zarówno DNA jak i RNA lecz
na różnym etapie istnienia wirionu.
• Morfologię, kształt i wielkość wirionu
• Obecność lub brak osłonki
• Wrażliwość na czynniki fizyczne i chemiczne
• Obecność enzymów i in. białek funkcyjnych
• Cechy biologiczne ( tropizm do tkanek, wrażliwość gatunkowa,
chorobatwórczość, sposób przenoszenia, rozprzestrzenienie
geograficzne, nazwika odkrywcy)
• w zależności od rodzaju infekowanego organizmu: wirusy roślinne,
zwierzęce i bakteryjne
NAZEWNICTWO:
Ustalono następujące zasady klasyfikacji wirusów:
• Rząd - końcówka viriales
• Rodziny - „ viriadae
• Podrodziny - „ virinae
• Rodzaje - „ virius
• Gatunki, typy i szczepy, warianty
PATOMECHANIZM ZAKAŻEŃ
WIRUSOWYCH
Wniknięcie wirusa do organizmu i konsekwencje
tego zjawiska w postaci rozprzestrzenienia
się, namnożenia w ustroju i zmian
patologicznych prowadzących do rozwoju
zakażenia ma wpływ wiele czynników:
1. zarówno wynikających z cech zarazka, takich
jak:
- zjadliwość wirusa
- jego dawka zakaźna,
2. jak i gospodarza
- jego uwarunkowań genetycznych
- stanu odporności
RELACJE WIRUS - KOMÓRKA
LATENCJA – zakażenie utajone.
Zakażenie latentne, w których namnażanie
wirusa jest zatrzymane na pewnym etapie
cyklu replikacji. Np. Herpes simplex (ospy
wietrznej i półpaśca – zakażają komórki
nerwowe. Na skutek bodźca (chemicznego,
termicznego itp. ) może nastąpić reaktywacja
wirusa.
INTERFERENCJA WIRUSOWA – zakażenie
kilkoma różnymi wirusami. Polega na braku
możliwości namnażaniu się danego wirusa w
komórce, co jest spowodowane
wcześniejszym zakażeniem innym wirusem.
ODDZIAŁYWANIE WIRUS -
ORGANIZM
WROTA ZAKAŻENIA – układ oddechowy, przewód
pokarmowy, układ moczowo – płciowy, skóra
uszkodzona, błona śluzowa oka, wertykalna.
WIREMIA
ZAKAŻENIA BEZOBJAWOWE – w miejscu wniknięcia
dochodzi do pierwotnego namnażania i drogą naczyń
chłonnych lub krwionośnych → WIREMIA PIERWOTNA
zostaje przeniesiony do komórek układu siateczkowo
– środbłonkowego węzłów chłonnych, śledziony,
wątroby lub szpiku kostnego.
W tych komórkach następuje dalsza replikacja
wirusa, a po osiągnięciu pewnego poziomu dochodzi
do przedostania się wirusa do krwi → WTÓRNA
WIREMIA.
RYZYKO WIRUSOWYCH ZAKAŻEŃ WERTYKALNYCH I
OKOŁPORODOWYCH
++ duże ryzyko, + małe ryzyko, BM – wirus przenoszony z mlekiem
matki
* - zakażenie pierwotne u matki
WIRUS
Przez
łożysko
W czasie
porodu
Po urodzeniu
Wirus różyczki
++
*
-
-
Cytomegalowirus
+/ ++* ++
++ BM
Wirus opryszczki
+
++
+
Wirus ospy
wietrznej/półpaśca
++
+
+
Parwowirus B19
++*
-
-
HIV
+
++
+ BM
Wirus zapalenia wątroby
typu B
+
++
++
Ludzkie wirusy papilloma
-
++
-
ZAKAŻENIA NARZĄDÓW DOCELOWYCH
– ze względu na rodzaj tkanki
docelowej mówi się o tropizmie
wirusów np.
• Neurotropowe
• Hepatotropowe
• Pneumotropowe
• Dermatropowe
• Pantropowe – gdy wiele narządów i
tkanek zostaje zakażonych
MECHANIZMY OBRONNE WIRUSÓW
Wiele wirusów wykształciło mechanizmy dzięki którym atak układu
immunologicznego gospodarza jest nieskuteczny.
1.
Stan latencji
2.
Zakażenie toczy się w miejscach niedostępnych dla układu
immunologicznego np.. w CUN
3.
Tworzenie syncytiów komórkowych – połączenie między
komórkami, w następstwie zakażenia np.. Paramyksowirusami
ułatwia szerzenie się wirusa z komórki do komórki.
4.
Zmienność antygenowa – charakterystyczna dla wielu wirusów
RNA np. grypy, HIV
5.
Posiadanie antygenów, które są zbliżone do antygenów układu
zgodności tkankowej, przez co nie rozpoznawane jako obce
przez komórki układu odpornościowego np. wirus cytomegalii
Mechanizmy te nie pozwalają na całkowite usunięcie wirusów z
organizmu (tak się dzieje w większości ostrych zakażeń ) i
rozwija się zakażenie przetrwałe. Typowym przykładem jest
zakażenie wirusem opryszczki, wirus ospy wietrznej i półpaśca,
wirus odry ( u niektórych osób dostaje się do CUN i po latach
powoduje podostre stwardniające zapalenie mózgu, wirus
zapalenia wątroby typu B i C , rotawirusy, priony
DIAGNOSTYKA WIRUSOLOGICZNA
opiera się na:
• Wykazaniu obecności i zidetyfikowaniu
określonego wirusa, jego antygenów
lub kwasu nukleinowego w materiale
klinicznym (tylko na początku
choroby): metody mikroskopowe
• Ocenie odpowiedzi immunologicznej
na zakażenie : metody serologiczne –
odczyn neutralizacji, zahamowania
hemaglutynacji, hemadsorpcji);
metody molekularne
LEKI PRZECIWWIRUSOWE
Pomimo że zakażenia wirusowe stanowią
około 90% infekcji, które występują w ciągu
roku poza szpitalami, ich zdecydowana
większość ma charakter samoograniczający
i po leki przeciw wirusowe sięga się rzadko
i tylko w przypadkach ciężkiego przebiegu
niektórych zakażeń.
Chemioterapeutyków przeciwwirusowych jest
niewiele, jest to związane z otrzymaniem
skutecznego związku o działaniu przeciw
wirusowym, który hamuje proces
namnażania się wirusa i nie jest toksyczny
dla komórki gospodarza.
Mechanizm działania związków
przeciwwirusowych można podzielić na:
1. Hamujące proces odpłaszczania i uwalniania
genomu do cytoplazmy
2. Hamujące wirusową polimerazę DNA , enzym
który umożliwia przyłączenie kolejnych
nukleozydów, czyli reakcję polimeryzacji.
Związki te są analogami naturalnych
nukleozydów, które wbudowują się do łańcucha
DNA, uniemożliwiając dalszą syntezę kwasu
nukleinowego. Maja działania niepożądane-
mogą wbudowywac się do DNA komórki
gospodarza.
3. Hamujące odwrotną transkryptazę ( enzym
kluczowy w procesie replikacji wirusa
przypisujący informację zawartą w RNA na
komplementarną nić DNA) - inhibitiory
rewertazy HIV
cd.
1.
Inhibitory proteaz – ta grupa leków blokuje
miejsce aktywne enzymu, który jest niezbędny w
procesie dojrzewania i formowania czastek wirusa
HIV. Unieczynnienie tego enzymu zatrzymuje
proces namnażania wirusa w komórce.
2.
Związki o szerokim zakresie działania – hamują
polmerazy wirusowe, a przez to namnażanie
zarówno DNA jak i RNA wirusów m.in. grypy,
retrowirusów, adenowirusów
3.
Związki hamujące uwalnianie potomnych
wirionów – to niedawno odkryte selektywne
inhibitory neuraminidazy wirusa typu A i B
Dobre rezultaty daje terapia HAART ( ang. Highly
activ anti-retroviral therapy)- stasowanie 3
skojarzonych leków antywirusowych w leczeniu
HIV, HBV i HCV .