Kolo 1
Wzorami
strukturalnymi: dwupeptyd zbudowany z fenyloalaniny i aminokwasu,
który w łańcuchu bocznym zawiera siarkę.
2)
Napisz schemat reakcji syntetyzowanej przez polimerazę delta.
3)
Wykres 1/V od 1/S dla enzymu o kooperacji=80 i stałej Hilla=1
4)
Scemat reakcji przeprowadzanej przez kinazę kreatynową.
5)
Podać wzór strukturalny nukleozydu wchodzącego w skład
nukleotydu występującego na końcu 3' dojrzałego mRNA.
6)
Napisać wzorami strukturalnymi reakcję katalizowaną przez enzym
II klasy.
7)
Narysować wykres [s] od t dla reakcji zerowego rzędu katalizowanej
przez enzym allosteryczny bez i w obecności aktywatora.
8)
Narysować wykres wysycenia tlenem od pO2 dla HbA i HbF + podać
wartości P50 dla obu.
9)
Narysować wzór dipeptydu zbudowanego z cysteiny i proliny.
10)
Napisać reakcję katalizowaną przez enzym klasy 6, którego
aktywność regulowana jest przez depolimeryzację/polimeryzację.
11)
Wykres V od T dla enzymu typu K bez i z aktywatorem + napisać
przykład takiego enzymu i aktywatora dla niego.
12)
Schemat naprawy DNA w którym wystepuje uracyl (model "krótkiej
łatki") + nazwy wszystkich enzymów biorących udział.
13)
Wzór strukturalny dipeptydu zbudowanego z tryptofanu i dowolnego
aminokwasu zawierającego w łańcuchu bocznym grupę -OH.
14)
Słownie reakcję katalizowaną przez enzym klasy II z glukozą jako
substratem.
15)
Wykres V od S dla enzymu allosterycznego typu V z i bez efektora
dodatniego. Podać przykład takiego enzymu i efektora.
16)
Schemat powstawania Apo48 i Apo100 ( redagowanie
DNA
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
nukleotyd będący częścią DNA, zawierający zasadę azotową komplementarną do adeniny.
dinukleotyd zbudowany z nukleotydów, pomiędzy którymi tworzą się w cząsteczce DNA trzy wiązania wodorowe.
dinukleotyd zbudowany z nukleotydów: a) najczęściej ulegającego w DNA metylacji i b) ulegającego uszkodzeniu po wpływem UV.
dinukleotyd zbudowany z dwóch nukleotydów będących częścią DNA, zawierających zasady purynowe.
dinukleotyd zbudowany z dwóch nukleotydów będących częścią DNA, zawierających zasady pirymidynowe.
zasadę azotową, która powstaje na skutek spontanicznej deaminacji 5-metylocytozyny.
reakcję katalizowaną przez glikozydazę uracylową DNA.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
katalizowaną przez odwrotną transkryptazę.
katalizowaną przez białko FEN w procesie wycinania startera podczas replikacji DNA jądrowego
katalizowaną przez polimerazę DNA.
katalizowaną przez ligazę DNA.
katalizowaną przez mitochondrialną polimerazę DNA.
(przyłączenia jednego nukleotydu) katalizowaną przez polimerazę DNA (delta).
katalizowaną przez primazę.
katalizowaną przez 3’ 5’ egzonukleazę DNA.
Wymień:
nazwy systemów naprawiających DNA i podaj po jednym przykładzie uszkodzenia przez nie naprawianego. MISMATCH, BER, NER
etapy izolacji DNA z krwi szczura, napisz dlaczego izolację przeprowadza się w obecności EDTA.
EDTA- bo wiaze jony metali dwuwartosciowych, które moglyby aktywowac enzymy trawiace dna
Degradacja blon kom i jadrowych za pomoca detergentow, usuniecie bialek przez wykorzystanie roznicy powinowactwa bialek i kwasow nukleinowych do chloroformu, wytracenie kwasow za pomoca alkoholu izopropylowego, przemywanie etanolem w celu zageszczenia i usuniecia zanieczyszczen, wysuszenie i rozpuszczenie w wodzie
składniki nukleosomu. 2x H2A, 2x H2B, 2xH3, 2xH3
trzy białka biorące udział w replikacji, które rozkładają ATP. HELIKAZA, LIGAZA, RFC (w remodelingu- brg1, swi, snf)
białkowe składniki kompleksu przeprowadzającego inicjację replikacji na nici wiodącej u eukariontów. ORC, CDC6,CD1, MCM2-7
kolejne enzymy uczestniczące w biosyntezie nici DNA z fragmentów Okazaki. RNAZA, FEN1, LIGAZA dna
trzy główne rodzaje uszkodzeń DNA w wyniku działania reaktywnych form tlenu. Rozerwanie wiazania fosfodiestrowego,
trzy przyczyny częstszego uszkodzenia mitochondrialnego DNA w porównaniu z jądrowym.
trzy transferazy uczestniczące w procesie replikacji DNA.
trzy hydrolazy uczestniczące w procesie replikacji DNA.
polimerazy DNA uczestniczące w procesie replikacji DNA jądrowego. Pol alfa, beta, sigma, epsilon
enzymy uczestniczące w systemie wycinania zasad w DNA zawierającym uracyl.
Przedstaw graficznie:
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
przedstawiający na widełkach replikacyjnych wszystkie etapy procesu syntezy DNA zachodzącej w komórkach eukariotycznych z uwzględnieniem białek i enzymów uczestniczących w tym procesie.
przedstawiający etapy techniki laboratoryjnej umożliwiającej identyfikację specyficznych sekwencji DNA przy ich jednoczesnym namnożeniu.
Oblicz:
RNA
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
nukleotyd znajdujący się na końcu 3’ dojrzałego transkryptu klasy II.
kwas 5’-adenylowy, podaj symbol biochemiczny tego związku.
dinukleotyd zbudowany z dwóch nukleotydów będących częścią RNA, zawierających zasady pirymidynowe.
trinukleotyd będący produktem transkrypcji na matrycy DNA o następującej sekwencji – ACT.
nukleotyd znajdujący się na końcu 5’ dojrzałego transkryptu klasy II.
reakcję edytowania RNA prowadzącą do pojawienia się w dojrzałym transkrypcie inozyny.
reakcję edytowania RNA prowadzącą do pojawienia się w dojrzałym ApoB48 dodatkowego kodonu stop.
trinukleotyd znajdujący się na końcu 3’ dojrzałej cząsteczki tRNA.
dinukleotyd tworzący „czapeczkę” na końcu 5’ dojrzałego mRNA.
dinukleotyd zbudowany z nukleotydów wchodzących w skład sekwencji DNA determinującej start procesu transkrypcji.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
reakcję procesu transkrypcji hamowaną przez -amanitynę.
dostarczającą energii niezbędnej w procesie syntezy łańcucha RNA na matrycy DNA.
katalizowaną przez nukleotydylotransferazę tRNA (niezależną od matrycy).
Wymień:
rodzaje RNA występujące w mitochondriach.
modyfikacje jakim może ulec mRNA w komórkach eukariotycznych.
trzy nietypowe nukleozydy występujące w kwasach rybonukleinowych.
enzymy uczestniczące w tworzeniu „czapeczki” w pre-mRNA.
Przedstaw graficznie:
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
ilustrujący przebieg modyfikacji transkryptów klasy II.
Oblicz:
TRANSLACJA
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
dwunukleotyd zbudowany z nukleotydów pirymidynowych wchodzących w skład antykodonu dla kodonu startowego translacji.
trinukleotyd będący antykodonem do kodonu AGC.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
katalizowaną przez peptydylotransferazę.
aktywacji aminokwasu inicjującego translację w mitochondriach.
katalizowaną przez peptydazę sygnałową.
Wymień:
białka uczestniczące w kotranslacyjnym transporcie białek do ER.
trzy białka biorące udział w translacji, które hydrolizują GTP.
trzy antybiotyki będące inhibitorami translacji i podaj, które etapy hamują.
trzy cechy kodu genetycznego.
Przedstaw graficznie:
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
przedstawiający wpływ puromycyny na przebieg translacji.
przedstawiający terminację translacji.
kotranslacyjnego transportu białek do ER.
inicjacji translacji.
regulację inicjacji biosyntezy globiny przez hem.
translacyjny cykl elongacyjny.
regulację inicjacji translacji przez czynniki wzrostowe.
Oblicz:
1. Związki z grupy niesteroidowych leków przeciwzapalnych (np. kw. acetylosalicylowy)
a) obniżają syntezę cholesterolu przez niekompetycyjne hamowanie aktywności reduktazy HMG-CoA
b) obniżają hamowanie retrowirusów przez kompetycyjne hamowanie odwrotnej transkryptazy
c) obniżają syntezę kw.arachidonowego przez allosteryczne hamowanie aktywności karboksylazy acetylo-CoA
d) obniżają syntezę prostaglandyn przez nieodwracalne hamowanie aktywności cyklooksygenazowej (dioksygenazowej) syntazy prostaglandynowej
e) obniżają namnożenie bakterii przez allosteryczne hamowanie aktywności cyklooksygenazowej (dioksygenazowej) syntazy prostaglandynowej
2.Aktywność właściwa enzymu
a) określa stopień czystości (jakości) preparatu enzymu
b) określa ile jednostek aktywności przypada na 1mg białka
c) określa ilość jednostek aktywności enzymu w jednostce objętości
d) określa ile jednostek aktywności przypada na 1mikromol enzymu
e) żadna z odpowiedzi nie jest poprawna
3.Biotyna jest niezbędna w reakcjach katalizowanych przez
a) aminotransferazy
b) karboksylazy
c) dehydrogrnazy
d) kinazy
e) peroksydazy
4.Przykładem izoenzymów są:
a) syntaza kw. tłuszczowych, karboksylaza acetylo-CoA, pepsyna
b) dehydrogenaza jabłczanowa, dehydrogenaza mleczanowa, dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowa
c) pepsyna, fumaraza, dehydrogenaza mleczanowa
d) chymotrypsyna, dehydrogenaza mleczanowa, dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowa
e) syntaza kw. Tłuszczowych, karboksylaza acetylo-CoA, dehydrogenaza mleczanowa
5.Po dodaniu ..(V0).. mieszaniny reakcyjnej inhibitora akompetycyjnego
a) wzrasta szybkość max reakcji (Vmax) i spada Km
b) spada Vmax i spada Km
c) wzrasta Vmax i wzrasta Km
d) spada Vmax i Km nie ulega zmianie
e) Vmax nie ulega zmianie ,wzrasta Km
6.Do klasy transferaz należą następujące grupy enzymów
a) glikozydazy, dehydrogenazy, hydrolazy
b) aminotransferazy, karboksylazy, kinazy
c) dekarboksylazy, metylotransferazy, epimerazy
d) transketolazy, kinazy, glikozylazy
e) acetylotransferaz, transketolazy, metylotransfyrazy
7.Które z poniższych stwierdzeń nie jest prawdziwe
a) enzymy są wysoce specyficzne wobec substratów
b) enzymy dostarczają energii niezbędnej do zwiększenia reakcji chemicznej
c) enzym może być użyty wielokrotnie do katalitycznej reakcji
d) enzymy zwiększają V reakcji chemicznej
e) enzymy zmieniają równowagę reakcji chemicznej przez obniżenie energii aktywacji
8.Inhibitorem dehydrogenazy bursztynianowej jest
a) kompetycyjnym-malonian
b) niekompetycyjnym-cytrynian
c) kompetycyjnym-bursztynylo CoA
d) nieodwracalnym-kw.acetylosalicylowy
e) akompetycyjnym=kationy litu (Li+)
9.Który z wymienionych typów inhibitorów powinien zmieniać prędkość max reakcji nie zmieniając powinowactwa enzymu wobec substratu:
a) kompetycyjny
b) niekompetycyjny
c) akompetycyjny
d) inhibitor enzymu allosterycznego typu K
e) inhibitor enzymu allosterycznego typu V
Repetycja 1:
1.Które zdanie poprawnie charakteryzuje kod genetyczny:
a) są 64 różne kodony
b) każdy z kodonów oznacza przyłączenie określonego aminokwasu
c) wszystkie kodony występują w cząsteczkach mRNA
d) jest więcej kodonów niż aminokwasów, dlatego kod genetyczny nie jest jednoznaczny
e) jest to kod dwójkowy, gdyż 2 nukleotydy kodują1 aminokwas
2.U Eukariota translacja zaczyna się od specyficznego kodonu.Jaki to kodon i za przyłączenie, którego aminokwasu on odpowiada
a) AUG-Met
b) UAG-Met
c) AUG-Trp
d) ATG-Mat
e) UAG-Ser
3.U Eukariota w czasie replikacji:
a) krótkie odcinki RNA służą jako matryce do syntezy DNA
b) powstaje tylko 1 replisom, gdyż jest jedno miejsce ori
c) powstaje fragment okazaki o wielkości 2000-3000 nukleotydów
d) helikaza oddysocjowuje od DNA natychmiast
e) przynajmniej jedna polimeraza ma aktywność egzonukleazy 3’-5’
4.Transkrypt II klasy może ulegać następującym modyfikacjom:
a) metylacji
b) ADP-rybozylacji
c) Przyłączeniu guanylanu
d) Poliadenylacji
e) Fosforylacji
5.Peptydylotransferaza to aktywność enzymatyczna niezbędna w procesie
a) wycinania intronu z tRNA
b) redagowania mRNA
c) transkrypcji
d) odwrotnej transkrypcji
e) translacji
6.Który z wymienionych procesów zachodzi z wytworzeniem wiązania fosfodiestrowego:
a) przyłączenie guanylanu
b) metylacje
c) wycinanie intronów
d) poliadenylacja
e) deacetylacja
7.Seryna jest przyłączona przez tRNA z antykodonem 5’-ACU-3’ natomiast tryptofan przez tRNA z antykodonem 5’-CCA-3’. Jaka sekwencja nukleotydów w m RNA koduje przyłączenie aminokwasów w kolejności Ser i Trp:
a) 5’-ACUCCA-3’
b) 5’UGGAGU-3’
c) 5’AGUUGG-3’
d) 5’CCAACU-3’
e) 5’AUGUAA-3’
8.Który z podanych motywów występujących w białkach jest charakterystyczny dla struktury czynników transkrypcyjnych:
a) palec cynkowy
b) bateria litowo-jonowa
c) suwak leukocynowy
d) klucz grecki z selenocysteiną
e) hemowo związane żelazo
9.Które z poniższych stwierdzeń jest prawidłowe:
a) metylacja u Eucariota zachodzi głównie na cytochromie w sekwencji nukleotydów CG
b) metylacje DNA zachodzą po, a nie w trakcie syntezy DNA
c) w komórkach eukariotycznych metylacje DNA służą ochronie przed bakteryjnymi enzymami restrykcyjnymi
d) u Eucariotów regiony DNA z aktywnymi transkrypcyjnie genami zawierają zwykle mniej metylowanych zasad
e) Eucariotyczne metylotransferazy przenoszą grupę metylową na cytozynę w cząsteczce histonu H1
10.Który z wymienionych enzymów przeprowadza transkrypcje genów tRNA
a) pol RNA I
b) pol RNA II
c) pol RNA III
d) pol DNAά
e) pol DNAγ
11.Wiązanie łączące zasadę azotową z cukrem w nukleotydzie to wiązanie
a) fosfodiestrowe
b) o-glikozydowe
c) n-glikozydowe
d) amidowe
e) peptydowe
12.Apolipoproteiny B100 i B48 kodowane są przez gen APOB. Powstawanie apolipoproteiny B48 w enterocycie uwarunkowane jest następującą modyfikacją
a) metylacja guaniny w pozycji 7
b) metylacja cytozyny w pozycji 5
c) metylacja adeniny w pozycji 6
d) deaminacja cytozyny
e) deaminacja adeniny
II koło – Aleksandrowicz gr. 6
Napisz wzorami strukturalnymi:
Równanie reakcji katalizowanej przez enzym, którego aktywność jest regulowana przez polimeryzację / depolimeryzację jego cząsteczki. Podaj nazwę i numer klasy enzymu. .(to pytanie było drugiegoo dnia w czerwcu)
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych (zaznacz ewentualny udział koenzymów) :
Równanie reakcji przebiegającej według mechanizmu sekwencyjnego o dowolnej kolejności, katalizowanej przez enzym będący markerem zawału mięśnie sercowego.Podaj nazwę enzymu.
Równanie enzymatycznej reakcji która może być zahamowana przez acetylosalicylan
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
Zależność stężenia produktu od czasu dla reakcji zerowego rzędu katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K zachodzącej a) w nieobecności i b) obecności efektora dodatniego.
Zmiany aktywności kinazy kreatynowej w surowicy krwi w ciągu 5 dni po zawale mięśnia sercowego.
Zależność 1/v od 1/s dla reakcji katalizowanej przez myoinozytolomonofosfatazę, zachodzącej a) w nieobecności i b)obecności Li+
Narysuj schemat (bez wzorów)
7. Ilustrujący mechanizm reakcji katalizowanej przez aminotransferazę alaninową.
Przedstaw obliczenie:
Jaki procent Vmax osiągnie reakcja enzymatyczna przebiegająca według kinetyki michaelisowskiej przy stężeniu substratu równym ¼ Km ?
I koło – Aleksandrowicz gr. 6
Napisz wzorami strukturalnymi:
Dipeptyd (powstały w wyniku hydrolizy glikoproteiny) zbudowany z alaniny i aminokwasu, do którego jest przyłączony wiązaniem N – glikozydowym odpowiedni monosacharyd .(to pytanie było pierwszego dnia w czerwcu)
deoksyadenozynę
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych:
reakcję katalizowaną przez nukleotydylotransferazę tRNA .(to pytanie było drugiego dnia w czerwcu).
reakcję tworzenia pierwszego wiązania fosfodiestrowego w procesiem transkrypcji katalizowanej przez polimerazę RNA II
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
Zależność wysycenia tlenem cząsteczki :a)Hb F i b)Hb A w erytrocytach od pO2.
Zaznacz wartości P50 dla obu Hb. .(to pytanie było drugiego dnia w czerwcu)
Narysuj schemat (bez wzorów)
Ilustrujący regulację translacji przez hem w komórkach erytropoetycznych. .(to pytanie było pierwszego dnia w czerwcu)
Przedstawiający proces naprawy DNA zawierającego 8 – oksogwaninę w swojej cząsteczce. Podaj pełne nazwy odpowiednich enzymów.
Oblicz
Ile miligramów albuminy znajduje się w 300 mikrolitrach surowicy krwi zdrowego dorosłego człowieka?
Podaj zakres normy stężenia albuminy w surowicy krwi
Napisz wzorami strukturalnymi reakcj* :
1. katalizowan* przez dowolny kompleks wieloenzymatyczny (zaznacz symbolami ewentualny udzia* koenzymów). Podaj nazw* tego kompleksu.
Napisz u*ywaj*c symboli lub nazw biochemicznych reakcj* (zaznacz ewentualny udzia* koenzymów):
2. katalizowan* przez enzym, którego Km wyznaczano do*wiadczalnie na *wiczeniach. Podaj nazw* enzymu i klas* do której ten enzym nale*y.
3. katalizowan* przez enzym, którego aktywno** jest regulowana poprzez odwracalne wi*zanie enzymu z b*onami.
Przedstaw graficznie:
4. (na jednym wykresie) zale*no** szybko*ci reakcji od st**enia substratu dla reakcji zachodz*cej a) w temperaturze 25 oC i b) w temperaturze 35oC, katalizowanej przez sercow* dehydrogenaz* mleczanow*.
5. zale*no** odwrotno*ci szybko*ci reakcji od odwrotno*ci st**enia substratu dla enzymu którego indeks kooperatywno*ci wynosi 81.
6. (na jednym wykresie) wykres zale*no*ci szybko*ci reakcji od st**enia substratu dla reakcji, katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K, zachodz*cej a) w nieobecno*ci i b) w obecno*ci efektora dodatniego.
Narysuj schemat :
7. przedstawiaj*cy mechanizm reakcji wedle którego przebiega reakcja katalizowana kinaz* kreatyny.
Sta*a równowagi pewnej reakcji enzymatycznej wynosi 0,8. Jaka b*dzie warto** tej sta*ej gdy podwoimy st**enie enzymu?
Enzymy przyspieszają szybkość reakcji poprzez:
wpływ na zmianę energii swobodnej reakcji
zahamowanie szybkości reakcji przebiegającej w kierunku produkt substrat
zmianę stałej równowagi reakcji
obniżenie energii aktywacji
selektywne przyspieszanie reakcji przebiegającej w kierunku substrat produkt
Przykładem nieodwracalnej regulacji aktywności enzymów jest:
fosforylacja przez kinazy białkowe
allosteryczna regulacja przez substraty
dysocjacja podjednostek enzymów oligomerycznych
hamowanie przez inhibitory kompetycyjne
proteoliza enzymów trawiennych
Stała Michaelisa (Km):
nie ulega zmianie w obecności inhibitora niekompetycyjnego
jest to stężenie substratu przy którym V reakcji = ½ Vmax
jest to punkt przecięcia na osi 1/V w równaniu Lineweavera-Burke’a
jest równa ½ Vmax
jest to stała równowagi reakcji dysocjacji ES E + P
Kaptopril, inhibitor kompetycyjny konwertazy angiotensynogenu, może być wykorzystany jako lek na nadciśnienie. Inhibitory kompetycyjne zmieniają:
Vmax reakcji
Km reakcji
jednocześnie Vmax i Km reakcji
specyficzność substratową enzymu
brak prawidłowej odpowiedzi
Wybierz prawidłowy opis reakcji enzymatycznej:
enzym, który katalizuje reakcję A + B C + D przyspiesza prędkość tej reakcji, ale nie reakcji odwrotnej – C + D A + B
enzym obniża energię aktywacji reakcji, ale nie wpływa na zmianę energii swobodnej (G)
enzym może zmieniać prędkość reakcji nie oddziałując bezpośrednio z substratami
enzymy to głównie białka; koenzymy to małe cząsteczki, które utrzymują strukturę enzymu ale nie są zaangażowane w przebieg reakcji
ponieważ enzymy katalizują reakcje chemiczne w podobny sposób jak katalizatory nieorganiczne, im wyższa jest temperatura reakcji tym większa jest prędkość reakcji
Trawienie węglowodanów jest:
związane ze zwiększonym pobieraniem glicerolu ze światła jelita przez enterocyty
związane ze zwiększaniem osmolalności treści jelitowej
związane ze zmniejszaniem osmolalności treści jelitowej
rozpoczynane przez enzymy wydzielane przez komórki śluzówki żołądka
Laktaza jest produkowana przez komórki śluzówki jelita:
jako indukowany enzym, którego aktywność zależy od stężenia laktozy w pokarmie
produkuje jednakowe ilości galaktozy i fruktozy
produkuje jednakowe ilości glukozy i galaktozy
jest odpowiedzialna za transport produktów trawienia do gruczołów mlecznych
Który z podanych enzymów jest odpowiedzialny za trawienie białek:
trypsynogen
amylaza
fosfolipaza A2
pepsyna
Micelle:
są tym samym co krople po emulsyfikacji pod względem rozmiaru i zawartości
ich tworzenie nie jest zależne od stężenia kwasów żółciowych
nie są związane z absorpcją lipidów
ich tworzenie jest zależne od stężenia kwasów żółciowych
Które ze zdań opisuje cechy enzymu działającego według kinetyki Michaelisa-Menten?
prędkość reakcji enzymatycznej jest równa ½ prędkości maksymalnej gdy 100% cząsteczek enzymu jest wysyconych substratem
prędkość reakcji enzymatycznej jest równa ½ prędkości maksymalnej gdy 50% cząsteczek enzymu jest wysyconych substratem
prędkość reakcji enzymatycznej jest maksymalna gdy 50% cząsteczek enzymu jest wysyconych substratem
prędkość reakcji enzymatycznej jest maksymalna gdy 100% cząsteczek enzymu jest wysyconych substratem
prędkość reakcji jest niezależna od stężenia enzymu
Mutacja w cząsteczce trzustkowej heksokinazy spowodowała spadek wartości Km dla glukozy z 6 mM do 2,2 mM, oraz zmianę wartości Vmax z 93 U/mg białka do 0,2 U/mg białka. Które z podanych zdań najlepiej oddaje porównanie właściwości zmutowanego enzymu z właściwościami enzymu normalnego?
enzym zmutowany wymaga mniejszego stężenia glukozy aby mógł osiągnąć ½ Vmax
enzym zmutowany pracuje szybciej niż normalny w stężeniach glukozy mniejszych niż 2,2 mM
enzym zmutowany pracuje szybciej niż normalny w stężeniach glukozy większych niż 2,2 mM
w stężeniach glukozy bliskich całkowitego wysycenia enzymu potrzeba 90 – 100 razy więcej enzymu niż normalnie do osiągnięcia zwykłej szybkości fosforylacji glukozy
gdy stężenie glukozy wzrasta po posiłku z 5 mM do 10 mM szybkość reakcji katalizowanej przez zmutowany enzym wzrośnie powyżej szybkości reakcji katalizowanej przez normalny enzym
Które ze zdań charakteryzuje większość enzymów allosterycznych?
są zbudowane z jednej podjednostki
w nieobecności efektorów z reguły działają wg kinetyki Michaelisa-Menten
wykazują kooperatywność w wiązaniu substratu
aktywatory allosteryczne mogą wiązać się w ich centrum aktywnym
niektóre z ich allosterycznych inhibitorów mogą się wiązać nieodwracalnie z centrum allosterycznym
Jeśli enzym katalizuje etap ograniczający danego szlaku metabolicznego, prowadzącego do przekształcenia toksycznego metabolitu w celu jego wydalenia z moczem, który z mechanizmów regulacyjnych zapewni najlepszą ochronę organizmu przed toksycznym działaniem tego metabolitu?
produkt szlaku metabolicznego powinien być inhibitorem allosterycznym tego enzymu
produkt szlaku metabolicznego powinien hamować transkrypcję genu tego enzymu
toksyna powinna stymulować transkrypcję genu tego enzymu
enzym powinien mieć wysoką Km dla toksyny
produkt pierwszej reakcji szlaku powinien allosterycznie aktywować następny w kolejności enzym
Mutacja w cząsteczce enzymu prowadząca do niezdolności wiązania koenzymu przenoszącego grupy chemiczne prowadzi do:
braku zdolności wiązania substratu przez enzym
braku zdolności tworzenia prawidłowego stanu przejściowego
wykorzystania przez enzym innego koenzymu
zastąpienia koenzymu przez jeden z aminokwasów położonych w centrum aktywnym enzymu
wykorzystania wolnego koenzymu pod warunkiem, że w diecie znajdzie się odpowiednia ilość jego prekursora
Zaburzenia funkcji trzustki prowadzą do zmniejszonej zdolności do trawienia:
skrobi
laktozy
celulozy
sacharozy
maltozy
Po zjedzeniu kawałka ciasta, które zawiera w składzie mąkę, mleko i sacharozę we krwi pojawia się:
glukoza
fruktoza i galaktoza
galaktoza i glukoza
glukoza, fruktoza i galaktoza
fruktoza i glukoza
Brak zdolności komórek epitelium jelita do produkcji disacharydaz prowadzi do:
obecności maltozy, sacharozy i laktozy w kale
skrobi w kale
galaktozy i fruktozy we krwi
glikogenu w mięśniach
insuliny we krwi
Przy zaburzeniach funkcjonowania w enterocytach systemu transportu specyficznego dla Leu nie obserwuje się niedoboru tego aminokwasu w białku. Jest tak dlatego, że:
leucyna może być syntetyzowana w organizmie
nerka prowadzi reabsorpcję leucyny i wysyła ją do innych tkanek
istnieje kilka systemów transportu mogących przenosić leucynę
izoleucyna zastępuje leucynę w białkach
leucyna nie jest istotnym składnikiem białek
Który z enzymów jest aktywowany na drodze autokatalizy?
enteropeptydaza
trypsynogen
pepsynogen
aminopeptydaza
proelastaza
Współczynnik Q10, opisujący wpływ temperatury na reakcję enzymatyczną oznacza:
ile razy wzrośnie szybkość reakcji jeśli temperatura środowiska wzrośnie 10X
ile razy wzrośnie szybkość reakcji jeśli temperatura środowiska wzrośnie o 10oC
ile wynosi szybkość reakcji w temperaturze środowiska 10oC
ile razy zmaleje szybkość reakcji jeśli temperatura środowiska wzrośnie 10X
ile razy wzrośnie szybkość reakcji jeśli temperatura środowiska spadnie 10X
Wpływ wiązania jednego ligandu na wiązanie cząsteczek innego ligandu to:
kooperatywność dodatnia
antykooperatywność
efekt homotropowy
efekt heterotropowy
kooperatywność ujemna
Enzymy przewodu pokarmowego człowieka nie katalizują reakcji hydrolizy:
skrobi
sacharozy
glikogenu
celulozy
laktozy
Który z wymienionych enzymów nie jest produkowany przez enterocyty:
sacharaza
laktaza
maltaza
amylaza
trehalaza
Każdy z podanych elementów może zostać wyizolowany z wyjątkiem:
wolnego enzymu
kompleksu enzym-substrat
kompleksu enzym-inhibitor
kompleksu enzym-produkt
stanu przejściowego
Forma mięśniowa kinazy kreatynowej to izoenzym:
MB
MM
BB
CK
Który z podanych enzymów występuje w znacznej ilości we krwi w czasie trwania wirusowego zapalenia wątroby?
kinaza kreatynowa
alkaliczna fosfataza
aminotransferaza alaninowa
5’-nukleotydaza
kwaśna fosfataza
Z podanych stwierdzeń na temat micelli mieszanych wybierz stwierdzenie fałszywe:
transportują witaminy rozpuszczalne w tłuszczach
są absorbowane bezpośrednio do układu limfatycznego
zawierają cholesterol
zawierają wolne kwasy tłuszczowe
niepolarne końce lipidów są skierowane do wnętrza micelli
Glukozo-1-fosforan może być przekształcony do glukozo-6-fosforanu w podanych dwóch reakcjach. Jaka jest wartość G0 dla całej przemiany?
Glc-1-P Glc-6-P G0 = -1,7 kcal/mol
Glc-6-P F-6-P G0 = -0,4 kcal/mol
-2,1 kcal/mol
-1,3 kcal/mol
-0,0 kcal/mol
+1,3 kcal/mol
+ 2,1 kcal/mol
Który z podanych mechanizmów nie jest wykorzystany do regulacji aktywności enzymów?
regulacja ilości enzymu
regulacja dostępu substratów do odpowiednich kompartymentów komórkowych
zmiana G0 poprzez zwiększanie lub zmniejszanie stężenia reaktantów
regulacja sprawności katalitycznej enzymu
zmiana stężenia regulatorów allosterycznych
Stała Michaelisa (Km):
jest liczbowo równa ½ Vmax
zależy od stężenia enzymu
jest niezależna od pH
jest liczbowo równa stężeniu substratu, które powoduje przebieg reakcji z prędkością równą ½ prędkości maksymalnej
rośnie w obecności inhibitora niekompetycyjnego
Inhibitor niekompetycyjny:
powoduje wzrost Vmax i wzrost Km reakcji
powoduje spadek Vmax
powoduje spadek Km i Vmax
powoduje wzrost Km bez wpływu na V max
zwiększa stężenie kompleksu ES
Które zdanie jest nieprawdziwe?
reakcje sprzężone to takie, które mają jeden wspólny metabolit
gdy reakcje są sprzężone niektóre z nich mogą być egzoergiczne
reakcje mogą być sprzężone poprzez gradient jonów w poprzek błony
reakcje są sprzężone jeśli produkt jednej reakcji jest substratem w następnej
aby reakcje mogły być sprzężone wszystkie muszą mieć wartości GO < 0
Podaj zdanie prawdziwe na temat trypsyny:
Jest aktywowana przez chymotrypsynę
Aktywuje pepsynogen do pepsyny
Aktywuje inne zymogeny trzustkowe
Aktywuje enteropeptydazę, która aktywuje pozostałe trzustkowe zymogeny
Hamuje ruchy jelit co pozwala na dokładniejsze trawienie białek
Izoenzym kinazy kreatynowej pojawiający się w surowicy krwi po zawale mięśnia sercowego, jest zbudowany z:
dwóch podjednostek M
jednej podjednostki M i jednej B
dwóch podjednostek B
jednej podjednostki B i dwóch M
jednej podjednostki M i dwóch B
Największa aktywność kinazy kreatynowej występuje w:
nerce
mózgu
mięśniu sercowym
mięśniach szkieletowych
wątrobie
Alkaliczna fosfataza jest markerem:
zawału serca
wirusowego zapalenia wątroby
ostrego zapalenia trzustki
chorób kości
choroby Wilsona
Spośród podanych leków będących inhibitorami enzymów, lekiem immunosupresyjnym jest:
kwas mykofenolowy
sildenafil
strofantyna
aspiryna
orlistat
Leki obniżające ciśnienie krwi hamują przekształcenie:
angiotensynogenu w angiotensynę I
angiotensyny I w angiotensynę II
angiotensyny II w angiotensynę III
angiotensyny III w produkty degradacji
Ilość aktywności, która katalizuje przemianę 1 mola substratu w ciągu minuty, w optymalnych warunkach reakcji, przy wysycającym stężeniu substratu to:
jednostka standardowa
aktywność właściwa
aktywność molekularna
stężenie aktywności enzymatycznej
aktywność standardowa
Kwaśne pH środowiska może wpłynąć na reakcję enzymatyczną:
hamując ją poprzez denaturację enzymu
przyspieszając ją, ponieważ powoduje, że tylko grupy karboksylowe w cząsteczce enzymu są zjonizowane
zmieniając stopień jonizacji substratu
przyspieszając ją, ponieważ powoduje, że jednocześnie grupy aminowe i karboksylowe w cząsteczce enzymu są zjonizowane
przyspieszyć ją lub zahamować, zmieniając stopień jonizacji grup aminowych i karboksylowych, przy czym jest to zależne od rodzaju enzymu
DIPF jest inhibitorem:
chymotrypsyny
dehydrogenazy aldehydu-3-fosfoglicerynowego
syntazy ATP
acetylocholinoesterazy
cyklooksygenazy
Do powolnych sposobów regulacji aktywności enzymu zalicza się:
polimeryzację/depolimeryzację
regulację szybkości degradacji enzymu
regulację stabilizacji mRNA
regulację allosteryczną
regulację translacji
Kowalencyjne modyfikacje cząsteczek enzymów to:
prenylacja
regulacja allosteryczna
polimeryzację/depolimeryzację
fosforylacja/defosforylacja
wiązanie z błonami komórkowymi
Współczynnik kooperatywności:
jeśli jest równy jeden to oznacza, że stężenie substratu musi wzrosnąć 81 razy by wysycić enzym z 10 do 90%
jeśli jest równy jeden to oznacza, że stężenie substratu musi wzrosnąć 81 razy by wysycić enzym z 0 do 100%
jeśli jest równy 1 to oznacza, że enzym nie wykazuje kooperatywności
inaczej zwany jest indeksem kooperatywności
jeśli jest mniejszy niż 1 to oznacza, że stężenie substratu musi wzrosnąć 9 razy by wysycić enzym z 10 do 90%
Wchłanianie aminokwasów do wnętrza enterocytów:
wymaga udziału jednego jonu sodowego
wymaga udziału transportera aminokwasu zużywającego ATP
w przypadku aminokwasów hydrofobowych nie wymaga pomocy białek transportujących
wymaga udziału pompy sodowo-potasowej
jest zależne wyłącznie od gradientu stężeń
-glutamylotranspeptydaza bierze udział w transporcie aminokwasów w:
wątrobie
mięśniach
jelicie
neuronach
kanalikach nerkowych
Do transportu aminokwasów w kanalikach nerkowych niezbędny jest udział:
glukagonu
glutationu
glikogenu
glutaminianu
glutaminy
Glicyna jest transportowana do wnętrza enterocytów za pośrednictwem transportera dla aminokwasów:
aromatycznych
obojętnych
kwaśnych
zasadowych
iminokwasów
Wchłanianie glukozy do enterocytów:
zależy od stężenia jonów sodu w tych komórkach;
zachodzi z udziałem przenośnika GLUT-4;
jest kotransportem 1 cząsteczki glukozy i 2 jonów potasu;
jest transportem wtórnie aktywnym.
Enzymy mogą być zbudowane z:
białka
lipidów
węglowodanów
DNA
RNA
W czasie ciężkiego uszkodzenia wątroby we krwi wzrasta gwałtownie (w porównaniu do nieznacznego uszkodzenia) aktywność:
dehydrogenazy glutaminianowej
kinazy kreatynowej
aminotransferazy asparaginianowej
aminotransferazy alaninowej
dehydrogenazy mleczanowej
Izoenzymem dehydrogenazy mleczanowej występującym w mięśniu sercowym jest forma:
A4
B4
H4
M4
H3M
Holoenzym:
jest białkiem prostym
jest białkiem złożonym
to inna nazwa kofaktora
jest zbudowany z kofaktora i apoenzymu
to inaczej apoenzym
Enzymy wielofunkcyjne:
zbudowane są z wielu podjednostek
mogą zawierać dwa lub więcej łańcuchów peptydowych połączonych mostkami S-S
ulegają polimeryzacji i depolimeryzacji
to inaczej tzw. kompleksy wieloenzymowe
zawierają kilka centrów aktywnych
Wiązania powstające pomiędzy enzymem a substratem to wiązania:
elektrostatyczne
wodorowe
van der Waalsa
hydrofobowe
kowalencyjne
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
reakcję katalizowaną przez enzym klasy I.
trójpeptyd uczestniczący w transporcie aminokwasów ze światła jelita do enterocytów.
reakcję katalizowaną przez enzym klasy IV.
reakcję katalizowaną przez dowolny kompleks wieloenzymowy, podaj nazwy uczestniczących koenzymów.
reakcję katalizowaną przez enzym nabłonka jelitowego biorący udział w końcowym etapie trawienia skrobi.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
1. katalizowaną przez enzym będący markerem zawału mięśnia sercowego.
2. enzymatyczną przebiegającą według mechanizmu sekwencyjnego uporządkowanego.
3. enzymatyczną zachodzącą z udziałem koenzymu będącego pochodną witaminy B12.
4. reakcję hamowaną przez metotreksat.
5. kinazy dehydrogenazy pirogronianowej.
Wymień:
1. trzy leki, których działanie polega na hamowaniu aktywności enzymów, podaj jakie enzymy hamują.
2. enzymy będące markerami ciężkiego uszkodzenia wątroby.
3. trzy enzymy aktywowane przez nieodwracalną modyfikację proteolityczną.
4. mechanizmy przebiegu reakcji enzymatycznych, podaj po jednym przykładzie enzymu.
5. po jednym inhibitorze: cyklooksygenazy, konwertazy, fosfodiesterazy cGMP.
6. trzy możliwe sposoby regulacji aktywności enzymu polegające na zmianie ilości jego cząsteczek.
7. podstawowe mechanizmy regulujące w szybki sposób aktywność enzymów.
8. trzy enzymy ściany jelita trawiące cukry.
Przedstaw graficznie:
1. wykres zależności v / [s] dla enzymów wykazujących wartość współczynnika Hilla 1< i 1>.
2. wykres zależności v / [s] przedstawiający regulację aktywności karboksylazy acetyloCoA w obecności i nieobecności cytrynianu.
3. na wykresie Lineweavera-Burke’a jak zmieni się Km i Vmax enzymu po dodaniu do mieszaniny reakcyjnej substancji, która wiąże się z wolnym enzymem lub kompleksem enzym-substrat i zapobiega utworzeniu produktu.
4. zależność 1/v od 1/[s] dla enzymu allosterycznego typu V: a) w nieobecności efektorów; b) w obecności aktywatora; c) w obecności inhibitora.
5. profil zmian stężenia aktywności aminotransferazy asparaginianowej w osoczu krwi chorego w czasie pięciu dni od wystąpienia zawału mięśnia sercowego.
6. na wykresie zależność v od [s] dla reakcji katalizowanej przez dehydrogenazę bursztynianową inkubowaną z malonianem oraz inkubowaną z jonami rtęci.
7. wykres zależności v od [s] dla reakcji katalizowanej przez enzym wykazujący kooperatywność dodatnią w nieobecności efektorów oraz w obecności efektora ujemnego i efektora dodatniego.
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
1. wyjaśniający działanie streptokinazy jako leku, zaznacz skutki działania zbyt dużej dawki.
2. reakcji enzymatycznej typu ping-pong.
3. ilustrujący transport glukozy ze światła jelita do wnętrza enterocyta.
4. ilustrujący działanie kolipazy.
5. ilustrujący działanie -glutamylotranspeptydazy w transporcie aminokwasów do komórek.
Oblicz:
1. ile nanomoli sacharozy uległo rozłożeniu przez 1 ml roztworu sacharazy w ciągu 3 minut, jeśli stężenie aktywności enzymatycznej tego roztworu wynosiło 9 jednostek enzymatycznych na 1 l, oraz przyjmując, że reakcja przebiegała według kinetyki zerowego rzędu.
ile milimoli produktu powstanie w czasie 15 sekund reakcji katalizowanej przez 5 mg enzymu o aktywności specyficznej 8 mikromoli/min./mg białka.
WTOREK 15:00
Napisz wzorami strukturalnymi:
reakcję katalizowaną przez enzym należący do klasy I, którego izoforma sercowa jest hamowana nadmiarem substratu.
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych (zaznacz ewentualny udział koenzymów)
równanie reakcji katalizowanej przez enzym, którego Km wyznaczano doświadczalnie na ćwiczeniach. Podaj nazwę enzymu i zaznacz do której klasy enzymów należy.
równanie reakcji przebiegającej według mechanizmu sekwencyjnego o dowolnej kolejności, katalizowanej przez enzym będący markerem zawału mięśnia sercowego. Podaj nazwę enzymu.
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
zależność stężenia produktu od czasu dla reakcji zerowego rzędu katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K zachodzącej a) w nieobecności i b) w obecności efektora ujemnego.
zależność 1/v od 1/[s] dla reakcji katalizowanej przez enzym allosteryczny wykazujący dodatni efekt kooperatywny, zachodzącej w obecności nadmiaru efektora dodatniego
zależność v od [s] dla reakcji enzymatycznej katalizowanej przez cyklooksygenazę, zachodzącej a) przed preinkubacją i b) po preinkubacji z kwasem acetylosalicylowym
Zadanie
Jaka była aktywność właściwa enzymu (jednostki/mg białka), jeżeli enzym zawarty w 2 ml roztworu w czasie 2 minut przekształcał 20 mikromoli substratu, wiedząc że 1 ml tego roztworu zawierał 100 mikrogramów białka.
Czy aktywność molekularna enzymu:
mówi nam o powinowactwie substratu do enzymu
ma związek z prędkością maksymalną enzymu
określa sprawność katalityczną enzymu
jest równa Km dla danego enzymu
zmniejsza się w obecności inhibitora niekompetycyjnego
Ilość jednostek standartowych aktywności enzymatycznej znajdująca się w 1 ml roztworu (J lub U):
mówi nam ile mikromoli substratu do produktu może zostać przetworzone przez enzym w ciągu 1 sekundy
mówi nam ile mikromoli substratu do produktu może zostać przetworzone przez enzym w ciągu 1 minuty
jest również miarą aktywności enzymatycznej
sama w sobie nie mówi o czystości enzymu
gdy znamy również ilość białka w roztworze mówi nam o czystości enzymu.
Na wyniku badania laboratoryjnego enzymów surowicy krwi lekarz otrzymuje informacje o:
stężeniu aktywności enzymatycznej badanych enzymów
Km badanych enzymów
Ki badanych enzymów
ilość jednostek enzymatycznych badanych enzymów zawartych w jednostce objętości
aktywności molekularnej badanych enzymów
Efektory allosteryczne:
w enzymach typu K zmieniają Vmax
w enzymach typu K zmieniają S0,5
w enzymach typu V wpływają na aktywność molekularną
w enzymach typu V wpływają na Km
w enzymach typu K na ogół wpływają na ich kooperatywność
Stężenie aktywności enzymatycznej wyznaczamy:
w warunkach kinetyki I rzędu
w warunkach kinetyki I rzędu gdy nie nagromadziły się jeszcze produkty reakcji
w warunkach pełnego wysycenia enzymu substratem lub substratami
w warunkach kinetyki 0 rzędu
w stężeniu substratów znacznie poniżej wartości Km
Dehydrogenaza mleczanowa:
posiada kilka izoenzymów
jest białkiem monomerycznym
może być tetramerem zbudowanym z jednakowych podjednostek
zawsze jest tetramerem zbudowanym z dwóch różnych typów podjednostek
jej izoenzymy posiadają odmienne właściwości kinetyczne
Aspiryna jest stosowana jako lek przeciwzapalny gdyż:
jest odwracalnym inhibitorem cyklooksygenazy
jest nieodwracalnym inhibitorem cyklooksygenazy
hamuje aktywność reduktaz HMG-CoA
powoduje acetylację grupy OH seryny w cyklooksygonazie
stymuluje produkcje prostaglandyn i leukotrienów
Czy prawdą jest, że
dehydrogenaza mleczanowa w sercu jest zbudowana z czterech jednakowych podjednostek
dehydrogenaza pirogronianowa jest kompleksem enzymatycznym
syntaza kwasów tłuszczowych jest monomerem posiadającym jeden rodzaj aktywności
enzym dostarczający 2,3-bisfosfoglicerynianu w krwinkach czerwonych jest enzymem wielofunkcyjnym
pirofosforan tiaminy jest koenzymem dehydrogenazy pirogronianowej
Czy prawdą jest, że:
enzymy katalizujące utlenianie alkoholi do aldehydów to oksydoreduktazy
nazwa syntaza oznacza to samo co syntetaza
fumaraza to przykład izomerazy
liazy katalizują hydrolityczny rozpad wiązań estrowych
za syntezę aminoacylo-tRNA odpowiedzialne są enzymy z klasy transferaz
Wtorek 15:00 R2/2004-11-30
Napisz wzorami strukturalnymi :
Równanie reakcji katalizowanej przez enzym, którego aktywność jest regulowana przez polimeryzację/ depolimeryzację jego cząsteczki. Podaj nazwę enzymu i numer klasy enzymu.
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
Równanie reakcji przebiegającej według mechanizmu sekwencyjnego o dowolnej kolejności, katalizowanej przez enzym będący markerem zawału mięśnia sercowego. Podaj nazwę enzymu.
Równanie enzymatycznej reakcji która może być zahamowana przez acetylosalicylan . Podaj nazwę enzymu i aktywności enzymatycznej która jest hamowana.
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
Zależność stężenia produktu od czasu dla reakcji zerowego rzędu katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K zachodzącej a) w nieobecności i b) w obecnosci efektora dodatniego.
Zmiany aktywności kinazy kreatynowej w surowicy krwi w ciągu 5 dni po zawale mięśnia sercowego.
Zależność 1/v od 1/[s] dla rekcji katalizowanej przez myoinozytolomonofosfatazę, zachodzącej a) w nieobecności i b) w obecności Li+.
Narysuj schemat :
Ilustrujący mechanizm reakcji katalizowanej przez aminotransferazę alaninową.
8. Jaki procent Vmax osiągnie reakcja enzymatyczna przebiegająca według kinetyki michaelisowskiej przy stężeniu substratu równym ¼ Km ?
.
Rep 2 – test 2004
Nazwisko i Imię
Prawidłową odpowiedź zaznacz w kółku
1. Inhibitor niekompetycyjny:
A. nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i nie zmienia maksymalnej szybkości reakcji enzymatycznej
B. nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i podwyższa maksymalną szybkość reakcji enzymatycznej
C. podwyższa wartość stałej Michaelisa i nie zmienia maksymalnej szybkości reakcji enzymatycznej
D. obniżą wartość stałej Michaelisa i podwyższa maksymalną szybkość reakcji enzymatycznej
E. nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i obniża maksymalną szybkość reakcji
2. Szybkość reakcji enzymatycznej jest proporcjonalna do stężenia enzymu (człowieka) gdy:
A. enzym jest całkowicie wysycony koenzymem lub aktywatorem
B. gdy reakcja zachodzi w temperaturze 37o przy ciśnieniu 1 atm
C. zwiększenie stężenia substratu lub inych reaktantów nie zwiększa szybkości reakcji
D. enzym znajduje się w jego natywnym środowisku, wewnątrz komórki
E. reakcja zachodzi w obecności efektorów allosterycznych
3. Enzym katalizujący reakcję połączenia dwóch związków chemicznych z wykorzystaniem ATP jako dawcy energii nosi nazwę:
A. holoenzym
B. izoenzym
C. liaza
D. ligaza
E. transferaza
.
4. I zoenzym B4 (H4) dehydrogenazy mleczanowej (metabolizujący pirogronian):
A. jest enzymem allosterycznym
B. jego aktywność w komórce jest hamowana produktem reakcji
C. jego aktywność w komórce jest hamowana substratem reakcji
D. jego aktywność maleje w osoczu w zawale mięśnia sercowego
E. jest oksydazą
5. Nazwą klasy enzymów (wg I.U.B.) jest:
A. Dehydrogenazy
B. Oksydazy
C. Kinazy
D. Liazy
E. Izoenzymy
6. Nazwę „izoenzymy” stosuje się do białek posiadających taką samą aktywność enzymatyczną. Nazwa ta dotyczy:
A. wszystkich enzymów alosterycznych występujących w formie R lub T
B. wszystkich enzymów powstałych z proenzymów
C. wszystkich enzymów występujących w formie ufosforylowanej i defosforylowanej
D. enzymów będących heteropolimerami co najmniej dwu polipeptydów związanych niekowalencyjnie
E. enzymów występujących w formie apo-enzymów i holoenzymów.
Czwartek 8:00 R2/2004-12-02
Napisz wzorami strukturalnymi reakcję :
1. katalizowaną przez dowolny kompleks wieloenzymatyczny (zaznacz symbolami ewentualny udział koenzymów). Podaj nazwę tego kompleksu.
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
2. katalizowaną przez enzym, którego Km wyznaczano doświadczalnie na ćwiczeniach. Podaj nazwę enzymu i klasę do której ten enzym należy.
3. katalizowaną przez enzym, którego aktywność jest regulowana poprzez odwracalne wiązanie enzymu z błonami.
Przedstaw graficznie:
4. (na jednym wykresie) zależność szybkości reakcji od stężenia substratu dla reakcji zachodzącej a) w temperaturze 25 oC i b) w temperaturze 35oC, katalizowanej przez sercową dehydrogenazę mleczanową.
5. zależność odwrotności szybkości reakcji od odwrotności stężenia substratu dla enzymu którego indeks kooperatywności wynosi 81.
6. (na jednym wykresie) wykres zależności szybkości reakcji od stężenia substratu dla reakcji, katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K, zachodzącej a) w nieobecności i b) w obecności efektora dodatniego.
Narysuj schemat :
7. przedstawiający mechanizm reakcji wedle którego przebiega reakcja katalizowana kinazę kreatyny.
8. Stała równowagi pewnej reakcji enzymatycznej wynosi 0,8. Jaka będzie wartość tej stałej gdy podwoimy stężenie enzymu?
Rep 2 – test 2004 Nazwisko i Imię
Prawidłową odpowiedź zaznacz w kółku
1. W warunkach fizjologicznych, który z wymienionych procesów nie jest istotny w regulacji aktywności enzymów :
A. Fosforylacja
B. Adenylacja
C. Zmiany temperatury
D. Regulacja aloosteryczna
E. Modyfikacje proteolityczne enzymów
2. Inhibitor akompetycyjny:
A. obniża wartość stałej Michaelisa i podwyższa maksymalną szybkość reakcji enzymatycznej
B. nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i podwyższa maksymalną szybkość reakcji enzymatycznej
C. podwyższa wartość stałej Michaelisa i nie zmienia maksymalnej szybkości reakcji enzymatycznej
D. obniża wartość stałej Michaelisa i obniża maksymalną szybkość reakcji
E. nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i obniża maksymalną szybkość reakcji
3. Syntaza kwasów tłuszczowych w komórkach człowieka :
A. jest kompleksem wieloenzymowym
B. jest polipeptydem wieloenzymowym
C. należy do klasy ligaz
D. jest apoenzymem
E. wszystkie twierdzenia są prawdziwe
4. Enzym katalizujący reakcję z udziałem ATP jako dawcą fosforanu nosi nazwę:
A. hydrolaza
B. ATPaza
C. liaza
D. ligaza
E. transferaza
5. Do enzymów trawiennych określanych mianem esteraz trzustkowych należy:
A. Fosfolipaza A
B. Chymotrypsyna A
C. Amylaza
D. Lipaza monoacyloglicerolowa
E. Rybonukleaza
6. Nazwą klasy enzymów (wg I.U.B.) nie jest nazwa:
A. oksydoreduktazy
B. ligazy
C. transferazy
D. hydroksylazy
E. liazy
Napisz wzorami strukturalnymi:
1. Dipeptyd (powstały w wyniku hydrolizy glikoproteiny) zbudowany z alaniny i aminokwasu, do którego jest przyłączony wiązaniem N-glikozydowym odpowiedni monosacharyd.
2. Deoksyadenozynę
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych:
3. reakcję katalizowaną przez nukleotydylotransferazę tRNA.
4. reakcję tworzenia pierwszego wiązania fosfodiestrowego w procesie transkrypcji katalizowanej przez polimerazę RNA II.
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
5. Zależność wysycenia tlenem cząsteczki: a) HbF i b) HbA w erytrocytach od pO2. Zaznacz wartości P50 dla obu Hb.
Narysuj schemat (bez wzorów)
6. Ilustrujący regulację translacji przez hem w komórkach erytropoetycznych.
7. Przedstawiający proces naprawy DNA zawierającego 8-oksogwaninę w swojej cząsteczce. Podaj pełne nazwy odpowiednich enzymów.
Oblicz
8. Ile miligramów albuminy znajduje się w 300 mikromolach surowicy krwi zdrowego dorosłego człowieka? Podaj zakres normy stężenia albuminy w surowicy krwi.
Napisz wzorami strukturalnymi reakcj* :
1.
katalizowan* przez
dowolny kompleks wieloenzymatyczny (zaznacz symbolami ewentualny
udzia* koenzymów). Podaj nazw* tego kompleksu.
Napisz
u*ywaj*c symboli lub nazw biochemicznych reakcj* (zaznacz
ewentualny udzia* koenzymów):
2. katalizowan* przez enzym, którego Km wyznaczano do*wiadczalnie na *wiczeniach. Podaj nazw* enzymu i klas* do której ten enzym nale*y.
3.
katalizowan* przez
enzym, którego aktywno** jest regulowana poprzez odwracalne wi*zanie
enzymu z b*onami.
Przedstaw
graficznie:
4. (na jednym wykresie) zale*no** szybko*ci reakcji od st**enia substratu dla reakcji zachodz*cej a) w temperaturze 25 oC i b) w temperaturze 35oC, katalizowanej przez sercow* dehydrogenaz* mleczanow*.
5. zale*no** odwrotno*ci szybko*ci reakcji od odwrotno*ci st**enia substratu dla enzymu którego indeks kooperatywno*ci wynosi 81.
6.
(na jednym wykresie) wykres
zale*no*ci szybko*ci reakcji od st**enia substratu dla reakcji,
katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K, zachodz*cej a) w
nieobecno*ci i b) w obecno*ci efektora dodatniego.
Narysuj
schemat :
7.
przedstawiaj*cy
mechanizm reakcji wedle którego przebiega reakcja katalizowana
kinaz* kreatyny.
Przedstaw obliczenie:
8.
Sta*a równowagi
pewnej reakcji enzymatycznej wynosi 0,8. Jaka b*dzie warto** tej
sta*ej gdy podwoimy st**enie enzymu?
Napisz wzorami strukturalnymi:
reakcj* katalizowan* przez enzym nale**cy do klasy I, którego izoforma sercowa jest hamowana nadmiarem substratu.
Napisz u*ywaj*c symboli lub nazw biochemicznych (zaznacz ewentualny udzia* koenzymów)
równanie reakcji katalizowanej przez enzym, którego Km wyznaczano do*wiadczalnie na *wiczeniach. Podaj nazw* enzymu i zaznacz do której klasy enzymów nale*y.
równanie reakcji przebiegaj*cej wed*ug mechanizmu sekwencyjnego o dowolnej kolejno*ci, katalizowanej przez enzym b*d*cy markerem zawa*u mi**nia sercowego. Podaj nazw* enzymu.
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
zale*no** st**enia produktu od czasu dla reakcji zerowego rz*du katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K zachodz*cej a) w nieobecno*ci i b) w obecno*ci efektora ujemnego.
zale*no** 1/v od 1/[s] dla reakcji katalizowanej przez enzym allosteryczny wykazuj*cy dodatni efekt kooperatywny, zachodz*cej w obecno*ci nadmiaru efektora dodatniego
zale*no** v od [s] dla reakcji enzymatycznej katalizowanej przez cyklooksygenaz*, zachodz*cej a) przed preinkubacj* i b) po preinkubacji z kwasem acetylosalicylowym
Zadanie
Jaka by*a aktywno** w*a*ciwa enzymu (jednostki/mg bia*ka), je*eli enzym zawarty w 2 ml roztworu w czasie 2 minut przekszta*ca* 20 mikromoli substratu, wiedz*c *e 1 ml tego roztworu zawiera* 100 mikrogramów bia*ka.
Napisz wzorami strukturalnymi:
1. Równanie reakcji katalizowanej przez enzym, którego aktywność jest regulowana przez polimeryzację/ depolimeryzację jego cząsteczki. Podaj nazwę enzymu.
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
2. Równanie reakcji katalizowanej według mechanizmu sekwencyjnego o dowolnej kolejności, katalizowanej przez enzym będący markerem zwału mięśnia sercowego. Podaj nazwę enzymu.
Równanie enzymatycznej reakcji, która może być zahamowana przez acetylosalicylan. Podaj nazwę enzymu i aktywności enzymatycznej, która jest hamowana.
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
4. Zależność stężenia produktu od czasu reakcji dla reakcji zerowego rzędu katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K zachodzącej a) w nieobecności i b) w obecności efektora dodatniego.
Zmiany aktywności kinazy kreatynowej w surowicy krwi w ciągu 5 dni po zawale mięśnia sercowego.
Zależność 1/v od 1/[s] dla reakcji katalizowanej przez myoinozytolomonofosfatazę, zachodzącej a) w nieobecności i b) w obecności Li+
Przedstaw schemat:
Ilustrujący mechanizm reakcji katalizowanej przez aminotransferazę alaninową
Przedstaw obliczenie:
Jaki procent Vmax osiągnie reakcja enzymatyczna przebiegająca według kinetyki michaelisowskiej przy stężeniu substratu równym ¼ Km
>
1. Endonukleaza
> - enzym ktory hydrolizuje wiaz
fosfodiestrowe wewnatrz kwasu nukleinowego
> 2. Ktory z
procesow wiaze sie z hydroliza wiazania w aatRNA
> -
translacja
> 3. Ktore zdania sa prawdziwe:
> - u
eukariota regiony DNA z aktywnymi transkrypcyjnie genami
zawieraja
zwykle mneij metylowanych zasad
> - metylacje
DNA zachodz po a nei w trakcie syntezy DNA
> 4 Cechy
polimerazy delta
> - ma aktywnosc egzonukleazy 3-5 wysoka
procesywnosc brak aktywnosci
prymazy
> 5. Ktory z
podanych motywow wystepuje w bialkach i jest charakterystyczny
dla
struktury czynnikow transkrypcyjnych?
> - palec cynkowy
>
- suwak leucynowy
> 6. Transkrypt klasy 2. moze ulegac
modyfikacjom:
> - przylaczanie guanylanu
> -
metylacja
> 7. Ktory z nastepujacych enzymow katalizuje
powstawanie wiaz
fosfodiestrowego?
> - polimeraza DNA
alfa
> 8. Ktora z wymienionych sekw nukleotydow jest
komplementarna do fragm nici
DNA: GATGCA:
> - TGCATC
>
9. Degeneracja kodu genetycznego uwarunkowana jest
> -
wystepowaniem wiecej niz 1 kodonu okreslajacego przylaczenia jednego
aa
> 10. Jednym z pierwszych etapow replikacji jest:
>
- rozwijanie nici DNA w celu uwidocznienia zasad azotowych
1.Które
sekwencje DNA nie mogą być cięte enzymami restrykcyjnymi uzywanymi
na
ćwiczeniach:
A.GGTACC/CCATGG
B.GCCGGC/CGGCCG
C.GGTTGG/CCAAGG
D.TAGCTAGC/ATCGATCG
2.
Fragmenty Okazaki
A. Powstają przez hydrolizę DNA przez RNAzę
H1
B. Są syntetyzowane przez polimerze delta
C. Są
syntetyzowane 3’-->5’
D. Prawidłowe A i
B
3. Białka szoku termicznego:
A. Tworzą prawidłowa
strukturę białka
B. Degradują Białka o nieprawidłowej
strukturze przestrzennej
C. Zwiększają temperaturę ciała
D.
Destabilizują strukturę białka
4.2,3 BPG:
A. Zwiększa
powinowactwo tlenu do hemoglobiny i ułatwia pobieranie tlenu z
płuc
B. Zwiększa powinowactwo tlenu do hemoglobiny i ułatwia
oddawanie tlenu w tkankach
C. Zmniejsza powinowactwo tlenu do
hemoglobiny i ułatwia pobieranie tlenu z płuc
D. Zmniejsza
powinowactwo tlenu do hemoglobiny i ułatwia oddawanie tlenu w
tkankach
5.Czynniki białkowe inicjujące translację
rozpoznają:
A. podjednostkę rybosomu, mRNA, Aa tRNA
B.
podjednostkę rybosomu, metionylo-t RNA
C. podjednostkę
rybosomy, mRNA, metionylo tRNA
6. Do kotranslacyjnego
transportu przez błony potrzeba :
A. GTP, receptor SRP, SRP,
receptor rybosomu
B. eIF2, receptorSRP, SRP, peptydaza
sygnałowa
C. SRP, receptor rybosomy, peptydaza sygnałowa
D,
GTP, peptydaza sygnałowa
7. Do naprawy krótkiej łatki
potrzeba:
A. glikozydazy, FEN1, polimeraza beta
B.
Polimeraza beta o aktywności RPAzy, polimeraza delta
C.
Polimeraza beta o aktywności RPAzy, polimeraza beta
D.
Polimeraza beta o aktywności RPAzy, polimeraza beta, RNAzaH1
8.
Redagowanie polega na:
A. Wycinaniu intronów
B. delecji,
insercji
C. ochronie RNA przed nukleazami
D. Zachodzi
podczas transkrypcji
9. Aby wyizolować DNA z pełnej krwi
szczura należy kolejno:
1. Które stwierdzenie dotyczące glikoprotein jest prawdziwe?
a. Glikoproteiny zawierają oligosacharydy związane z resztami lizyny lub histydyny.
b. Glikoproteiny zawierają oligosacharydy związane z resztami seryny, treoniny lub asparaginy.
c. Glikoproteiny zawierają łańcuch oligosacharydowy zakończony resztami glukoz.
d. Glikoproteiny wiążą się na powierzchni komórek wątrobowych z receptorami, które rozpoznają reszty kwasu sjalowego.
e. Glikoproteiny znajdują się głównie z cytozolu komórek.
2. Dwie lipoproteiny, Apo B100 i Apo B48, są kodowane przez ten sam gen, ale są produkowane w dwóch różnych tkankach. Który z wymienionych procesów jest odpowiedzialny za produkcję dwóch różnych białek w tych tkankach?
a. Alternatywne składanie (splicing) RNA w wyniku którego powstają odpowiednie m RNA z różną kombinacją eksonów
b. Różne modyfikacje post-translacyjne
c. Redagowanie RNA w enterocytach
d. Redagowanie RNA w wątrobie i enterocytach
e. Użycie różnych promotorów w tych dwóch tkankach
3. Zastąpienie trzeciej zasady w kodonach
a. Powoduje najczęściej przedwczesne zakończenie syntezy białka
b. Zwykle nie zmienia aminokwasu w tej pozycji białka
c. Powoduje zastąpienie aminokwasu polarnego aminokwasem hydrofobowym
d. Często prowadzi do zmiany struktury przestrzennej białka
e. Prowadzi zwykle do produkcji większych białek
4. Które z poniższych twierdzeń dotyczące DNA jest nieprawdziwe?
a. Łańcuchy w podwójnej helisie są antyrównoległe
b. Liczba adenozyn równa się liczbie tymin
c. Najczęściej DNA występuje w formie B, ale występuje również w formie Z
d. Im więcej par GC tym wyższa temperatura jest wymagana do denaturacji
e. DNA jądrowy jest zwykle kołowy
5. Które z poniższych twierdzeń dotyczące mRNA jest nieprawdziwe?
a. „Ogon poliadenylowy” jest tworzony przy udziale specjalnego enzymu
b. ogon poliadenylowy stabilizuje cząsteczkę RNA
c. najczęściej ogon poliadenylowy znajduje się na końcu 5’
d. zwykle ogon poliadenylowy jest skracany w cytozolu
6. Jeżeli kodonem dla Leu jest CUU, który z następujących antykodonów jest najbardziej prawdopodobny?
a. GAU
b. GAA
c. GTT
d. GCC
e. AGG
1.Które zdanie poprawnie charakteryzuje kod genetyczny:
a) są 64 różne kodony
b) każdy z kodonów oznacza przyłączenie określonego aminokwasu
c) wszystkie kodony występują w cząsteczkach mRNA
d) jest więcej kodonów niż aminokwasów, dlatego kod genetyczny nie jest jednoznaczny
e) jest to kod dwójkowy, gdyż 2 nukleotydy kodują1 aminokwas
2.U Eukariota translacja zaczyna się od specyficznego kodonu.Jaki to kodon i za przyłączenie, którego aminokwasu on odpowiada
a) AUG-Met
b) UAG-Met
c) AUG-Trp
d) ATG-Mat
e) UAG-Ser
3.U Eukariota w czasie replikacji:
a) krótkie odcinki RNA służą jako matryce do syntezy DNA
b) powstaje tylko 1 replisom, gdyż jest jedno miejsce ori
c) powstaje fragment okazaki o wielkości 2000-3000 nukleotydów
d) helikaza oddysocjowuje od DNA natychmiast
e) przynajmniej jedna polimeraza ma aktywność egzonukleazy 3’-5’
4.Transkrypt II klasy może ulegać następującym modyfikacjom:
a) metylacji
b) ADP-rybozylacji
c) Przyłączeniu guanylanu
d) Poliadenylacji
e) Fosforylacji
5.Peptydylotransferaza to aktywność enzymatyczna niezbędna w procesie
a) wycinania intronu z tRNA
b) redagowania mRNA
c) transkrypcji
d) odwrotnej transkrypcji
e) translacji
6.Który z wymienionych procesów zachodzi z wytworzeniem wiązania fosfodiestrowego:
a) przyłączenie guanylanu
b) metylacje
c) wycinanie intronów
d) poliadenylacja
e) deacetylacja
7.Seryna jest przyłączona przez tRNA z antykodonem 5’-ACU-3’ natomiast tryptofan przez tRNA z antykodonem 5’-CCA-3’. Jaka sekwencja nukleotydów w m RNA koduje przyłączenie aminokwasów w kolejności Ser i Trp:
a) 5’-ACUCCA-3’
b) 5’UGGAGU-3’
c) 5’AGUUGG-3’
d) 5’CCAACU-3’
e) 5’AUGUAA-3’
8.Który z podanych motywów występujących w białkach jest charakterystyczny dla struktury czynników transkrypcyjnych:
a) palec cynkowy
b) bateria litowo-jonowa
c) suwak leukocynowy
d) klucz grecki z selenocysteiną
e) hemowo związane żelazo
9.Które z poniższych stwierdzeń jest prawidłowe:
a) metylacja u Eucariota zachodzi głównie na cytochromie w sekwencji nukleotydów CG
b) metylacje DNA zachodzą po, a nie w trakcie syntezy DNA
c) w komórkach eukariotycznych metylacje DNA służą ochronie przed bakteryjnymi enzymami restrykcyjnymi
d) u Eucariotów regiony DNA z aktywnymi transkrypcyjnie genami zawierają zwykle mniej metylowanych zasad
e) Eucariotyczne metylotransferazy przenoszą grupę metylową na cytozynę w cząsteczce histonu H1
10.Który z wymienionych enzymów przeprowadza transkrypcje genów tRNA
a) pol RNA I
b) pol RNA II
c) pol RNA III
d) pol DNAά
e) pol DNAγ
11.Wiązanie łączące zasadę azotową z cukrem w nukleotydzie to wiązanie
a) fosfodiestrowe
b) o-glikozydowe
c) n-glikozydowe
d) amidowe
e) peptydowe
12.Apolipoproteiny B100 i B48 kodowane są przez gen APOB. Powstawanie apolipoproteiny B48 w enterocycie uwarunkowane jest następującą modyfikacją
a) metylacja guaniny w pozycji 7
b) metylacja cytozyny w pozycji 5
c) metylacja adeniny w pozycji 6
d) deaminacja cytozyny
e) deaminacja adeniny
1.Po
dodaniu Hg do mieszniny reakcyjnen z dehydrogenaza bursztynianowa
>
- spada V max Km bez zmian
> 2. inhibitorem
inozytolo-1-monofosfatazy jest:
> - akompetycyjnym-joni Li
>
3. Do hydrolaz naleza:
> - deaminazy, peptydazy, fosfatazy,
nukleazy, fosfolipazy, esterazy
> 4. PLP jest niezbedny w
reakcjach katalizowanych przez:
> - aminotransferazy
>
5. W mm glukozo-6-fosforan moze byc substratem dla enzymow:
>
- DH glukozo-6-fosforanowa, izomeraza glukozofosforanowa,
fosfoglukomutaza
> 6. Enzym ktorego aktywnosc jest regulowana
przez polimeryzacje i
depolimeryzacje jest:> - ACC
>
7. Do enzymow wielofunkcyjnych naleza:
> - syntaza kwasow tl,
syntaza prostaglandynowa, fosfofruktokinaza2
> 8. Enzym to:
>
- czasteczka ktora obniza energie aktywacji rcji chemicznej
>
9. Ktora cecha okresla poprawnei enzym allosteryczny?
> -
jego aktywnosc moze byc regulowana przez czasteczke przylaczona
w
miejscu innym niz centrum katalityczne
Inhibitor niekompetycyjny:
Nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i nie zmienia maksymalnej szybkości reakcji enzymatycznej
Nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i podwyższa maksymalną szybkość reakcji enzymatycznej
Podwyższa wartość stałej Michaelisa i nie zmienia maksymalnej szybkości reakcji enzymatycznej
Obniża wartość stałej Michaelisa i podwyższa maksymalną szybkość reakcji enzymatycznej
Nie ma wpływu na wartość stałej Michaelisa i obniża maksymalną prędkość reakcji
Szybkość reakcji enzymatycznej jest proporcjonalna do stężenia enzymu (człowieka) gdy:
Enzym jest całkowicie wysycony koenzymem lub aktywatorem
b. Gdy reakcja zachodzi w temperaturze 37° przy ciśnieniu 1 atm.
c. Zwiększenie stężenia substratu lub innych reaktantów nie zwiękasza szybkości reakcji
d. Enzym znajduje się w jego natywnym środowisku, wewnątrz komórki
e. Reakcja zachodzi w obecności efektorów allosterycznych
Enzym katalizujący reakcję połączenia dwóch związków chemicznych z wykorzystaniem ATP jako dawcy energii nosi nazwę:
Holoenzym
Izoenzym
Liaza
Ligaza
Transferaza
Izoenzym B4 (H4) dehydrogenazy mleczanowej (metabolizujący pirogronian):
Jest enzymem allosterycznym
Jego aktywność w komórce jest hamowana produktem reakcji
Jego aktywność w komórce jest hamowana substratem reakcji
Jego aktywność maleje w osoczu w zawale mięśnia sercowego
Jest oksydazą
Nazwą klasy enzymów (wg. I.U.B.) jest:
Dehydrogenazy
Oksydazy
Kinazy
Liazy
Izoenzymy
Nazwę „izoenzymy” stosuje się do białek posiadających taką samą aktywność enzymatyczną. Nazwa ta dotyczy:
Wszystkich enzymów allosterycznych występujących w formie R lub T
Wszystkich enzymów powstałych z proenzymów
Wszystkich enzymów występujących w formie ufosforylowanej i defosforylowanej
Enzymów będących heteropolimerami co najmniej dwu polipeptydów związanych niekonwalencyjnie
Enzymów występujących w formie apoenzymów i holoenzymów.
1. Związki z grupy niesteroidowych leków przeciwzapalnych (np. kw. acetylosalicylowy)
a) obniżają syntezę cholesterolu przez niekompetycyjne hamowanie aktywności reduktazy HMG-CoA
b) obniżają hamowanie retrowirusów przez kompetycyjne hamowanie odwrotnej transkryptazy
c) obniżają syntezę kw.arachidonowego przez allosteryczne hamowanie aktywności karboksylazy acetylo-CoA
d) obniżają syntezę prostaglandyn przez nieodwracalne hamowanie aktywności cyklooksygenazowej (dioksygenazowej) syntazy prostaglandynowej
e) obniżają namnożenie bakterii przez allosteryczne hamowanie aktywności cyklooksygenazowej (dioksygenazowej) syntazy prostaglandynowej
2.Aktywność właściwa enzymu
a) określa stopień czystości (jakości) preparatu enzymu
b) określa ile jednostek aktywności przypada na 1mg białka
c) określa ilość jednostek aktywności enzymu w jednostce objętości
d) określa ile jednostek aktywności przypada na 1mikromol enzymu
e) żadna z odpowiedzi nie jest poprawna
3.Biotyna jest niezbędna w reakcjach katalizowanych przez
a) aminotransferazy
b) karboksylazy
c) dehydrogrnazy
d) kinazy
e) peroksydazy
4.Przykładem izoenzymów są:
a) syntaza kw. tłuszczowych, karboksylaza acetylo-CoA, pepsyna
b) dehydrogenaza jabłczanowa, dehydrogenaza mleczanowa, dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowa
c) pepsyna, fumaraza, dehydrogenaza mleczanowa
d) chymotrypsyna, dehydrogenaza mleczanowa, dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowa
e) syntaza kw. Tłuszczowych, karboksylaza acetylo-CoA, dehydrogenaza mleczanowa
5.Po dodaniu ..(V0).. mieszaniny reakcyjnej inhibitora akompetycyjnego
a) wzrasta szybkość max reakcji (Vmax) i spada Km
b) spada Vmax i spada Km
c) wzrasta Vmax i wzrasta Km
d) spada Vmax i Km nie ulega zmianie
e) Vmax nie ulega zmianie ,wzrasta Km
6.Do klasy transferaz należą następujące grupy enzymów
a) glikozydazy, dehydrogenazy, hydrolazy
b) aminotransferazy, karboksylazy, kinazy
c) dekarboksylazy, metylotransferazy, epimerazy
d) transketolazy, kinazy, glikozylazy
e) acetylotransferaz, transketolazy, metylotransfyrazy
7.Które z poniższych stwierdzeń nie jest prawdziwe
a) enzymy są wysoce specyficzne wobec substratów
b) enzymy dostarczają energii niezbędnej do zwiększenia reakcji chemicznej
c) enzym może być użyty wielokrotnie do katalitycznej reakcji
d) enzymy zwiększają V reakcji chemicznej
e) enzymy zmieniają równowagę reakcji chemicznej przez obniżenie energii aktywacji
8.Inhibitorem dehydrogenazy bursztynianowej jest
a) kompetycyjnym-malonian
b) niekompetycyjnym-cytrynian
c) kompetycyjnym-bursztynylo CoA
d) nieodwracalnym-kw.acetylosalicylowy
e) akompetycyjnym=kationy litu (Li+)
9.Który z wymienionych typów inhibitorów powinien zmieniać prędkość max reakcji nie zmieniając powinowactwa enzymu wobec substratu:
a) kompetycyjny
b) niekompetycyjny
c) akompetycyjny
d) inhibitor enzymu allosterycznego typu K
e) inhibitor enzymu allosterycznego typu V
Która z podanych nie jest funkcją albuminy:
transport hormonów
osmoregulacja
zwiększanie rozpuszczalności glukozy
transport bilirubiny
Główne białko surowicy krwi kontrolujące ciśnienie osmotyczne krwi to:
hemoglobina
albumina
haptoglobina
CRP
Które z podanych białek nie jest białkiem ostrej fazy:
CRP
1-antytrypsyna
albumina
fibrynogen
Które z białek nie jest syntetyzowane przez wątrobę:
protrombina
ceruloplazmina
immunoglobuliny
ferrytyna
Która z podanych liniowych sekwencji atomów odzwierciedla układ w łańcuchu polipeptydowym?
–N–C–C–N–C–C–N–C–C
–N–C–O–N–C–O–N–C–O–
–N–C–C–O–N–C–C–O–N–C–C–O–
–N–H–C–C–N–H–C–C–N–H–C–C–
–N–H–C–O–H–N–H–C–O–H–N–H–C–C–
Protamina jest białkiem wiążącym insulinę co spowalnia wchłanianie tej drugiej. Które z podanych zdań najlepiej tłumaczy istotę oddziaływań pomiędzy bogatą w argininę protaminą a insuliną?
arginina to zasadowy aminokwas, który wiąże ujemnie naładowane łańcuchy boczne aminokwasów insuliny
arginina to zasadowy aminokwas, który wiąże się do grup karboksylowych na końcu N cząsteczki insuliny
arginina to duży hydrofobowy aminokwas, który tworzy kompleksy z leucyną i fenyloalaniną w łańcuchu insuliny
arginina tworzy mostki dwusiarczkowe z resztami cysteiny, które łączą peptydy A i B w cząsteczce insuliny
łańcuch boczny argininy tworzy wiązanie peptydowe z grupą karboksylową położoną na końcu cząsteczki insuliny.
Które z podanych zdań prawidłowo charakteryzuje rejony -helisy w cząsteczce białka?
wszystkie mają tę samą strukturę pierwszorzędową
wszystkie powstają dzięki wiązaniom wodorowym pomiędzy karbonylowym tlenem jednego wiązania peptydowego a amidowym wodorem innego wiązania peptydowego
wszystkie powstają dzięki wiązaniom wodorowym pomiędzy karbonylowym tlenem wiązania peptydowego a wodorem położonym w łańcuchu bocznym dowolnego aminokwasu
wszystkie powstają dzięki wiązaniom wodorowym pomiędzy dwoma aminokwasami przylegającymi do siebie w strukturze pierwszorzędowej białka
wymagają obecności dużych ilości proliny i glicyny
Które ze zdań opisuje białko globularne?
aminokwasy hydrofilowe położone są zazwyczaj we wnętrzu cząsteczki białka
aminokwasy hydrofobowe położone są zazwyczaj na powierzchni cząsteczki białka
struktura trzeciorzędowa tworzy się dzięki hydrofobowym i elektrostatycznym oddziaływaniom pomiędzy aminokwasami oraz dzięki wiązaniom wodorowym pomiędzy aminokwasami i między aminokwasami a wodą
struktury drugorzędowe tworzą się głównie dzięki oddziaływaniom hydrofobowym pomiędzy aminokwasami
kowalencyjne mostki disiarczkowe są bezwzględnie niezbędne do utrzymania stabilnej struktury białka
Który z podanych aminokwasów występuje najprawdopodobniej w domenie transbłonowej?
prolina
glutaminian
lizyna
leucyna
arginina
Jaka struktura jest najczęściej spotykana w płytkach amyloidu tworzących agregaty w neuronach osób chorych na chorobę Alzheimera?
głównie -harmonijka
głównie -helisa
głównie rejony o nieuporządkowanej strukturze
duża ilość mostków disiarczkowych pomiędzy łańcuchami polipeptydowymi
natywna konformacja o małej zawartości energii
Rozwój szkorbutu jest spowodowany zaburzeniami procesu:
tworzenia mostków disiarczkowych inicjujących powstawanie tropokolagenu
tworzenia wiązań krzyżowych z udziałem lizyny pomiędzy cząsteczkami tropokolagenu
sekrecji tropokolagenu do macierzy pozakomórkowej
tworzenia włókien kolagenowych
hydroksylacji proliny, co prowadzi do destabilizacji struktury kolagenu
Wiązanie N-glikozydowe w białkach tworzą:
reszta asparaginy i N-acetylogalaktoza
reszta glutaminy i N-acetylogalaktoza
reszta glicyny i N-acetyloglikoza
reszta asparaginy i N-acetyloglukozamina
reszta seryny i N-acetylogalaktozamina
Który z podanych związków nie bierze bezpośrednio udziału w tzw. efekcie Bohra:
H+
CO2
anhydraza węglanowa
2,3-BPG
HCO3-
Który z podanych enzymów odgrywa istotną rolę w biosyntezie kolagenu:
hydroksylaza prolilowa
hydroksylaza tyrozyny
oksydaza choliny
monoaminooksydaza
oksygenaza tryptofanu
N- i C-terminalne peptydy są usuwane z cząsteczki prokolagenu po zadziałaniu peptydazy prokolagenowej. Które z podanych zdarzeń poprzedza ten etap?
synteza łańcuchów peptydowych kolagenu
hydroksylacja reszt lizyny i proliny
tworzenie potrójnej helisy
sekrecja do przestrzeni pozakomórkowej
tworzenie wiązań krzyżowych między cząsteczkami tropokolagenu
Która z podanych cząsteczek tworzy wiązania krzyżowe w kolagenie?
hydroksylizyna
prolina
lizyna
asparaginian
desmozyna
Powinowactwo Hb do O2 rośnie na skutek:
tworzenia soli Hb
powstania wiązań krzyżowych we Hb
obniżenia pH
zmniejszenia stężenia 2,3-BPG
wzrostu ciśnienia parcjalnego CO2
Podana sekwencja to część białka globularnego. Które z podanych zdań najlepiej opisuje ten peptyd?
Ser-Val-Asn-Asn-Val-Phe-Ser-Glu-Val-Cys-His-Met-Arg
w pH 7.4 peptyd nie ma ładunku ujemnego
zawiera tylko jeden aminokwas siarkowy
aminokwasy hydrofobowe są w przewadze w stosunku do hydrofilowych
działanie chymotrypsyny spowoduje powstanie mniejszych fragmentów
tylko trzy grupy boczne aminokwasów mogą tworzyć wiązania wodorowe
Które z podanych białek ma największe powinowactwo do tlenu?
mioglobina
HbA + BPG
HbA
HbA2
HbF
Które ze zdań na temat HbS jest prawdziwe?
to normalna hemoglobina występująca u ludzi dorosłych
to Hb zmodyfikowana poprzez dodanie Cys na końcu C
to zmutowana forma Hb, w której kwas glutaminowy w każdym łańcuchu jest zamieniony na walinę
cząsteczka nie tworzy agregatów w erytrocytach tak dobrze jak HbA
agregacja cząsteczek jest stymulowana w wysokich stężeniach tlenu
Która z witamin jest niezbędna do produkcji kolagenu:
A
C
D
biotyna
fosforan pirydoksalu
System kompensacyjny umożliwiający dostarczenie odpowiedniej ilości tlenu w warunkach zmniejszonego ciśnienia parcjalnego w otoczeniu (np. na dużych wysokościach) to:
wzrost syntezy 2,3-bisfosfoglicerynianu w erytrocytach
spadek syntezy 2,3-bisfosfoglicerynianu w erytrocytach
wzrost syntezy hemoglobiny w erytrocytach
spadek syntezy hemoglobiny w erytrocytach
spadek pH krwi
Czynnikami obniżającymi powinowactwo hemoglobiny do tlenu są:
CO2
wzrost pH
spadek liczby erytrocytów we krwi
wzrost stężenia 2,3-bisfoglicerynianu
Podaj zdania prawdziwe na temat syntezy kolagenu:
hydroksylacja proliny wymaga udziału tlenu cząsteczkowego i -KG
potrójna helisa jest tworzona po usunięciu globularnych końców białka
glikozylacja następuje przed hydroksylacją
łączenie tropokolagenu we włókna kolagenowe jest niezbędne do sekrecji poza komórkę
stabilność potrójnej helisy rośnie wraz z rosnącą zawartością hydroksylizyny
Białkami ostrej fazy są:
2-makroglobulina
ceruloplazmina
transferyna
1-antytrypsyna
haptoglobina
Przyczynami hipoproteinemii są:
rozległe oparzenia
krwawienia
odwodnienia
uszkodzenia wątroby
niedożywienie
Wiązania tworzące strukturę czwartorzędową białek to wiązania:
hydrofobowe
peptydowe
disiarczkowe
jonowe
wodorowe
Podaj zdania prawdziwe na temat mioglobiny:
jest to białko złożone
zawiera w swojej cząsteczce jon żelaza
jej właściwością jest to, że tak samo dobrze wiąże jak i oddaje tlen
w czasie wiązania tlenu przez mioglobinę obserwuje się zjawisko kooperatywności
krzywa wiązania tlenu przez mioglobinę ma kształt sigmoidalny
Dwutlenek węgla jest transportowany z tkanek do płuc pod postacią:
gazowego CO2
karbaminianów
wolnego jonu HCO3-
kwasu węglowego
związanego z jonem żelaza w hemoglobinie jonu HCO3-
. Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
reakcję syntezy dipeptydu zbudowanego z aminokwasów charakterystycznych dla sekwencji sygnałowych białek sekrecyjnych.
trójpeptyd zbudowany kolejno z dwóch aminokwasów charakterystycznych dla kolagenu i aminokwasu aromatycznego.
trójpeptyd zbudowany kolejno z aminokwasu odpowiedzialnego za wiązanie tlenu do hemu w cząsteczce hemoglobiny, aminokwasu tworzącego wiązania dwusiarczkowe i fenyloalaniny, nazwij powstały trójpeptyd.
dipeptyd zbudowany z dwóch różnych aminokwasów tworzących -zgięcie.
wiązanie glikozydowe powstające pomiędzy aminokwasem a resztą cukrową, wytwarzane w ER.
dipeptyd zbudowany z aminokwasów tworzących wiązanie a) N-glikozydowe oraz b) O-glikozydowe w glikoproteinach.
aminokwas powstający wskutek działania witaminy K, podaj jego nazwę.
zmodyfikowany aminokwas zawierający w swojej strukturze atom selenu, podaj jego nazwę.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
reakcję procesu biosyntezy kolagenu, w której dochodzi do hydroksylacji proliny, podaj nazwę enzymu i zaznacz udział koenzymów.
katalizowaną przez białko należące do klasy 2-globulin, zwierające miedź, podaj nazwę białka.
Wymień:
trzy przykłady rybonukleoprotein i podaj ich funkcje.
po jednym przykładzie białek należących do 1, 2 i -globulin.
po jednym przykładzie nukleoproteiny, chromoproteiny i metaloproteiny.
po jednym przykładzie białka lub peptydu pełniącego funkcję: strukturalną, magazynującą, hormonalną.
jakie białko występuje w surowicy krwi w największej ilości i jaka jest jego zawartość w mg/ml w 15 ml krwi zdrowego człowieka.
trzy rodzaje wewnątrzkomórkowych modyfikacji posttranslacyjnych białka w procesie biosyntezy kolagenu.
wewnątrzkomórkowe modyfikacje posttranslacyjne w procesie biosyntezy kolagenu.
ważne klinicznie glikoproteiny surowicy krwi.
Przedstaw graficznie:
wpływ BPG na wiązanie tlenu przez Hb i Mb.
na wykresie zależność pomiędzy stężeniem parcjalnym tlenu i wysyceniem hemoglobiny przez tlen przy prawidłowym i obniżonym pH krwi.
na wykresie wysycenie Hb tlenem, w zależności od ciśnienia parcjalnego tlenu, w różnych stężeniach CO2.
zależność wysycenia tlenem cząsteczki a) HbF i b) HbA w erytrocytach od pO2, zaznacz wartości P50 dla obu hemoglobin.
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
przedstawiający udział hemoglobiny w transporcie gazów oddechowych.
Oblicz:
ile albuminy znajduje się w 200l surowicy krwi zdrowego człowieka.
Czwartek 8:00 R2/2004-12-02
Napisz wzorami strukturalnymi reakcję :
1. katalizowaną przez dowolny kompleks wieloenzymatyczny (zaznacz symbolami ewentualny udział koenzymów). Podaj nazwę tego kompleksu.
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
2. katalizowaną przez enzym, którego Km wyznaczano doświadczalnie na ćwiczeniach. Podaj nazwę enzymu i klasę do której ten enzym należy.
3. katalizowaną przez enzym, którego aktywność jest regulowana poprzez odwracalne wiązanie enzymu z błonami.
Przedstaw graficznie:
4. (na jednym wykresie) zależność szybkości reakcji od stężenia substratu dla reakcji zachodzącej a) w temperaturze 25 oC i b) w temperaturze 35oC, katalizowanej przez sercową dehydrogenazę mleczanową.
5. zależność odwrotności szybkości reakcji od odwrotności stężenia substratu dla enzymu którego indeks kooperatywności wynosi 81.
6. (na jednym wykresie) wykres zależności szybkości reakcji od stężenia substratu dla reakcji, katalizowanej przez enzym allosteryczny typu K, zachodzącej a) w nieobecności i b) w obecności efektora dodatniego.
Narysuj schemat :
7. przedstawiający mechanizm reakcji wedle którego przebiega reakcja katalizowana kinazę kreatyny.
Stała równowagi pewnej reakcji enzymatycznej wynosi 0,8. Jaka będzie wartość tej stałej gdy podwoimy stężenie enzymu?
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
reakcję katalizowaną przez enzym klasy I.
trójpeptyd uczestniczący w transporcie aminokwasów ze światła jelita do enterocytów.
reakcję katalizowaną przez enzym klasy IV.
reakcję katalizowaną przez dowolny kompleks wieloenzymowy, podaj nazwy uczestniczących koenzymów.
reakcję katalizowaną przez enzym nabłonka jelitowego biorący udział w końcowym etapie trawienia skrobi.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
1. katalizowaną przez enzym będący markerem zawału mięśnia sercowego.
2. enzymatyczną przebiegającą według mechanizmu sekwencyjnego uporządkowanego.
3. enzymatyczną zachodzącą z udziałem koenzymu będącego pochodną witaminy B12.
4. reakcję hamowaną przez metotreksat.
5. kinazy dehydrogenazy pirogronianowej.
Wymień:
1. trzy leki, których działanie polega na hamowaniu aktywności enzymów, podaj jakie enzymy hamują.
2. enzymy będące markerami ciężkiego uszkodzenia wątroby.
3. trzy enzymy aktywowane przez nieodwracalną modyfikację proteolityczną.
4. mechanizmy przebiegu reakcji enzymatycznych, podaj po jednym przykładzie enzymu.
5. po jednym inhibitorze: cyklooksygenazy, konwertazy, fosfodiesterazy cGMP.
6. trzy możliwe sposoby regulacji aktywności enzymu polegające na zmianie ilości jego cząsteczek.
7. podstawowe mechanizmy regulujące w szybki sposób aktywność enzymów.
8. trzy enzymy ściany jelita trawiące cukry.
Przedstaw graficznie:
1. wykres zależności v / [s] dla enzymów wykazujących wartość współczynnika Hilla 1< i 1>.
2. wykres zależności v / [s] przedstawiający regulację aktywności karboksylazy acetyloCoA w obecności i nieobecności cytrynianu.
3. na wykresie Lineweavera-Burke’a jak zmieni się Km i Vmax enzymu po dodaniu do mieszaniny reakcyjnej substancji, która wiąże się z wolnym enzymem lub kompleksem enzym-substrat i zapobiega utworzeniu produktu.
4. zależność 1/v od 1/[s] dla enzymu allosterycznego typu V: a) w nieobecności efektorów; b) w obecności aktywatora; c) w obecności inhibitora.
5. profil zmian stężenia aktywności aminotransferazy asparaginianowej w osoczu krwi chorego w czasie pięciu dni od wystąpienia zawału mięśnia sercowego.
6. na wykresie zależność v od [s] dla reakcji katalizowanej przez dehydrogenazę bursztynianową inkubowaną z malonianem oraz inkubowaną z jonami rtęci.
7. wykres zależności v od [s] dla reakcji katalizowanej przez enzym wykazujący kooperatywność dodatnią w nieobecności efektorów oraz w obecności efektora ujemnego i efektora dodatniego.
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
1. wyjaśniający działanie streptokinazy jako leku, zaznacz skutki działania zbyt dużej dawki.
2. reakcji enzymatycznej typu ping-pong.
3. ilustrujący transport glukozy ze światła jelita do wnętrza enterocyta.
4. ilustrujący działanie kolipazy.
5. ilustrujący działanie -glutamylotranspeptydazy w transporcie aminokwasów do komórek.
Oblicz:
ile nanomoli sacharozy uległo rozłożeniu przez 1 ml roztworu sacharazy w ciągu 3 minut, jeśli stężenie aktywności enzymatycznej tego roztworu wynosiło 9 jednostek enzymatycznych na 1 l, oraz przyjmując, że reakcja przebiegała według kinetyki zerowego rzędu.
DNA
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
nukleotyd będący częścią DNA, zawierający zasadę azotową komplementarną do adeniny.
dinukleotyd zbudowany z nukleotydów, pomiędzy którymi tworzą się w cząsteczce DNA trzy wiązania wodorowe.
dinukleotyd zbudowany z nukleotydów: a) najczęściej ulegającego w DNA metylacji i b) ulegającego uszkodzeniu po wpływem UV.
dinukleotyd zbudowany z dwóch nukleotydów będących częścią DNA, zawierających zasady purynowe.
dinukleotyd zbudowany z dwóch nukleotydów będących częścią DNA, zawierających zasady pirymidynowe.
zasadę azotową, która powstaje na skutek spontanicznej deaminacji 5-metylocytozyny.
reakcję katalizowaną przez glikozydazę uracylową DNA.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
katalizowaną przez odwrotną transkryptazę.
katalizowaną przez białko FEN w procesie wycinania startera podczas replikacji DNA jądrowego
katalizowaną przez polimerazę DNA.
katalizowaną przez ligazę DNA.
katalizowaną przez mitochondrialną polimerazę DNA.
(przyłączenia jednego nukleotydu) katalizowaną przez polimerazę DNA (delta).
katalizowaną przez primazę.
katalizowaną przez 3’ 5’ egzonukleazę DNA.
Wymień:
nazwy systemów naprawiających DNA i podaj po jednym przykładzie uszkodzenia przez nie naprawianego.
etapy izolacji DNA z krwi szczura, napisz dlaczego izolację przeprowadza się w obecności EDTA.
składniki nukleosomu.
trzy białka biorące udział w replikacji, które rozkładają ATP.
białkowe składniki kompleksu przeprowadzającego inicjację replikacji na nici wiodącej u eukariontów.
kolejne enzymy uczestniczące w biosyntezie nici DNA z fragmentów Okazaki.
trzy główne rodzaje uszkodzeń DNA w wyniku działania reaktywnych form tlenu.
trzy przyczyny częstszego uszkodzenia mitochondrialnego DNA w porównaniu z jądrowym.
trzy transferazy uczestniczące w procesie replikacji DNA.
trzy hydrolazy uczestniczące w procesie replikacji DNA.
polimerazy DNA uczestniczące w procesie replikacji DNA jądrowego.
enzymy uczestniczące w systemie wycinania zasad w DNA zawierającym uracyl.
Przedstaw graficznie:
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
przedstawiający na widełkach replikacyjnych wszystkie etapy procesu syntezy DNA zachodzącej w komórkach eukariotycznych z uwzględnieniem białek i enzymów uczestniczących w tym procesie.
przedstawiający etapy techniki laboratoryjnej umożliwiającej identyfikację specyficznych sekwencji DNA przy ich jednoczesnym namnożeniu.
RNA
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
nukleotyd znajdujący się na końcu 3’ dojrzałego transkryptu klasy II.
kwas 5’-adenylowy, podaj symbol biochemiczny tego związku.
dinukleotyd zbudowany z dwóch nukleotydów będących częścią RNA, zawierających zasady pirymidynowe.
trinukleotyd będący produktem transkrypcji na matrycy DNA o następującej sekwencji – ACT.
nukleotyd znajdujący się na końcu 5’ dojrzałego transkryptu klasy II.
reakcję edytowania RNA prowadzącą do pojawienia się w dojrzałym transkrypcie inozyny.
reakcję edytowania RNA prowadzącą do pojawienia się w dojrzałym ApoB48 dodatkowego kodonu stop.
trinukleotyd znajdujący się na końcu 3’ dojrzałej cząsteczki tRNA.
dinukleotyd tworzący „czapeczkę” na końcu 5’ dojrzałego mRNA.
dinukleotyd zbudowany z nukleotydów wchodzących w skład sekwencji DNA determinującej start procesu transkrypcji.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
reakcję procesu transkrypcji hamowaną przez -amanitynę.
dostarczającą energii niezbędnej w procesie syntezy łańcucha RNA na matrycy DNA.
katalizowaną przez nukleotydylotransferazę tRNA (niezależną od matrycy).
Wymień:
rodzaje RNA występujące w mitochondriach.
modyfikacje jakim może ulec mRNA w komórkach eukariotycznych.
trzy nietypowe nukleozydy występujące w kwasach rybonukleinowych.
enzymy uczestniczące w tworzeniu „czapeczki” w pre-mRNA.
Przedstaw graficznie:
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
ilustrujący przebieg modyfikacji transkryptów klasy II.
TRANSLACJA
Napisz wzorami strukturalnymi (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
dwunukleotyd zbudowany z nukleotydów pirymidynowych wchodzących w skład antykodonu dla kodonu startowego translacji.
trinukleotyd będący antykodonem do kodonu AGC.
Napisz używając symboli lub pełnych nazw biochemicznych w formie równania reakcję (zaznacz ewentualny udział koenzymów):
katalizowaną przez peptydylotransferazę.
aktywacji aminokwasu inicjującego translację w mitochondriach.
katalizowaną przez peptydazę sygnałową.
Wymień:
białka uczestniczące w kotranslacyjnym transporcie białek do ER.
trzy białka biorące udział w translacji, które hydrolizują GTP.
trzy antybiotyki będące inhibitorami translacji i podaj, które etapy hamują.
trzy cechy kodu genetycznego.
Przedstaw graficznie:
Narysuj schemat (używając symboli lub nazw biochemicznych):
przedstawiający wpływ puromycyny na przebieg translacji.
przedstawiający terminację translacji.
kotranslacyjnego transportu białek do ER.
inicjacji translacji.
regulację inicjacji biosyntezy globiny przez hem.
translacyjny cykl elongacyjny.
regulację inicjacji translacji przez czynniki wzrostowe.
I
KOŁO
1.
Strukturalnie nukleotyd znajdujący się na końcu 3’mRNA?
2.
Strukturalnie reakcję katalizowaną przez enzym klasy I?
3.
Wykres s od t enzymu allosterycznego typu K w obecności i
nieobecności efektora + i –?
4.
Wykres 1/V od 1/A dla aktywatora bezwzglednie koniecznego?
TEST
1.Polimeraza
RNA DNA zależna:
a)
α
b)δ
c)telomeraza
2.Co
potrzebuje polimeraza δ
a)
primer
b)Mg
c)PCNA
3.Do
izoenzymów należy…
4.Replikacja
zachodzi
a)od
5’=>3’ na nici opóźnionej
b)
od 5’=>3’ i od 3’=>5’
c)
na wielu niciach jednoczesnie
5.Wspólne
dla polimerazy RNA I, II, III są
a)UBP
b)SR1
6.Glikozy..
AP
a)w
BER
7.
Inhibicja niekompetycyjna
a)
maleje stężenie ES
b)
V maleje K const
8.
enzym wystepujący w osoczu i mający znacznie kliniczne
a)Alat
b)CPK
c)trypsyna
d)amylaza
e)pepsyna
9.choroby
– leki
a)
inhibitor MAO
b)
aparaginaza
c)
inhibitory co obniżaja krzepliwość
10.
Do translacji potrzeba
a)rybosom
60
b)
40
c)czynniki
elongacyjne
11.
do rRNA jądrowego należa
a)28S
b)5S
c)18,5S
12.Co
jest w jądrze
a)α
b)β
c)γ
13.
Nić kodująca jest
a)komplementarna
do antyrównoległej
b)
mRNA
14.
biosynteza w transkrypcji zachodzi
a)
5’=>3’
b)
3’=>5’
15.
Co robi PCNA
a)
obejmuje pojedyncza nić DNA
b)
prowadzi polimerazę δ
16.
Telomeraza jest
a)
rybonukleoprotenina
b)białko
proste
c)
niezbędna do biosyntezy w jądrze
I koło – Aleksandrowicz gr. 6
Napisz wzorami strukturalnymi:
Dipeptyd (powstały w wyniku hydrolizy glikoproteiny) zbudowany z alaniny i aminokwasu, do którego jest przyłączony wiązaniem N – glikozydowym odpowiedni monosacharyd .(to pytanie było pierwszego dnia w czerwcu)
deoksyadenozynę
Napisz używając symboli lub nazw biochemicznych:
reakcję katalizowaną przez nukleotydylotransferazę tRNA .(to pytanie było drugiego dnia w czerwcu).
reakcję tworzenia pierwszego wiązania fosfodiestrowego w procesiem transkrypcji katalizowanej przez polimerazę RNA II
Przedstaw graficznie na jednym wykresie:
Zależność wysycenia tlenem cząsteczki :a)Hb F i b)Hb A w erytrocytach od pO2.
Zaznacz wartości P50 dla obu Hb. .(to pytanie było drugiego dnia w czerwcu)
Narysuj schemat (bez wzorów)
Ilustrujący regulację translacji przez hem w komórkach erytropoetycznych. .(to pytanie było pierwszego dnia w czerwcu)
Przedstawiający proces naprawy DNA zawierającego 8 – oksogwaninę w swojej cząsteczce. Podaj pełne nazwy odpowiednich enzymów.
Oblicz
Ile miligramów albuminy znajduje się w 300 mikrolitrach surowicy krwi zdrowego dorosłego człowieka?
Podaj zakres normy stężenia albuminy w surowicy krwi
1)
Wzorami strukturalnymi: dwupeptyd zbudowany z fenyloalaniny i
aminokwasu, który w łańcuchu bocznym zawiera siarkę.
2)
Napisz schemat reakcji syntetyzowanej przez polimerazę delta.
3)
Wykres 1/V od 1/S dla enzymu o kooperacji=80 i stałej Hilla=1
4)
Scemat reakcji przeprowadzanej przez kinazę kreatynową.
5)
Podać wzór strukturalny nukleozydu wchodzącego w skład nukleotydu
występującego na końcu 3' dojrzałego mRNA.
6)
Napisać wzorami strukturalnymi reakcję katalizowaną przez enzym II
klasy.
7)
Narysować wykres [s] od t dla reakcji zerowego rzędu katalizowanej
przez enzym allosteryczny bez i w obecności aktywatora.
8)
Narysować wykres wysycenia tlenem od pO2 dla HbA i HbF + podać
wartości P50 dla obu.
9)
Narysować wzór dipeptydu zbudowanego z cysteiny i proliny.
10)
Napisać reakcję katalizowaną przez enzym klasy 6, którego
aktywność regulowana jest przez depolimeryzację/polimeryzację.
11)
Wykres V od T dla enzymu typu K bez i z aktywatorem + napisać
przykład takiego enzymu i aktywatora dla niego.
12)
Schemat naprawy DNA w którym wystepuje uracyl (model "krótkiej
łatki") + nazwy wszystkich enzymów biorących udział.
13)
Wzór strukturalny dipeptydu zbudowanego z tryptofanu i dowolnego
aminokwasu zawierającego w łańcuchu bocznym grupę -OH.
14)
Słownie reakcję katalizowaną przez enzym klasy II z glukozą jako
substratem.
15)
Wykres V od S dla enzymu allosterycznego typu V z i bez efektora
dodatniego. Podać przykład takiego enzymu i efektora.
16)
Schemat powstawania Apo48 i Apo100 ( redagowanie).