egzamin z Genetyki i Inżynierii genetycznej

1. Naszkicować reakcję katalizowaną przez polimerazę DNA tworzenia wiązania fosfodiestrowego między nicią DNA z trójfosforanem nukleozydu adeninowego

2. Od czego zależy właściwe ustalenie temperatury dołączania primerów w reakcji PCR

3. Od czego zależy wydajność polimerazy Taq

4. Wymienić i omówić najbardziej czułe na zmiany temperatury elementy reakcji PCR

5. Wymienić i omówić inhibitory reakcji PCR

6. Wymienić i omówić wzmacniacze reakcji PCR

7. Krótko omówić zasady różnicowego i multipleksowego PCR

8. Jak zamplifikować DNA o nieznanej sekwencji.

9. Krótko opisać jedną z możliwych metod tworzenia mutacji punktowych techniką PCR

10. Wymienić metody klonowania produktów PCR do wektora plazmidowego i wskazać uzasadniając najbardziej efektywną.

11. Inicjacja replikacji chromosomu E.coli

12. Inicjacja transkrypcji z promotora procaryotycznego

13. Inicjacja translacji

14. Klonowanie molekularne do plazmidów serii pUC

15. Sposoby amplifikacji nieznanego DNA metodą PCR

16. Zasady postępowania w konstrukcji szczepionek DNA

17. DNA szczepionki ( zalety i wady w por. z innymi szczepionkami)

18. Metody iniekcji szczepionek DNA

19. Szczepionki białkowe i atenuowane

20. Korzyści ze stosowania szczepionek DNA

21. Regulacja ekspresji genów w operonie laktozowym

22. Budowa tRNA

23. Klonowanie kierunkowe DNA do plazmidu pBR322

24. sposoby klonowania produktów PCR uzyskanych za pomocą polimerazy Taq

25. enzymy restrykcyjne klasy II s charakterystyka i zastosowanie

26. PCR w badaniach epidemiologicznych

27. Enzymy restrykcyjne

28. systemy restrykcji i modyfikacji bakterii

29. Tworzenie delecji z wykorzystaniem enzymów II s

30. Kryteria doboru enzymów restrykcji w klonowaniu molekularnym fragmentów DNA

31. Enzymy użyteczne w analizie restrykcyjnej DNA

32. Enzymy restrykcyjne - izoschizomery i neoschizomery

33. Problem dam/dcm metylacji DNA w komórkach E.coli

34. warunki trawienia a niespecyficzna aktywność

35. Tworzenie nowych miejsc restrykcyjnych przez łączenie końców DNA

36. Omówić polimerazy DNA stosowane w metodach inżynierii genetycznej

37. Omówić polimerazy RNA stosowane w metodach inżynierii genetycznej

38. Omówić nukleazy

39. Omówić kinazy polinukleotydowe i alkalicznej fosfatazy

40. Topizomerazy

41. Białka wiążące się z DNA

42. Główne cechy wektora plazmidowego

43. pBR322

44. plazmid typu ColE1

45. Wektory o szerokim zakresie gospodarzy

46. Wektory do ekspresji genów i nadprodukcji białek

47. Wektory wyspecjalizowane

48. Zjawisko niezgodności plazmidów

49. Wektory do przygotowywania bibliotek genomowego DNA

50. Wektory wahadłowe

51. System Tabora-Studiera do ekspresji genów

52. wymagania genetyczne gospodarza bakteryjnego w klonowaniu molekularnym

53. ekspresja genu

54. operony i regulatory

55. regulacja transkrypcji

56. elementy składowe promotora procaryota

57. rozpoznawanie sekwencji promotora przez polimerazę RNA

58. podjednostka sigma w polimerazie RNA i ich rola w życiu bakterii

59. funkcjonalne domeny podjednostki alfa polimerazy RNA

60. regulacja inicjacji transkrypcji

61. oddziaływania polimerazy RNA z modulatorami transkrypcji

62. rola białka CAP (CRP) w regulacji transkrypcji

63. rola białka histonopodobnych w regulacji transkrypcji

64. represja operonu lac przez represor lacI

65. analiza transdukcji sygnału w regulacji inicjacji transkrypcji

66. elongacja transkrypcji

67. terminacja transkrypcji

68. terminacja Rho zależna

69. atenuacja

70. degradacja i rozpad transkryptu

71. struktura miejsca wiązania rybosomu - rbs

72. struktura Shine - Dalgarno

73. rejon pomiędzy SD a AUG

74. drugorzędowa struktura RNA a translacja

75. regulacja na poziomie inicjacji i translacji

76. sygnały stop i terminacja translacji

77. rekombinowany DNA

78. klonowanie metodą shot-gun

79. enzymy termostabilne , otrzymywanie, własności i zastosowanie

80. plazmid pT7-7

81. klonowanie genów nieciągłych

82. chromatografia metalopowinowactwa

83. plazmid pET30Lic, budowa klonowanie zastosowanie

84. Fuzyjne białka rekombinantowe

85. Różnicowanie szczepów bakteryjnych za pomocą rybotypowania

86. klasyczne techniki identyfikacji mikrobiologicznej

87. PCR - fingerprinting

88. Technika AFLP

89. Mechanizm reakcji PCR

90. technika PCR-RFLP

91. Odtwarzanie drzew filogenetycznych bakterii

92. Odwrotny PCR

---