3. DNA używane do transformacji wprowadzane jest najczęściej w postaci wektora plazmidowego aby mogło bezpiecznie bez żadnych zbędnych transformacji wniknąć do komórki kompetentnej. Musi także posiadać w swojej strukturze gen selekcyjny. Genem selekcyjnym jest najczęściej gen oporności na antybiotyk, może to być np. gen beta-laktamazy jeśli komórki hodowane będą na pożywce zawierającą ampicylinę.