Przeciwwskazania do hemisekcji:
• nieprawidłowa budowa korzenia
• nieprawidłowo przeprowadzone leczenie endodontyczne
• choroby przyzębia (np. paradontoza)
• zła współpraca ze stomatologiem, niestosowanie się do zaleceń
• niemożność opracowania zęba po odcięciu jego części – trudny dostęp
• choroba pacjenta (niemożność przeprowadzenia zabiegu)