1. Jak wiadomo komórka eukariotyczna zawiera wiele tysięcy różnych białek. Białka te różnią się właściwościami fizyko-chemicznymi dzięki czemu możemy przy użyciu dobrze dobranej strategii chromatograficznej wyizolować je spośród wszystkich innych. Właściwości jakie należy wykorzystać podczas frakcjonowanie białek to wielkość, ładunek, hydrofobowość oraz powinowactwo do innych cząsteczek. W celu wyizolowania białka nie będącego enzymem możemy wykorzystać powinowactwo receptor-ligand bądź przeciwciało-antygen. Jest to metoda charakteryzująca się bardzo wysoką wydajnością w oczyszczaniu białek.
2. Ekspresja genu może być badana na etapie transkrypcji (hybrydyzacja In situ na skrawkach tkanek; northern blotting; RT-PCR) i translacji (western blotting). Jedna z wymienionych metod, hybrydyzacja in situ na skrawkach tkanek, pozwala także na wyróżnienie grup komórek, które morfologicznie nie różnią się od sąsiednich, ale są inne pod względem biochemicznym. Przykładem mogą być komórki nowotworowe badane bezpośrednio po transformacji. Różnią się one od innych komórek ekspresją pewnych genów, nieaktywnych w komórkach zdrowych.