Alfa-komplementacja: System oparty na aktywności β-galaktozydazy (α-komplementacja). Funkcja enzymatyczna beta-galaktozydazy może zostać odtworzona z dwóch fragmentów polipeptydowych, z których żaden oddzielnienie nie jest aktywny. Fragment genu kodujący koniec aminowy(tzw. fragment alfa) jest obecny na plazmidzie, podczas gdy C-końcowy (fragment omega) występuje w chromosomie bakteryjnym gospodarza, lub na plazmidzie pomocniczym. BLUESCRIPT: Zawierają fragment genu lacZ kodujący jego część N-końcową. Gen kodujący C-koniec zwykle jest wbudowany w genom bakterii. Beta galaktozydaza złożona z łańcucha N-i C-końcowego rozkłada barwnik X-gal dając niebieskie zabarwienie kolonii bakteryjnej. W obrębie genu lacZ występuje polilinker do którego wprowadza się klonowany fragment. Bakterie z insertem nie produkują beta galaktozydazy i dają kolonie o białym zabarwieniu (ponieważ wstawka jest w miejscu genu Lac Z).