BIOCHEMIA egzamin 2a, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia, biochemia22


SYNTEZA HEMU:

Syntaza δ-aminolewulinianowa (mitochondrium):

Gly+bursztCoAα-amino-β-ketoadypinian(PLP,CoASH)

kw.δ-aminolewulinowy (CO2)

Syntaza porfobilinogenu (Zn) (cytosol):

2* kw.δ-aminolewulinowy porfobilinogen (2H2O)

Syntaza uroporfirynogenu I (cytosol):

4* porfobilinogen hydroksymetylobilan (4NH3)

syntaza uroporfirynogenu I/kosyntaza uroporfirynogenu III:

hydroksymetylobilan uroporfirynogen III

dekarboksylaza uroporfirynogenu (cytosol):

uroporfirynogen III koproporfirynogen (4CO2)

oksydaza koproporfirynogenu III (matrix):

koproporfirynogen III protoporfirynogen IX (III) (O22CO2)

oksydaza protoporfirynogenu (matrix):

protoporfirynogen IX protoporfiryna IX (6H)

Ferrochelataza (syntaza hemu) (matrix):

Protoporfiryna HEM (Fe)

AZOTOWCE

Deaminacje aa:

DH glutaminianowa: glutaminian αKG (H2O,NH4,NADNADH+H)

Oksydaza L-aa: α-aminokwas α-iminokwas (FMNFMNH2)

α-iminokwas α-ketokwas (H2ONH4)

Glutaminaza: glutamina glutaminian (H2ONH4) +ADP -GDP

Transaminacje aa:

AlAT: PIR + Glu Alanina + αKG (PAL)

AspAT: OAA + Glu Asp + αKG (PAL,PLP)

Transaminaza glutaminianowa: α-ketokwas+Glutaminianα-aa+αKG (PAL)

Syntetaza karbamiolofosforanowa I (mit-NH4, cyt-glutamina)

CO2,H2O +NH4 karbamoiloP I (CAP) (2ATP2ADP+Pi)

-niedobór -hiperamonemia, zespół Rey'a

syntetaza glutaminy (ER): Glutaminian +NH4 Glutamina (ATPADP+PI, Mg)

DEAMINACJA OKSYDACYJNA:

DH Glutaminianowa: L-KG (NH4H2O)(NADHNAD) glutaminian

Transaminaza : L-KG (L-aminokwasL-ketokwas)glutaminian

Oksydaza L-aminokwasów: L-aa (+H2O,FMNFMNH2) L-ketokwas + NH4

Oksydaza D-aminokwasów: D-aa (+H2),FADFADH2) kw.ketoacylowy +NH4

DEAMINACJA NIEOKSYDACYJNA:

DH.serynow-treoninowa: Seryna (H2O)PLP(H2O) PIR + NH4

Treonina(PLP,NH4)L-ketomaślan

DH.L-ketomaślanowa: L-ketomaśl.(CoA,NADCO2,NADH) propionyloCoA

GLUTAMINAZA:

Typ nerkowy typ wątrobowy

V / [glutamina] hiperboliczny sigmoidalny

S 0,5 3mM 30 mM

Wpływ NH4 nie stymuluje stymuluje

Wpływ glutaminianu hamuje nie wpływa

CYKL MOCZNIKOWY

Syntetaza karbonylofosforanowa (N-acetylofosforan):

2ATP +NH4 +HCO3 karbonylofosforan/CAP +2ADP+Pi +3H+

Karbonoilotransferaza ornitynowa (tylko mitoch.):

CAP + ornityna cytrulina (Pi) -->do cytoplazmy

Syntetaza argininobursztynianowa:

Cytrulina + asparaginian argininobursztynian (ATPAMP+Pi,2mole)

Liaza argininobursztynianowa:

Argininobursztynian fumaran + arginina

Arginaza: arginina + H2O mocznik + ornityna (-->do mitochondrium)

NH4 +HCO3 + 4ATP +Asp +H2O mocznik + fumaran + 4ADP+Pi

/<----Fumaran <-----------\ /---->arginina---\

Jabłczan \ / \----->mocznik

/ Arginino- \

OAA C.Kr. bursztynian C.Mocz. ornityna

\/<-glutaminian / \ /<-------CAP

/\--->Asparaginian ------>/ \<------cytrulina

L-KG

Regulacja cylku mocznikowego:

1)KRÓTKOKOTERMINOWA -efektory allosteryczne

2)DŁUGOTERMINOWA -indukcja

Syntaza N-acetyloglutaminian: AcCoA+Glu CoASH + N-acetylo-Glu

Arg (z cyklu moczn.)+ ↑ ↓ + syntet.CAP I

Cytrulina (-ADP) argininobursztynian (+GTP) arginina

N-acetyloglutaminian (-arginina) glutaminan

WĄTROBA

Strefa I -okołowrotna (wokół żyły wrotnej),

NH4 z żyły wrotnej,glutamina wchodzi,mocznik wychodzi.

Strefa II -

Strefa III -okołożylna (wokół żył wątrobowych),

amoniak,glutamina wychodzi do jelita i nerek

Aminokwasy:

Asn Asp OAA

Phe Tyr fumaran

Val,Ile,Met,Thr metylomalonyloCoA bursztynyloCoA

Glu(His,Pro) Gln L-KG

Phe Trp,Lys,Tyr acetooctan

Leu HMGCoA

Ile acetyloCoA

Trp Ala Pir

Karboksylaza propionyloCoA:

PropionyloCoA (HCO3,ATPADP+Pi,biotyna) metylomalonyloCoA

Mutaza metylomalonyloCoA:

MetylomalonyloCoA (B12) sukcynyloCoA

L,B-ELIMINACA (uwalnianie NH3 z OH-aa)

Dehydrataza serynowa:

Seryna(PAL,H2O) kw.aminoakrylowy (H2O) PIR + NH3

Dehydrataza treoninowa:

treonina(H2O,PAL)kw.L-aminomasłowy(”-”)kw.L-ketomasłowy

np. alaninaPIR,AspOAA,glutaminianL-KG

Droga ketogenna leucyny:

Leuaminotransferaza leucynowa(L-KGGlu)L-ketoizokapronian

(DH L-ketoizokapr.,CoASHCO2,NADNADH) izowaleryloCoA

(DH izowaleryloCoA,FADFADH2)3-metylokrotonyloCoA

(karboks metylokrotonyloCoA,biotyna,CO2,ATPADP+Pi)

kw.metyloglutaryloCoA (hydrataza,H20)HMG-CoA (liaza HMGCoA)

acetyloCoA + acetooctan

SYNTEZA AMINOKWASÓW:

1) 3-P-glicerol,glicyna seryna cysteina homocysteina

2) PIR (AlAT) alanina

3) L-KG (DH.Glut)glutaminian (cyklizacja) prolina

ornityna arginina

glutamina

4) met.(ATPPpi,Pi)S-adenozynamet(CH3)S-adenozylohomocysteina

(CH3) homocysteina (H2O)

5) OAA (AspAT) asparaginian asparagina

6) Phe Tyr

homocysteina + seryna syntaza cystationiny cystationina +H2O

L-ketomaślan + cysteina +NH4

7) Phe,Tyr,Trp ----hydroksylaza-------> Tyr,DOPA,5-HTP (5-OH-tropina)

THB,H2O-/\->H2O,DHB

\--<--------<---/ -reduktaza DHB (NADPNADPH+H)

FENYLOKETONURIA

Phe aminotransferaza aminokwasów aromatycznych fenylopirogronian

DH.mleczanowa: fenylopirogronian fenylomleczan

Phe fenylooctan

AMINY KATECHOLOWE:

Acetylocholina

Acylotransferaza cholinowa: AcCoA + cholina acetylocholina + CoASH

Esteraza acetylocholinowa: Acetchol.(H2O) aceton + cholina

Adrenalina

Hydroksylaza phe: Phe (BH4BH2)tyrozyna

Hydroksylaza tyrozyny: tyrozyna (O2H2O,BH4BH2)DOPA

Dekarboksylaza DOPA: DOPA (PLP,CO2)dopamina

Hydroksylaza dopaminy: dopamina (O2H2O,2Cu+-prot.2Cu2+-prot)NOR

\dehydroaskorbaskorb/

metylotransf.fenyloetanoloaminowa (rdz.nadn.):NOR(SAMSAH)adrenalina

MAO: NOR (FAD,O2FADH2,NH4)(H2OH2O2)ald 3,4 dihydroksymigdałowy

COMT: NOR,adrenalina (SAM SAH) normetanefryna, metanefryna

Serotonina

Hydroksylaza trypt.: tryptofan (O2H2O,BH4BH2) 5-OH-tryptofan

Dekarboksylaza hydroksytrypt.: 5-OH-trypt. (PLP,CO2) serotonina

Acylotransf.serotoninowa(j.ck.): serot(AcCoACoA)N-acetyloserotonina

Metylotransferaza(szysz.): N-acetylotransferaza(SAMSAH)melatonina

GABA

Dekarboksylaza glutaminowa: glutamina (PLP,H+CO2)GABA

SYNTEZA PURYN

1) fosforylacja adenozyny

kinaza adenozynowa: adenozyna + ATP AMP + ADP

2) reutylizacja zasad puryowych

syntetaza PRPP: rybozo 5-fosforan (ATPAMP) PRPP

fosforybozylotransferaza hipoksantynowo/guaninowa - HGPRT:

hipoksantyna,guanina +PRPP IMP,GMP +Ppi

fosforybozylotransferaza adeninowa - APRT:

adenina + PRPP AMP + Ppi

3) synteza puryn “de novo”

1)amidotransferaza PRPP:

5-P-rybozylo-1-P (glutaminaglutaminian)5-fosforybozyloamina

2)syntetaza GAR: 5-fosforybozyloamina(glicyna,ATPADP+Pi)GAR

3)formylotransferaza GAR -hamowana przez metatrexat:

5-fosforybozyloglicynamid (THF) 5-fosforybozyloformylglicynamid

4)syntetaza FGAM - hamowany przez azaserynę:

5-P....(glutaminaglutaminian)5-PR-formyloglicynamidyna (FGAM)

5)syntetaza AIR: FGAM(ATPADP+Pi,H2O)5-fosforybozyloaminoimidazol

6)karboksylaza AIR: AIR(CO2)5-fosforybozyloaminoimidazolo-4-karb.

7)syntetaza SAICAR: ....(Asp,ATPADP+Pi)5PR5AI-4bursztynylokarbx.

8)liaza SAICAR: SAICAR (fumaran)5PR5AI-4-karboksyamid

9)formylotransferaza AICAR: … (formyloH4F) AICAR

10)syntaza IMP: AICAR (H2O)IMP .

DH IMP: IMP (H2O,NADNADH+H) XMP

Syntetaza GMP: XMP (glutaminaglutaminian,ATPAMP+Ppi) GMP

Syntetaza bursztynyloadenylanowa: IMP (Asp) adenylobursztynian

Liaza adenyloburszt: adenyloburszt (fumaran) AMP

NADH,H<---\/---NAD

NH4<----\ Reduktaza GMP

/---------<-----------\

/ /---->----XMP--->---GMP-->--GDP--->---GTP

IMP

\ \->-adenozburszt->-AMP-->--ADP--->---ATP

\--------<-----------/

NH4<-----/ Deaminaza AMP

CYKL NUKLEOTYDÓW PURYNOWYCH:

/-->NH4

deaminaza AMP /

AMP------------>------------------IMP

\ /<---asparaginian,GTP

\ liaza / syntetaza

fumaran<-\ adenyloburszt /\ adenylobursztynianowa

\--<-adenylobursztynian-<--/ \->GTP+Pi

KATABOLIZM GMP I AMP

/Kw. Nukleinowe\

Nukleotydy guaninowe/ \nukleotydy adeninowe

H20-->| H2O-->/ \

| nukleotydaza /nukleotyd. \ deamin.AMP

Pi<--| Pi<-| |----->NH4

guanozyna adenozyna IMP

Pi->| fosforylaza \ /

| nukletydow NH4<---\ / nukleozydaza

ryb-1-P<-| purynowych \->inozyna<--/-->Pi

guanina Pi--->| fosforylaza nukleot

\ guanaza ryb-1-P<-| purynowych

NH4<--/\-------->ksantyna OX hipoksantyna

Oksydaza | \---<-------/

ksantynowa | \<------(-)allopurinol

kw.moczowy

SYNTEZA PIRYMIDYN

1)fosforylacja nukleozydów pirymidynowych:

kinaza urydylowa/cytydylow: U,C (ATPADP,Mg) UMP,CMP

kinaza deoskycytydynowa: deoksycytydyna (ATPADP,Mg) dCMP

kinaza tymidynowa: tymidyna (ATPADP,Mg) dTMP

2)reutylizacja zasad pirymidynowych:

fosforybozylotransf. pirymidynowa (orotanowo/uracylowo/tymidylan.):

uracyl, ornityna, tymina +PRPP UMP, OMP, TMP +Ppi

3)synteza pirymidyn „de novo”:

/1)syntetaza karbamoilofosforanowa II (cytoplazma):

| glutamina +CO2 +2ATP karbamoilofosforan +2ADP +Pi +glutaminian

| 2)karbamoilotransferaza asparaginianowa:

| karbamoilofosforan + asparagina N-karbamoiloasparaginian +Pi

\3)dihydroorotaza: N-karbamoiloasparaginian dihydroorotan

4)DH dihydroorotanowa(mit.): diOHorotan (NADNADH+H) orotan

5)fosforybozylotransferaza orotanowa: orotan +PRPP OMP +Ppi

6)dekarboksylaza OMP: OMP (CO2) UMP (urydynomonofosforan)

kinaza monofosoranów pirymid.: CMP,dCMP,UMP (ATPADP) CDP,dCDP,UDP

kinaza tymidylanowa: dTMP (ATPADP)dTDP

syntetaza CTP: UTP (glutaminaglutaminian,ATPADP+Pi) CTP

syntetaza tymidylanowa: dUMP (metylenoH4FH2F) TMP

reduktaza difosfonukleotyd.: NDP (NTP,Mg,tioredoxyna-SHS-S) dNDP

reduktaza tioredox.(NADH)

KATABOLIZM PIRYMIDYN:

RNA DNA

/ \ nukleaza / \ nukleaza

CMP----->UMP Pi<-\ dCMP<-- -->dTMP

| \NH4 | \/ \ \

Pi<-| |->Pi deoksycytydyna \-->NH4 \

Cytydyna->urydyna NH4<--| \ deoksytymidyna

\NH4 \ deoksyurydyna<---dUMP \

Pi-->\ /<--Pi \-->Pi \<--Pi

/\ /-->deoksyryb-1-P \->deoksryb1P

ryb-1-P <-/ uracyl tymina

/<-NADPHH DH dihydropirymid. NADPH-->|

/->NADP NADP <---|

dihydrouracyl dihydrotymina

| dihydropirymidynaza |

B-ureidopropionian B-ureidoizobutynian

CO2,NH4<---| ureidopropionaza |-->CO2,NH4

B-alanina B-aminoizobutynian

Tyrozyna3-monojodotyrozyna3,5-dijodotyrozynaT4 (tyroksyna)T3

SYNTEZA KREATYNY I KREATYNINY:

Aminotransf.glic.(nerka): Arg kw.guanidynooctowy (glicornit)

Metylotrans.guanidoct.(wątr): kw.gunoct. kreatyno-P (SAMSAH,ATPADP)

Nieenzymatycznie w mięśniach: kreatyno-P kreatynina (Pi + H2O)

SYNTEZA CHOLINA I ACETYLOCHOLINY:

Dekarboks.serynowa: seryna etanolamina (PLP, CO2)

Metylotransferaza cholinowa: etanolamina cholina (3SAM3SAH)

Acetylotransferaza cholinowa: cholina acet.cholina (acet-CoACoA)

Esteraza acetylocholinowa: acetchol cholina (H2O CH3COOH)

CYKL G-glutamylowy:

Glutamylotranspeptydaza: glutation γglutamylo-Aa (Aa Cys-Gly)

Transpeptydaza glutationu: α glu-cys-gly γ glu-cys-gly

DETOKSYKACE:

Ksenobiotyki (leki,substancje toksyczne,używki)-->

REAKCJE I FAZY:

-utlenianie

np. toluenkw.benzoesowy(+Gly,sprzęganie)kw.hipuronowy

np. benzenfenol(+UDP-GA,sprzęganie)fenyloglukuronid

np.palmitynian chloramfenikolu(H2Opalm.)chloramfenikol(+UDPGA)

wyjątek sulfonamid (AcCoACoA)N-acetylosulfonamid

cytochrom P450 (monooksydazy): NADPHH +O2 +SH NADP +H2O +S-OH

NADPHH\ / FMN,FAD(oks),P450 \ /Fe2+ \ O2 /SH

↓↓ ↑↑cyt450 ↓ ↑ ↓

NADP / \FMN,FAD,redukt.P450/ \Fe3+ / H2) \S-OH

-redukcja

1)nitroredukcja

NO2-->NH3 -grupa prostetyczna FAD,reduktazy RE hepatocytów

2)azoredukcja

np.prontosil --> sulfonamid

-hydroliza

-głównie estry lub amidy (światło przew.pok i krew)

np. prokaina(H2Odwuetyloaminoetanol)kw.p-aminobenzoesowy

REAKCJE II FAZY:

1)Sprzęganie z aktywnym kwasem glukuronowym UDP-GA:

Glc Glc-6P Glc-1-P (+UTP) UDP-Glc +Ppi

DH UDP-Glc: UDP-Glc +2NAD +H2O kw.UDP-Glukuronowy + 2NADH+H

Glukuronylotransferaza: R-OH + UDP-GA R-O-glukuronid + UDP

2 izoformy:UGT1(bilirubina,fenole,aminy,kw.karboksylowy),UGT2(sterydy)

Z: kwasem:O-glukuronid,aminami:N-glukuronid,siarką:S-gluk,nienasyc:C-glk

-NH2 (UDPGAUDP) N-glukuronid aniliny

-OH (UDPGAUDP) O-fenyloglukuronid

-COOH(UDPGAUDP) benzoiloglukuronid

-SH (UDPGAUDP) tiofenyloglukuronid

np. estradiol (UDPGAUDP) glukuronid estradiolu

np. blilirubina (UDPGAUDP) glukuronid bilirubiny

np. bilirubina (2UDPGA2UDP) diglukuronid bilirubiny (75%)

KATABOLIZM HEMu

Oksygenaza hemu: HEM (+NADPH +O2) (NADP,H2O,Fe3+,CO) biliwerdyna

Reduktaza biliwerdyny: biliwerdyna (NADPHNADP) bilirubina

UGT1: bilirubina (UDP-GA)bilirubino- -mono/-di -glukuronid

Związana bilirubina urobilinogen urobilina (sterkobilina)

2)sprzęganie z aktywnym kwasem siarkowym:

ATP + H2SO4 APS (kw.adenozyno-S-fosforanowy)

APS + ATP PAPS (kw. 3-fosfoadenozyno-5-fosforanowy) +ADP

Sulfotransf.: PAPS +R-OH (R-NH3) R-O-SO2-OH (R-NH-S2-OH) +PAP (AMP)

Np. Fenol +PAPS fenylosiarczan + PAP ({H2OPi}AMP)

Np. indoksyl + PAPS kw.indoksylosiarkowy + PAP

Np. estradiol + PAPS siarczan estradiolu + PAP

Np. bilirubina + PAPS siarczan bilirubiny + PAP (15%)

3)S-adenozynometionina:

metionina + ATP SAM (S-adenozynometionina) +Ppi +Pi

metylotransferaz: SAM + X X-CH3 (metylopochodna) +SAX (S-ad.cysteina)

O-metylacja: -OH (SAMSAH) -O-CH3

N-metylacja: pirydyna (-N-)(SAMSAH) N-CH3

S-metylacja: tiofenol -SH (SAMSAH) -S-CH3

Np. COMT: adrenalina (SAMSAH) 3-O-metyloadrenalina

4)Sprzęganie z aktywnym kwasem octowym (acetyloCoA):

acylotransferaza: acetyloCoA + X CoA + acetylopochodna

R-NH3 + AcetyloCoA CoA + R-NH-C=O-CH3

R-OH + AcetyloCoA CoA + R-O-C=O-CH3

Acylotransferaza cholinowa: cholina + AcetyloCoA acetylocholina +CoA

Acetyloesteraza: acetylocholina +H2O octan + cholina +H+

5)Sprzęganie z glutationem:

np. GSH + CH3I GS-CH3 + HI

S-transferaza glutatonowa: R-X +GSH HX + R-SG

γ-glutamylotranspeptydaza: R-SG (H2Oglutamina)R-S-CH2-CH(NH2)-CO-NH-

cysteinyloglicyna: ...(H2Oglicyna)R-S-CH2-CH(NH2)-COOH

N-acetylaza: ...(acetyloCoACoA) kw.merkapturowy -->wydalenie

Np. paracetamol (+GSH) merkaptouran

6)Sprzęganie z aminokwasami



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
bioch Egzamin z odpowiedziami, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia
chemia egzamin - sciaga, niezbędnik rolnika 2 lepszy, Chemia, Egzamin
Egzamin-poprawa +, niezbędnik rolnika 2 lepszy, Gleboznawstwo
BIOCHEMIA - TEST EGZAMINACYJNY, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia, biochemia22
Cwiczenia na egzamin, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia, biochemia22
BIOCHEMIA - PYTANIA EGZAMINACYJNE, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia, biochemia22
Sciaga egzamin wrzesien biochemia, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia, Biochemia-2
Punkt izoelektryczny, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia
Biotechnolog[1]. hubert wyklady, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia
Białka, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia
KOLO. III, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia, biochemia22
kolos 5, niezbędnik rolnika 2 lepszy, biochemia, biochemia22

więcej podobnych podstron