Zagadnienia do wykładu z BIOCHEMII - część I (8.01.2009)

Wprowadzenie do Biochemii

1. Czym zajmuje się biochemia?

2. Jakimi cechami charakteryzują się reakcje biochemiczne?

3. Co oznacza powiązanie reakcji biochemicznych z określonymi strukturami komórkowymi?

4. Jak należy rozumieć „istnienie precyzyjnych mechanizmów integrujących poszczególne reakcje i procesy biochemiczne”?

5. Co to są „fizjologiczne warunki przebiegu reakcji biochemicznych”?

6. Czym różni się wiązanie jonowe od wiązania atomowego związków chemicznych?

7. Podaj nazwy głównych grup funkcyjnych związków chemicznych -OH, -CO0H, -CHO, =CO, -NH₂, -NO₂, - SO₃H.

8. Na czym polega izomeria ketoenolowa? W jakich procesach biochemicznych ma ona znaczenie?

9. Na czym polega tautomeria związków organicznych?

10. Co to są enancjomery?

Aminokwasy i białka

1. Jakie grupy funkcyjne występują w aminokwasach? Jaki charakter nadają one tym związkom?

2. Jak powstaje wiązanie peptydowe?

3. Jakie oddziaływania mogą występować pomiędzy łańcuchami bocznymi aminokwasów w białkach?

4. Na czym polega oddziaływanie wodorowe (powstanie mostku wodorowego)?

5. Co określa struktura pierwszorzędowa białek?

6. Co określa struktura drugorzędowa białek?

7. Co określa struktura trzeciorzędowa białek?

8. Co określa struktura czwartorzędowa białek?

Kataliza enzymatyczna

1. Jak zbudowany jest enzym?

2. Jaki jest mechanizm katalitycznego działania enzymów?

3. Co to jest energia aktywacji?

4. Jak odczyn wpływa na aktywność enzymów?

5. Wymień klasy enzymów.

6. Jakie reakcje katalizują enzymy klasy ...........?

7. Co oznacza cząsteczkowość reakcji chemicznej?

8. Co oznacza praktycznie rzędowość reakcji chemicznej?

9. Równanie Michaelisa-Menten i jego interpretacja.

10. Jakie korzyści wynikają z transformacji Lineweavera-Burka równania Michaelisa-Menten?

11. Na czym polega inhibicja kompetycyjna?

12. Na czym polega inhibicja niekompetycyjna?

Łańcuch oddechowy

1. Rola łańcucha oddechowego.

2. ATP - budowa i właściwości

3. Jakie znaczenie ma występowanie szeregu przenośników w łańcuchu oddechowym(dlaczego procesy te nie są jednostopniowe?).

4. Co decyduje o uszeregowaniu poszczególnych przenośników w łańcuchu oddechowym?

5. Dlaczego oddychanie tlenowe jest bardziej energodajne w porównaniu z procesami beztlenowymi?

Metabolizm tłuszczów

1. Czym są tłuszcze z chemicznego punktu widzenia?

2. Jakie kwasy tłuszczowe występują zazwyczaj w tłuszczach właściwych? Podaj ich wzory.

3. Na czym polega betaoksydacja (bez rysowania schematu)?

4. Jaki jest pierwszy etap betaoksydacji?

5. Jakie koenzymy uczestniczą w odwodorowaniu w procesie betaoksydacji?

6. Jeśli odłączone w beta oksydacji atomy wodoru są wykorzystywane w łańcuchu oddechowym, to czy występuje różnica efektu energetycznego w zależności od koenzymów dehydrogenazy?

7. Ile cząsteczek ATP może powstać w wyniku jednego etapu beta oksydacji (skrócenia acylokoenzymu A o jeden dwuwęglowy fragment)?

8. Ile cząsteczek ATP może powstać w procesie całkowitego rozkładu kwasu ...... w wyniki betaoksydacji?

9. Do jakich celów może komórka wykorzystywać odrywane w procesie betaoksydacji atomy wodoru?

Mechanizmy adaptacyjne drobnoustrojów

1. Co to są ksenobiotyki?

2. Czym różni się biotransformacja od biodegradacji?

3. Co rozumie się przez adaptację drobnoustrojów do rozkładu ksenobiotyków? Do czego sprowadza się taka adaptacja?

4. Czym różni się indukcja enzymatyczna od aktywacji enzymatyczne?

5. Co to jest represja enzymatyczna?

6. Na czym polega adaptacja socjologiczna?

7. Na czym polega adaptacja fizjologiczna?

8. Na czym polega adaptacja genetyczna?

9. Który typ adaptacji posiada szczególne znaczenie dla rozkładu ksenobiotyków?

10. Jakie znamy praktyczne metody adaptacji drobnoustrojów?

Pomiar aktywności mikroorganizmów

1. Do czego mogą służyć pomiary aktywności metabolicznej drobnoustrojów?

2. Dlaczego pomiar intensywności procesów zachodzących w łańcuchu oddechowym jest dobrym sposobem wyznaczania ogólnej aktywności drobnoustrojów?

3. Jakie właściwości powinien posiadać związek chemiczny, aby mógł pełnić rolę sztucznego akceptora elektronów ( i protonów) w łańcuchu oddechowym?

4. Jakie zabiegi wstępne warunkują poprawne wykonanie testu TTC?

Kwasy nukleinowe

1. Jakie informacje zawarte są w kodzie genetycznym? Dlaczego właśnie te, a nie inne?

2. W jaki sposób zapisana jest informacja genetyczna organizmu?

3. Dlaczego podstawowa jednostka kodująca składa się z trzech nukleotydów?

4. Jak kopiowana jest informacja genetyczna ?

5. Jak zbudowany jest rybosom i jakie zachodzą w nim procesy?

6. Jaka funkcję biologiczną pełni mRNA?

7. Jaka funkcję biologiczną pełni tRNA?

8. Jaka funkcję biologiczną pełni rRNA?

9. Funkcja biologiczna rRNA w komórce polega na:

• kodowaniu informacji genetycznej

• udziale w biosyntezie białek

• odczytywaniu kodu genetycznego

Uzupełnij schemat ilustrujący proces biosyntezy białka:

DNA ^transkrypcja ........ ^translacja ........ ^{zwijanie łańcucha} aktywne białko

11. Uzupełnij (napisy nad strzałkami) schemat ilustrujący proces biosyntezy białka:

DNA mRNA białko

Horyzontalny transfer genów (HGT)

1. Czym różni się HGT od wertykalnego (pionowego) transferu genów?

2. Co to są plazmidy?

3. Jaki jest najczęstszy mechanizm oporności na antybiotyki?

4. Na czym polega koniugacyjny HGT?

5. Na czym polega transformacyjny HGT?

6. Na czym polega transdukcyjny HGT?

7. Czym różnią się plazmidy koniugacyjne od mobilizowanych?

II część zestawu obejmować będzie następujące zagadnienia:

Błony biologiczne

Metabolizm węglowodanów

Cykl Krebsa

Metabolizm węglowodorów

Rozkład ksenobiotyków

---