AMINOKWASY
Aminokwasy to małocząsteczkowe związki chemiczne posiadające w swej budowie co najmniej jedną grupę karboksylową i jedną grupę aminową. Każdy aminokwas białkowy cechuje się jednakowym układem podstawnikowym: grupa aminowa (występująca w pozycji alfa), grupa karboksylowa, atom wodoru, łańcuch boczny (R).
Ryc. 1. Ogólny wzór aminokwasu
Właściwości amfoteryczne aminokwasów:
Aminokwasy wykazują w środowisku wodnym właściwości słabych kwasów i słabych zasad, są zatem związkami amfoterycznymi. Właściwości kwasowe aminokwasów wynikają z obecności grupy α-karboksylowej, natomiast właściwości zasadowe aminokwasów wynikają z obecności grupy α-aminowej. Środowisko kwaśne sprzyja wiązaniu protonów przez grupy aminowe, natomiast środowisko zasadowe sprzyja uwalnianiu (dysocjacji) protonów z grup karboksylowych. Z tego powodu aminokwas w środowisku kwaśnym jest kationem, a w środowisku zasadowym anionem.
W warunkach fizjologicznych (pH około 7,4) większość grup karboksylowych jest zdysocjowana i tworzy anion - COO-, a większość grup aminowych wiąże H+, tworząc kation -NH3+.W związku z tym dominującą formą aminokwasu jest jon obojnaczy, będący nośnikiem przeciwstawnych ładunków elektrycznych.
Ryc. 2. Ogólny wzór aminokwasu w środowisku neutralnym.
Wszystkie aminokwasy z wyjątkiem glicyny zawierają 4 różne grupy ułożone tetraedrycznie wokół centralnego atomu węgla (Cၡ), który stanowi centrum asymetrii aminokwasu. W związku z tym aminokwasy białkowe mogą występować jako dwa stereoizomery (nie nakładające się na siebie odbicia lustrzane) i są nazywane formami L i D. Aminokwasy białkowe (z wyjątkiem glicyny) występują w zawsze w konformacji L.
Ryc. 3. Centrum asymetrii aminokwasów.
Reguła ułatwiająca rozpoznanie konformacji: podczas obrotu wokół osi przeprowadzonej przez atomy Cα i H grupy dołączone do Cα czytane przeciwnie do ruchu wskazówek zegara tworzą słowo CORN.
Ryc.4. Reguła CORN.
Podział aminokwasów:
Podział aminokwasów w zależności od charakteru łańcuchów bocznych:
Aminokwasy z łańcuchami niepolarnymi (alanina, walina, leucyna, izoleucyna, fenyloalanina, tryptofan, metionina, prolina, glicyna); łańcuchy boczne tej grupy aminokwasów nie mają żadnych grup funkcyjnych; nie oddają ani nie przyłączają protonów; nie uczestniczą w tworzeniu wiązań jonowych ani wodorowych; są hydrofobowe, nie wiążą wody, mogą uczestniczyć w tworzeniu wiązań hydrofobowych.
Aminokwasy z łańcuchami polarnymi bez ładunku (seryna, treonina, tyrozyna, asparagina, cysteina, glutamina); łańcuchy boczne aminokwasów w fizjologicznym pH wykazują zerowy ładunek elektryczny, a środowisku alkalicznym cysteina i tyrozyna mogą odłączać protony. Seryna, treonina, tyrozyna zawierają grupy hydroksylowe, które mogą uczestniczyć w tworzeniu wiązań wodorowych;
Aminokwasy z łańcuchami kwasowymi (kwas asparaginowy, kwas glutaminowy); łańcuchy boczne tych aminokwasów zawierają grupy karboksylowe, dysocjujące z uwolnieniem H+. W obojętnym pH ulegają one pełnej jonizacji i stają się nośnikami ładunku ujemnego (-COO-).
Aminokwasy z łańcuchami zasadowymi (lizyna, arginina, histydyna); ich łańcuchy boczne zawierają grupy wiążące protony.
Ze względów fizjologicznych niezwykle istotny jest podział aminokwasów na:
Endogenne (syntetyzowane w organizmie): alanina, asparagina, cystyna, kwas asparaginowy, kwas glutaminowy, glutamina, glicyna, hydroksyl prolina, prolina, seryna, tyrozyna
Egzogenne (dostarczane do organizmu z zewnętrz): arginina, histydyna, izoleucyna, leucyna, lizyna, metionina, fenyloalanina, treonina, tryptofan, walina)
Białka są budowane przez 20 aminokwasów występujących w nich. Te same aminokwasy budują białka zwierzęce jak i roślinne.
Tab.1. Nazwy i symbolika aminokwasów białkowych
Nazwa |
Symbol trójliterowy |
Symbol jednoliterowy |
Alanina |
Ala |
A |
Arginina |
Arg |
R |
Asparagina |
Asn |
N |
Asparaginian |
Asp |
D |
Cysteina |
Cys |
C |
Fenyloalanina |
Phe |
F |
Glicyna |
Gly |
G |
Glutamina |
Gln |
Q |
Glutaminian |
Glu |
E |
Histydyna |
His |
H |
Izoleucyna |
Ile |
I |
Metionina |
Met |
M |
Seryna |
Ser |
S |
Leucyna |
Leu |
L |
Lizyna |
Lys |
K |
Prolina |
Pro |
P |
Treonina |
Thr |
T |
Tryptofan |
Trp |
W |
Tyrozyna |
Tyr |
Y |
Walina |
Val |
V |
Tab. 2. Aminokwasy występujące w białkach
Alanina, A, Ala |
Arginina, R, Arg |
Asparagina, N, Asn |
kwas asparaginowy, D, Asp |
|
|
|
|
Cysteina, C, Cys |
Glutamina, Q, Gln |
kwas glutaminowy, E, Glu |
Glicyna, G, Gly |
|
|
|
|
Histydyna, H, His |
Izoleucyna, I, Ile |
Leucyna, L, Leu |
Lizyna, K, Lys |
|
|
|
|
Metionina, M, Met |
Fenyloalanina, F, Phe |
Prolina, P, Pro |
Seryna, S, Ser |
|
|
|
|
Treonina, T, Thr |
Tryptofan, W, Trp |
Tyrozyna, Y, Tyr |
Walina, V, Val |
|
|
|
|
Biologiczne znaczenie aminokwasów:
elementy składowe peptydów i białek
uczestniczą w budowie centów katalitycznych enzymów
są substratami, z których powstają niektóre hormony (np. adrenalina, noradrenalina, tyroksyna, serotonina, dopomina, melatonina)
są składowymi barwników biologicznych (np. melaniny i hemu)
uczestniczą syntezie drobnocząsteczkowych składników enzymów, zwanych koenzymami (np. koenzym A)
są przekształcane w przekaźniki sygnałów nerwowych (np. acetylocholina)
są substratami zużywanymi w biosyntezie puryn i pirymidyn - zasad występujących w nukleotydach i kwasach nukleinowych
powstają z nich niektóre elementy składowe fosfolipidów
szkielety węglowodorowe aminokwasów są zużywane do syntezy substratów energetycznych: glukozy lub ciał ketonowych