1. DNA o unikalnej sekwencji występujące w euchromatynie albo w heterochromatynie fakultatywnej.
Funkcja - transkrypcja na mRNA, tRNA i 5s rRNA.
2. DNA satelitarny charakteryzujący się wysoką powtarzalnością nukleotydów występujące w heterochromatynie obligatoryjnej zlokalizowanej w telomerach oraz okolicach centromerów.
Funkcja - regulacja aktywności genów, stabilizacja chromosomów'. Nie ulega transkrypcji.
To DNA stanowi 0,5 - 20%calego DNA, choć u niektórych gatunków stanowi 40 -60 % ogólnej ilości DNA.
3. rDNA charakteryzujące się znaczną powtarzalnością sekwencji nukleotydów. Stanowi fragment długiego łańcucha lub samodzielną cząsteczkę. Występuje w przewężeniu wtórnym chromosomu jąderkotwórczego (NOR) i części fibryllamej jąderka.
Funkcja - transkrypcja na pre rRNA.
ARL