Fagi lizogenne wbudowujg swój DNA do genomu komórki gospodarza (3a).
Taki zintegrowany z chromosomem bakteryjnym genom bakteriofaga nazywa się profagiem i podlega replikacji zgodnie z podziałami komórki gospodarza (3b).
Uwolnienie (wycięcie) profaga z genomu bakterii (3c) może nastgpić spontanicznie lub być zaindukowane czynnikami fizycznymi (np. światło UV) lub chemicznymi (np. mitomycyna C).