Nested PCR (wewnętrzny)
RT-PCR
PCR-RFLP (polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych)
Real-time PCR (w czasie rzeczywistym)
Multiplex PCR
Qantititative PCR (ilościowy)
Competitive PCR (konkurujący)
Touch-down PCR (hamowany)
RAPD-PCR (losowa amplifikacja polimorficznego DNA) Booster PCR (regulowany)
Race PCR