T4 DNA polimeraza w obecności tylko jednego z 4 dNTP ma aktywność 3’-5’ egzonukleazy i usuwa z jednoniciowego DNA nukleotydy których brak w roztworze reakcyjnym.
stop
TAG
TGA
TAA
stop or read through
XXXGGCTCTAACTCTCCTCT ------ CCGAGATTGAGAGGAGA
H
G 1 E G R (or nryy) 5ł GGTATTGAGGGTCGCATG— 3T CCATAACTCCCAGCGTAC--
Hill
3*
5*
Po dojściu na nici DNA do nukleotydu takiego samego jak znajdujący się w roztworze reakcyjnym aktywność T4 DNA polimerazy zmienia się z 3’-5’ egzonukleazowej na 5’-3’ polimerazową.
I T4DNApoUdGTPonly
Xa
JLM
I E G R ” (or imy>
GGT ATT GAGGGTCGCATG-
GCGTAC-
LIC Xa Insert
XXXGG
- CCGAGATTGAGAGGAGA
\
i
i
1 E 6 R * (or any) T C CGGT ATTGAGGGT CG C AT G — AGGCCATAACTCCCAGCGTAC —
| Annealing, Iransformation
XXXGGCT CT AACTCTCCT CT! -CCGAGATTGAGAGGAGA