W przebiegu somatycznej i zygoty ernej embrlogtnezy istnieję zasadnicze różnice:
1) zarodki zygotyczna in v!vo rozwijają sią w woreczku zalążkowym w wyniku fuzji gamet, natomiast somatyczna w naczyniach hodowlanych tzn. w warunkach In vitro;
Z) rozwijający sią prozarodek ulega procesom różnicowania prowadzącym do wykształcenia się osipądowo-korztmowej(tpikalno*bszalnaj1iwten sposób ulega przekształceniu z kulistego w spolaryzowany. W przypadku embriogenezy zygotycznej wpływ na ten procts ma pofómoćć komórki jajowej, natomiast w embriogenezie somatycznej nie obserwule sią bezpośredniego wpływu tkanki macierzystej, a poiarnosćzsrodka jest indukowana warunkami prowadzania kultury;
3} głobularna stadia zarodków somatycznych są większa nś zygotycznych;
4} zarodki zygotyczna znajdująca sią w stadium wcsetnoglobuiamym rozwijają tzw. wiesza ciałko, czyi* suspansor. Dostarcza ono zarodkowi substancje pokarmowych, a także jest miejscem syntezy stymulatorów wzrostu i fitohormonćw. Zarodki somatyczna nie wykształcają suspensors.