W celu zatrzymania translokowanego białka w błonie ER wykorzystywane są zarówno sekwencje sygnałowe, które ulegają odszczepieniu.jaki takie, które pozostają w strukturze transmembranowego białka
Te ostatnie nazywane są sekwencjami sygnałami kotwiczącymi (signalankor).
W zależności od umiejscowienia sekwencji kotwiczących w cząsteczce polipeptydu powstaje transmembranowe białko typu I lub II.
Sekwencje kotwiczące nie są rozpoznawane przez peptydazę sygnałowa.