P-oksydacja zużywa acylo-SCoA, który powstaje z wolnych kwasów tłuszczowych w cytoplazmie i jest transportowany do wnętrza mitochondrium dzięki karnitynie p-oksydacja produkuje wodór w postaci NADH i FADH2j który jest spalany w łańcuchu oddechowym dla produkcji AT P
p-oksydacja produkuje Acetylo-SCoA dla cyklu Krebsa.