Wydzielane przez mikroorganizmy wtórne metabolity, np. biosurfaktanty, egzopolisacharydy stanowią, dodatkowe źródło węgla, azotu i innych niezbędnych pierwiastków oraz związków.
W obrębie biofilmu
następuje różnicowanie poszczególnych komórek i dostosowanie ich do specyficznych funkcji, poprzez wydzielanie do środowiska biowarstwy specyf icznych cząsteczek autoinduktorów.