skanowanie0014 (78)

Struktura III -rzędowa.

Struktura IH-rzędowa określa wszystkie możliwe oddziaływania w ramach jednego łańcucha polipetydowęgo bez uwzględnienia oddziaływań pomiędzy głównymi atomami tworzącymi łańcuch polipetydowy.

w niej wszystkie możliwe oddziaływania - jonowe, atomowe^ Hydrofobowe, dwusiarczkowe i siłami Van der Waalsa.

Po uwzględnieniu oddziaływań związanych ze strukturami II i III rzędowymi Otrzymujemy kształt cząsteczki polipeptydowej.

Aminokwasy hydrofobowe będą grupov^ się w środku cząsteczki białka a na zewnątrz będę występowały aminokwasy hydrofitowe mogące oddziaływać z wodą.

Rys. 2-43. Struktura przestrzenna mioglobiny. białka przenoszącego tlen -w mięśniach,

A — schematyczny rysunek, przedstawiajmy konforma-cję szkieletu. Dwie helisy a w przedniej części rysunku —kolor zielony, pozostałe—pomarańczowy: grapa hercowa—czerwony, dwie krytyczne reszty histydynowe — niebieski. B — model przestrzenny mioglobiny przedstawiony w tym samym położenia, [Naiy&wano według; lmfen.pdb. H.C. W&tsm. Próg. Stereochem. 4(1969):299. Część A narysowano za pomocą programu graficznego MOLSCRIPT opisanego w: V. Eraufis. J. Appl Cryst. 2A(1991):94'6. Część B narysowano stosując program MCDAS opisany w; T. Femn, C Huang, L. Jarvk R. Langridge. 1 Moi Graphics 6(1988);13]