W tzw. tablicowych systemach ekspertowych wiedza może być rozproszona w kilku plikach, tzw. źródłach wiedzy. Każde ze źródeł wiedzy może przechowywać wtedy wiedzę służącą do rozwiązania innego podprobłemu.
W odróżnieniu od konwencjonalnych systemów, systemy ekspertowe nie zawierają jawnego opisu sposobu rozwiązania danego problemu (algorytmu). To system ekspertowy, a ściślej jego część zwana modułem wnioskującym rozwiązuje problem, wykorzystując wiedzę deklaratywną w bazie wiedzy.
Moduł wnioskowania realizowany jest najczęściej w oparciu o zasady logiki formalnej. W praktyce wykorzystywane są na ogół dwie metody wnioskowania: do tyłu (ang. backward chaining) oraz do przodu (ang. forward chaining). Czasami stosowane jest tzw. wnioskowanie mieszane, będące połączeniem w różnych proporcjach obu wymienionych metod.