Określanie kierunku zmian ewolucyjnych - definiowanie cech ancestralnych
Grupa zewnętrzna
Grupa zewnętrzna (lub lepiej kilka grup zewnętrznych) z definicji muszą łączyć się z naszą grupą wewnętrzną u jej nasady poniżej wspólnego przodka. Cechy, które definiują grupę wewnętrzna i są odmienne od grupy zewnętrzne) są cechami nowymi (wg. kladysłów apomorfiami). Cectry takie same jak u grupy wewnętrznej są cechami ancestralnymi (płezjomorficznymi) Jest to obecnie podstawowa metoda ustalania cech apomorficznych i plezjomorficznych dla sekwencji DNA
Fosylia
Jeśli mamy dobrze udokumentowane i zachowane dane fosylne (kopalne), co do których jesteśmy pewni, że są ancestralne w stosunku do grupy wewnętrznej, to rozumujemy analogicznie jak w przypadku grupy zewnętrznej.
Ontogeneza
Wczesne etapy rozwoju embrionalnego zdają się być podobne dla szerokiego spektrum organizmów Bardziej progresywne cechy, które defmiuj^różne taksony pojawiają się później w ontogenezie Jeżeli jest to rsze).
lo cechy ancestralne naszej grupy wewnętrznej powiruj pojawiają się na wczesnych etapach ontogenezy