biochemia wyk ad1 4

. Podział aminokwasów ze względu aa występowanie

białkowe

20 aminokwasów standardowych plus aminokwasy modyfikowane w polipeptydzie po procesie translacji jak np. hydroksylizyna, hydroksyprolitia, metyloarginina czy N-formy!ometionina. mebialkowe >

np. omityna cytrulina, P-alanina, homocystejńa, y-aminomaślan, d-aminokwasy

.

Podział standardowych aminokwasów białkowych ze względu na strukturę łańcucha bocznego (R)

z łańcuchem bocznym niepolarnym Gly, Ala,

Val, Leu, Ile,    »*

Met, Pro,

Phe, Trp.    ___

z łańcuchem bocznym polarnym nie wykazującym ładunku elektrycznego w pH =7 (fizjologicznym)

Cys, Ser, Thr, Tyr,

Asn, Gin

Z łańcuchem bocznym polarnym obdarzonym ładunkiem elektrycznym w pH —7

ujemnym (-): Asp, Glu dodatnim ( +): Arg, His, Lys

NI

....'i...

■    ■'{■■ kS.V;?-    ■ ,

i

I    ooor

!    M

*HJt—C — H

I

*

H

- n- • • -V • -4-, . ■ :■ •

OOO'

I

'HjN — C — H

CK,

n

i I

: t*.f<

... • i-z .....t. ■ •: •: ^v<

ifr

glicyna (Gly. G)

alanina (Ala. A)

COO"    COO"

/    I    •-    .•    I

'HjN—C — H    *HjN—C H

,CH    Oh

H3C CH3    CH

3Ł / \ *

H£_::Oh

V

walina    leucyrią

.Ą i >■

&

Podział standardowych aminokwasów białkowych ze względu na miejsce (organizm) gdzie dokonuje się ich biosynteza

egzogenne dla człowieka

Pochodzą od metabolitów powszechnie spotykanych w komórkach ludzkich ale niektóre enzymy niezbędne do przekształcenia tych prekursorów w aminokwasy egzogenne zostały utracone we wczesnych etapach ewolucji, najprawdopodobniej ze względu na dużą dostępność aminokwasów egzogennych w diecie; brakujące enzymy występują tylko w roślinach i mikroorganizmach.

Lys, Met, Thr - ich wspólnym prekursorem jest asparaginian,

Val, Leu - pochodzą od pirogronianu Ile - od pirogronianu i a-ketomaślanu Phe, Trp - od fosfoenolopirogronianu i erytrozo-4 fosforanu His - od fosforybozylopirofosforanu

Arg - ssaki są zdolne do syntezy tego aminokwasu ale prawie całą jego ilość wykorzystują w cyklu mocznikowym

% WL

■im

COO'

i ‘HjN-C-H

B    I .

H-C-CHj

i    -    CH*

!    I

!    CHj

r: k

izoleucyna

. (He. I)

^: p    •

•;k' p    '

i. -

COO"

I

*H₃N—o — h

s '

I

oh

metionina (Met. M)

(Val.V) .    (Leu. L)

• ' 'W

'

prolina (Pro

.......

ina

P)

■-fet-

" ■ w-

ii sv

m

endogenne dla człowieka

Gly, Ala, Pro, Ser, Asn, Gin, Tyr, Cys, Asp, Glu.

fenyloalarwna

(Phe. F)

JL &£......

COO'

NH

tryptofan (Trp. W)