Mendel w następnych eksperymentach badał dziedziczenie w krzyżówkach rodziców, różniących się jednocześnie dwoma parami cech przeciwstawnych.
Dotyczy ono dziedziczenia dwóch lub więcej cech i mówi, że cechy te dziedziczą się niezależnie od siebie (pary jednych alleli dziedziczone są niezależnie od cech innej pary alleli).
W parze czynników determinujących (określających) dziedziczoną cechę jeden czynnik zawsze jest dominujący, a drugi recesywny.