Pirogronian przy udziale dehydrogenazy pirogronianowej E1 ulega dekarboksylacji do pochodnej difosfotiaminy
Pochodna ta reaguje z lipoamidem będącym grupą prostetyczną drugiego enzymu tworzącego kompleks-acetylotransferazy dihydrolipoamidowej E2. Acetylolipoamid reaguje z CoA-SH, tworząc acetylo-CoA i zredukowany dihydrolipoamid
Zredukowany dihydrolipoamid jest ponownie utleniony przez dehydrogenazę dihydrolipoamidową E3 zawierającą FAD