Od 1990 r. Mobutu Sese Seko musiał się liczyć z coraz silniejszą opozycją. Sytuacja Zairu w latach 90-ych znacznie się pogorszyła.
W sąsiedniej Rwandzie wybuchła wojna domowa. Masakra ludności Tutsi przez plemię Hutu spowodowała masową migrację -Tutsi uciekli m .in. do Zairu. Mobutu Sese Seko poparł jednak plemię Hutu i nakazał wojskom kongijskim usunięcie imigrantów z plemieniaTutsi co doprowadziło do wybuchu otwartej wojny domowej. Mobutu obalono. W 1997 r. nowym prezydentem został Laurent Kabila.
W 1998 r. wybuchła rebelia wspierana przez Ugandę i Rwandę, w której władzę przejęli Tutsi. Tym razem uchodźcy Hutu schronili się na terenie Konga. Żołnierze Rwandy w latach 1998, 2009 naruszali granice Konga by rozprawić się z rebeliantami. W konflikt między Hutu i Tutsi mieszają się również inne państwa: Angola, Uganda, Burundi.
Od 1998 r. konflikt ten we wschodniej części Konga pochłonął 5,5 miliona ofiar. Agendy ONZ donosząo masowych gwałtach, niewolnictwie seksualnym, wcielaniu siłą dzieci do armii, przypadkach kanibalizmu.
Uciekinierzy z wschodniej części Konga 2008 r.
www. wiadomość i. gazeta.pl