uporządkowane grupy poprzedzielane nieuporządkowanymi np. CD4 ([claster of ...])sklada się z 4 domen każda po 100 aminokwasów.
random coil
wiele białek zawira rejony dobrze zdefiniowanych struktur drugorzędowych poprzedzielanych segmentami ni powtarzaj ąych, nieuporządkowanych struktur
struktura III rzędowa
pozwala na urkycie reszt hydrofobowych przed polarnymi rozpuszczalnikiami i ekspozcyję polarnych na wolwent dla pożądanych interakcji. To zjawisko jest dla wielu badczy najsilnieszą termodynamiczną siłą napędową do fałdowania białek zbliżenie odległych aminokwasów pozwala tworzyć centra aktywne
trzeciorzędowa struktyra chymotrypsyny jest taka że gdy biako jest właściwie sfałdowane te 3 reszty są na tyle blisko że gdy oddziałują z sobą prowadząc skutecznie rozkład wiąznia peptydowego 195 ser 57 his...
strukury naddrugorzędowe
pewne kombinacje struktury drugorzędowej które często mają podobne funkcję. Noszą nazwę motywów (=sturktur) naddr np. helisa alfa oddzielnona zwrotem od rgugiej helisy alfa tworzy jednostkę helisa zwrto helisa motyw ten jest w wielu białkach wiążącch DNA
jednostki funkcjonalne białka
dyskrtene rejony wartej strukury trzeciorzędowej które są rozdzielone przez bardzije rozgągniete i przez to ruchoem ułożone np. wiele receptorów błonowych przenosi sygnały do wnętrza komórki przez związanie do nich zewnątrz komórkowych ligandów w odpowiedzi na wiązanie ligantu receptor przechodzi zmiany strukturane...
struktura IV rżedowa ułożenie podjednostek w stosunku do siebie to struktóra IV rz białak np.
proteaza hiv
heksokinaza
bakteryjna oksydaza cytochormowa 3 ludkza -//- 13
powinowactwo heu do tlenu zależyod IV rzędowej białka i od utlenowania grup hemowych pozostałych podj (kooperatywność z powodu tego Hb ma zawsze wszystkei 4 hemy związane z telnem
krystalogarficzna sturkura osky i deoksy hb wykazała zanczace różnice w ich strukturze IV rzędowej Wiązanie tlenu powduje zmiany dotyczny do wiązania ...
przez etap stanu przejściowego S++ w koym tworzy się bogaty w energię krótkowatrwały pośrednik warunkujący powstetnie produktu Jest to prawda także dala reakcji katalizowanej przez enzym.
wiadomo dzięki badnaią widma UV fluorestencji i NMR w przypdaku urzyżych enzymów w mikroskopie elektronowym
E+ S — ES++ ~ EP~E+P