%6+C = (nG + nC)/(nA + nT + nC + nG) *100%
W obrębie rodzaju różnice w % molowych G+C nie mogą przekroczyć 10%
Klucz Berge/a dotyczy tylko bakterii!!
Metody klasyczne - Procaryota
- morfologia komórki
- skład chemiczny ściany komórkowej
- obecność inkluzji komórkowych i substancji zapasowych
- interakcje z innymi organizmami
- środowisko występowania
- patogenność
- wrażliwość na antybiotyki
- charakterystyka temperaturowa, pH
- stosunek do tlenu
- skład i ilość produktów fermentacji
- wymagania pokarmowe
- zdolność do tworzenia pigmentów Metody biologii molekularnej - Procaryota
- analiza ilościowa kwasów nukleinowych (%G+C)
- homologia kwasów nukleinowych Sekwencja polinukleotydów 16S rRNA Metody klasyczne - Eucaryota
- sposób rozmnażania generatywnego
- patogenność
- ekologia
- budowa ściany komórkowej
- osmotolerancyjność i osmofilność
- czynniki pokarmowe
- tworzenie ureazy - drożdże
- zdolność do wytwarzania pseudogrzybni lub grzybni
- tworzenie pigmentów
- cechy hodowlane populacji
- sposób rozmnażania wegetatywnego
- cechy morfologiczne komórki.
Metody biologii molekularnej - Eucaryota Takie same jak u Procaryota Sekwencja polinukleotydów 18S rRNA
Metody biochemiczne - polegają na określeniu zdolności mikroorganizmów do asymilacji, fermentacji lub rozkładu określonych związków chemicznych.
Cechy biochemiczne określa się na podstawie reakcji chemicznych zachodzących w odpowiednio skomponowanych pożywkach wzrostowych. Wyniki testów biochemicznych odczytuje się makroskopowo:
- wzrost lub jego brak
- reakcja barwna po wprowadzeniu odczynnika reagującego z wytwarzanym metabolitem
- na podstawie reakcji chemicznej Metody biofizyczne