splajsosomu. Kompleks ten charakteryzuje się tym, że wszystkie 3 pozycje są blisko siebie i dzięki temu mogą zachodzić oddziaływania pomiędzy tymi miejscami.
Dlaczego eezony nie sa gubione?
Nie wiadomo do końca dlaczego.
Ważną rolę podczas określania precyzyjności składania spełniają białka SR, ponieważ domeny C-końcowe tych białek zawierają domeny bogate w Ser i Arg.
Stymulują one działanie SF1 i U2AF. Na tych białkach budowany jest ten kompleks.
Białka SR rozpoznają sekwencje ESE (egzonowy wzmacniacz składania), które są położone w egzonie. Białka SR oddziałują z kompleksem angażującym.
Bez tych białek formowanie kompleksu nie jest efektywne, czego dowodzi między innymi dystrofia mięśniowa - mutacja w genie kodującym ESE.
Sekwencje egzonowe są krótsze.
Niektóre białka SR (białka CASP - białka typu SR wiążące się z CTD) wiążą się z kompleksem preinicjacyjnym i transkrypcyjnym.
Dowodzi to tego, że transkrypcja i splajsing są procesami zależnymi od siebie.
Alternatywny splaising.
Powstawanie różnych tran skryptów na podstawie tej samej informacji genetycznej.
Nie zachodzi on dla wszystkich genów
Im bardziej organizm jest złożony, tym jest on bardziej powszechny.
Daje on różne produkty białkowe przy tej samej informacji genetycznej.
W genomie człowieka ok. 35% genów podlega alternatywnewu splajsingowi.
Przykłady:
- proces determinacji płci u muszki owocowej.
Jest to proces wieloetapowy, pierwotnym genem jest gen sxl.
Gen ten może podlegać splajsingowi na 2 sposoby.
Egzon 3 może pozostać w dojrzałym transkrypcje wycięty na 2 sposoby:
Sex muchy jest określany przez splajsing alternatywny.
a. Egzon 3 nie jest usuwany - ślepa uliczka - samiec
b. Egzon 3 jest wycinany - powstaje białko SXL (noi samica powstaje)
Białko to wiąże się z intronem. Kiedy związany jest z transkryotem powoduje to wybór krytycznego miejsca składania. U2Af“ wiąże się przez to nie w standardowym miejscu, tylko wiąże się w egzonie. Powstaje produkt TRA.
Funkcja TRA
Bierze udział w kolejnym alternatywnym splajsingu. Oddziałuje z białkami SR. Dalej potem to wszystko wiąże się z egzonem 4. To oddziaływanie powoduje wybór takiego miejsca składania, że transkrypt jest specyficznym tran skryptem dla samicy.
Powstaje białko DSX (zarówno u M, jak i K)
DSX - double sex.
- 2 przykład - dotyczy genu sio - koduje białko ludzkie występujące w błonie - odpowiedzialne za wpływ i wypływ jonów potasowych.
Gen ten ma 35 egzonów. W splajsingu alternatywnym bierze udział 8. Są tam różne kombinacje. Do tej pory stwierdzono, że może powstać 500 produktów. Te białka determinują właściwości słuchowe w uchu komórek włoskowych Trans-soalising
U niektórych organizmów - splajsing RNA w układzie trans, sekwencje łączone ze sobą pochodzą z różnych RNA. Proces ten nie jest powszechny, zachodzi w chloroplastach, u C. elegant i w pasożytach kręgowców.
Krótki odcinek liderowy jest dołączany do 5' końca tan skryptu, transkrypt dostarczający ten odcinek to transkrypt liderowy.
Proces ten jest podobny do procesowania GU-AG. Nie powstaje tu lasso, tylko struktura widełkowa. Niektóre z tran skryptów zawierają więcej niż 1 gen - policistronowe mRNA.