Model białka HSP
-domena o aktywności ATP -domena wiążąca peptyd - koniec amidowy -koniec karboksylowy
Synteza i kierowanie białek sekrecyjnych w komórkach bakteryjnych:
• Sekrecyjne białka po syntezie na terenie cytoplazmy mogą być kierowane podobnie jak w organizmach eukariotycznych
• Mechanizm podobny do mechanizmu u eukariontów z różnicą, że komórka bakteryjna nie ma retikulum endoplazma tycznego- mechanizm uproszczony
• Syntetyzowane białka na terenie komórek bakteryjnych są chronione przez cha perony-jest bardziej intensywne niż w kom eukariotycznych
Synteza peptydu bez udziału maszynerii translacyjnej - Gramicydyna S
> Synteza peptydu bez udziału rybosomy, mRNA, tRNA, czynników translacyjnych
> Gramicydyna S- peptyd który powstaje bez udziału takich czynników j.w
> Gramicydyna S zbudowana jest z 2-ch identycznych pięcio aminokwasowych łańcuchów peptydowych połączonych ze sobą przeciwległymi końcami - wiązania peptydowe
> Gramicydyna S jest antybiotykiem produkowanym przez bakterie Bacillus Brevis
> W skład Gramicydyny wchodzą: fenyloalanina, prolina, walina, ornityna, leucyna
Aparat syntetyzujący gramicydynę składa sie z 2-ch systemów enzymatycznych:
1) E I- masa cząsteczkowa około 180 kDa. System ten aktywuje wszystkie aminokwasy poza fenyloalaniną
2) E II masa cząsteczkowa około 100 kDa. System ten aktywuje fenyloalaniną
• Systemy te aktywują aminokwasy i ułatwiają połączenie grupy aminowej z karboksylową
• Aktywowane aminokwasy w obecności systemów aktywacyjnych łączą się tioestrowo z jednym albo drugim systemem a nie z tRNA
• W obecności systemu E II aktywowana fenyloalanina tworzy pierwsze wiązanie peptydowe między swoją gr karboksylową a aminową następnego aminokwasu . pozostałe aminokwasy tworzą wiązanie peptydowe między sobą
• Po zsyntetyzowaniu 5 aminokwasowego peptydu, peptydy łączą się z drugim takim samym syntetyzowanym peptydem tworząc kolistą formę peptydową
Degradacja białek
Dwa podstawowe sposoby degradacji białek w komórce: System lizosomalny