4615488401

ZAGADNIENIA DO EGZAMINU WSTĘPNEGO NA STUDIA DOKTORANCKIE Z BIOCHEMII, BIOFIZYKI I BIOLOGII MOLEKLARNEJ NABÓR 2012/2013

ZAGADNIENIA Z BIOCHEMII

I.    Molekularne składniki komórki

1.    Woda, roztwory wodne, pH, równowagi jonowe.

2.    Termodynamika układów biologicznych.

Podstawowe koncepcje termodynamiczne. Fizyczne znaczenie własności termodynamicznych. Znaczenie procesów sprzężonych dla funkcjonowania organizmów. Biomolekuły wysokoenergetyczne.

3.    Aminokwasy.

Kwasowo-zasadowe własności aminokwasów. Reakcje chemiczne aminokwasów. Aktywność optyczna, stereochemia i spektroskopowe własności aminokwasów. Rozdział i analiza mieszanin aminokwasów.

4.    Białka.

Białka jako liniowe polimery aminokwasów. Architektura cząsteczek białek. Nieaminokwasowe ugrupowania w białkach. Białka złożone.

Reakcje peptydów i białek. Oczyszczanie białek z mieszanin.

Analiza sekwencji aminokwasów. Siły utrzymujące strukturę przestrzenną białka. Struktury drugorzędowe. Zwijanie białek i struktura trzeciorzędowa. Oddziaływania podjednostek i struktura czwartorzędowa. Fizykochemiczne metody badania struktury przestrzennej białek. Różnorodność funkcji białek.

5.    Węglowodany i pochodne monosacharydów.

6.    Lipidy, steroidy i eikozanoidy.

7.    Błony biologiczne i powierzchnia komórki.

8.    Transport substancji przez błony biologiczne.

Pasywna dyfuzja. Dyfuzja ułatwiona. Układy transportu aktywnego.

Procesy transportu napędzane ATP. Procesy transportu napędzane światłem. Procesy transportu napędzane gradientami jonów. Antybiotyki jonoforowe.

9.    Nukleotydy.

10.    Struktura kwasów nukleinowych.

Struktura pierwszorzędowa kwasów nukleinowych i metody jej analizy. Struktura drugorzędowa DNA. Denaturacja i renaturacja DNA.

Trzeciorzędowa struktura DNA. Struktura chromosomu.

Drugorzędowa i trzeciorzędowa struktura RNA.

II.    Dynamika białek

1.    Kinetyka enzymatyczna.

2.    Specyficzność enzymów i mechanizmy ich działania katalitycznego.

3.    Kontrola (regulacja) działania enzymów.

4.    „Silniki” molekularne.

III.    Metabolizm i jego regulacja

1.    Glikoliza, szlak fosforanów pentoz i glukoneogeneza.

2.    Cykl kwasów trikarboksylowych.

1