5. Metody oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów (dyfuzyjno-krążkowa, E-testy, MIC, MBC). Metody liczenia drobnoustrojów. Metody typowania drobnoustrojów. Stosowanie zestawów komercyjnych w diagnostyce mikrobiologicznej.
6. Metody diagnostyki molekularnej w mikrobiologii - rodzaje i znaczenie plazmidów naturalnie występujących w bakteriach; analiza wzorów plazmidowych; PCR i jej odmiany. Metody molekularne w epidemiologii: RAPD, RFLP, PFGE, rybotypowanie. Diagnostyka drobnoustrojów trudnych w hodowli z wykorzystaniem metod molekularnych.
7. Rodzaj Mycobacterium - ogólna charakterystyka, najważniejsze gatunki, chorobotwórczość,
diagnostyka, lekowrażliwość. Drobnoustroje wywołujące choroby przenoszone drogą płciową.
8. Rodzaj Staphylococcus - ogólna charakterystyka, najważniejsze gatunki, chorobotwórczość, diagnostyka, lekowrażliwość, mechanizmy oporności na antybiotyki. Rodzaj Micrococcus - ogólna charakterystyka, różnicowanie z rodzajem Staphylococcus.
9. Rodzaje: Streptococcus, Enterococcus - ogólna charakterystyka, najważniejsze gatunki, chorobotwórczość, diagnostyka, lekowrażliwość, mechanizmy oporności na antybiotyki.
10. Rodzaje Corynebacterium, Listeria - ogólna charakterystyka, najważniejsze gatunki, chorobotwórczość, diagnostyka.
11. Grzyby - ogólna charakterystyka, najważniejsze gatunki, chorobotwórczość, diagnostyka, lekowrażliwość. Zasady postępowania z materiałem klinicznym pobieranym do badań mykologicznych.
12. Rodzaj Bacillus. Beztlenowce - ogólna charakterystyka, najważniejsze gatunki, chorobotwórczość, metody hodowli, diagnostyka, lekowrażliwość. Zasady postępowania z materiałem klinicznym pobieranym w kierunku beztlenowców.
13. Gram-ujemne pałeczki niewybredne: fermentujące (rodzina Enterobacteriaceae) i niefermentujące oraz Gram-ujemne pałeczki wybredne - ogólna charakterystyka, najważniejsze rodzaje i gatunki, chorobotwórczość, diagnostyka, lekowrażliwość, mechanizmy oporności na antybiotyki.
14. Diagnostyka zakażeń układowych.
15. Analiza mikrobiologiczna materiałów klinicznych.
16. Praca przyszpitalnego laboratorium mikrobiologicznego - organizacja pracy w laboratorium, tok badania mikrobiologicznego, automatyzacja, metody serologiczne i genetyczne. Zakażenia szpitalne.
Uwaga: już na pierwszych ćwiczeniach studenci muszą posiadać fartuchy ochronne, które przez czas trwania ćwiczeń pozostają w Zakładzie.
FORMY KONTROLI I OCENA WYNIKÓW NAUCZANIA Metody oceny pracy studenta (forma i warunki zaliczenia przedmiotu)
1/ Kolokwia testowe i pisemne.
2/ Egzamin pisemny w sesji egzaminacyjnej.
Warunkiem zaliczenia ćwiczeń i dopuszczenia do egzaminu
1. jest zdanie obowiązujących kolokwiów:
I - z mikrobiologii ogólnej
II - z metod molekularnych (genetycznych) stosowanych w diagnostyce mikrobiologicznej,
III - z podstawowej wiedzy o antybiotykach i ich mechanizmach działania
IV - z mikrobiologii lekarskiej
V - z wiedzy o mechanizmach oporności drobnoustrojów na antybiotyki
VI - z badań materiałów klinicznych.
2. Wykonanie wszystkich ćwiczeń przewidzianych w programie.
3. Przedstawienie i zaliczenie raportów z badań materiałów klinicznych.
Kolokwia I-V w I i II terminie są testowe, kolokwium VI jest pisemne.
Kolokwia I, II i III i podobnie kolokwia IV i V są ze sobą połączone (odbywają się w jednym, uzgodnionym ze studentami, terminie). W przypadku niezaliczenia ćwiczeń z powodu niezdania jednego lub kilku kolokwiów w I i/lub II terminie, student może wystąpić do dziekana o warunkowe dopuszczenie do sesji egzaminacyjnej (za zgodą kierownika Zakładu Mikrobiologii Farmaceutycznej). Istnieje wtedy możliwość uzyskania kolejnego terminu na poprawę niezaliczonych kolokwiów i przystąpienia do egzaminu.
16