1629289698

Tytuł przedmiotu: Tytuł angielski: Prowadzący: Katedra, zakład: Wymiar godzin: Rodzaj zajęć: Status zajęć: Semestry: Godziny:

Punkty ECTS:

ANALIZA PROTEOMU

Proteome Analysis

Dr Paweł Kaszycki, dr Anna Kostecka - Gugała Katedra Biochemii, WO 15 h wykładów / 30 h ćwiczeń Wykłady, ćwiczenia laboratoryjne

I	II	III
15/30	-
4	-

Określenie przedmiotów wprowadzających wraz z wymaganiami wstępnymi:

Uczestniczyć mogą wszyscy studenci, którzy zaliczyli podstawowy kurs biochemii. Wskazana znajomość elementów analizy instrumentalnej oraz podstawowych metod stosowanych w biochemii analitycznej. Zalecane odbycie kursów z podstaw proteomiki, chemii białek, analizy instrumentalnej.

Założenia i cel przedmiotu: Przedmiot „Analiza proteomu” przewidziany jest jako kontynuacja i rozwinięcie kursu „Podstawy proteomiki” realizowanego na III roku studiów I stopnia kierunku: Biotechnologia. Celem kursu jest zapoznanie studentów z metodami mapowania i identyfikacji białek stosowanych w analizie proteomicznej, poznanie różnych, alternatywnych schematów postępowania podczas tej analizy, jak również zaznajomienie się z nowymi kierunkami rozwoju proteomiki oraz z konkretnymi przykładami analizy proteomu w badaniach o charakterze poznawczym i aplikacyjnym. Ćwiczenia obejmują mapowanie białek metodą dwukierunkowej elektroforezy oraz elementy analizy funkcjonalnej proteomu: zymografię enzymów indukowanych stresem komórkowym, a także wstępne obserwacje mechanizmów regulacji wybranych szlaków metabolicznych.

Metody dydaktyczne/nauczania: Dwugodzinne wykłady, podczas których realizowany jest program kursu przedstawiony studentom w postaci konspektu tematycznego. Studenci otrzymują też materiały dydaktyczne będące kompilacją treści z wykładów w celu ułatwienia przygotowania się do egzaminu. Ćwiczenia odbywają się w czterech blokach po 7,5 godziny, w czasie których realizowany jest szczegółowo ustalony z każdą z grup, konkretny projekt badawczy. Podczas ćwiczeń przewidziane są krótkie seminaria poświęcone tematyce prac laboratoryjnych oraz omówieniu bieżących problemów analitycznych.

Kryteria oceny: Ezamin pisemny z części wykładowej; zaliczenie z ćwiczeń na ocenę, na którą składa się sprawozdanie sporządzone w postaci raportu naukowego z przeprowadzonych badań oraz aktywność i zaangażowanie w pracy laboratoryjnej.

Forma i warunki zaliczenia: Egzamin na ocenę z części wykładowej, zaliczenie na ocenę z ćwiczeń.

Treści programowe przedmiotu:

Wykłady: Treść wykładów wprowadzających do przedmiotu obejmuje: definicję proteomiki oraz określenie zakresu merytorycznego tej dziedziny badawczej, omówienie podejść badawczych w analizie proteomicznej (podejście „bottom-up” z zastosowaniem analizy MudPIT - Multidimensional Protein Identification Technology oraz „top-down”). Przypomniane zostaną podstawowe metody i techniki badawcze proteomiki: elektroforeza, spektrometria masowa MS, podstawy frakcjonowania oraz zarys problematyki badań strukturalnych i funkcjonalnych białek. Szczegółowemu krytycznemu omówieniu poddana będzie dwukierunkowa elektroforeza (2DE): problemy badawcze metody, jej potencjał, ograniczenia oraz kierunki rozwoju i doskonalenia. Studenci poznają specyficzne wymagania