1950083554

STRESZCZENIE

Niniejsza praca ma na celu wprowadzenie w tematykę badania ekspresji genów za pomocą technologii mikrotablic. Objaśnia podstawowe pojęcia charakterystyczne dla dziedziny oraz przedstawia ogólny sposób prowadzenia eksperymentów.

Najistotniejszą częścią pracy jest propozycja ścieżki analizy danych uzyskiwanych z doświadczeń. Obejmuje ona statystyczne badanie znaczenia genów, dyskretyzację wartości ciągłych, wyznaczanie reduktów oraz wzorców wyskakujących. Celem obliczeń jest porównanie wyników otrzymywanych przy stosowaniu różnych metod w zakresie oceny pojedynczych genów oraz znajdowania grup genów powiązanych. Jednocześnie przeprowadzone są rozważania formalne i eksperymentalne dotyczące pojęcia reduktu i wzorca wyskakującego.

Istotnym elementem pracy jest aplikacja Microarray Analyser. Pozwala ona na analizę danych zgodnie z opisaną ścieżkę analizy. Implementacja obejmuje wszystkie przedstawione w pracy algorytmy.

Słowa kluczowe: ekspresja genów, mikromacierz, analiza wariancji, redukt, wzorzec wyłaniający

Finding of associated genes groups using microarray technology ABSTRACT

The purpose of this thesis is to present the topie of gene expression analysis using microarray technology. It explains the principals of the domain and gives an outlook for and experiment conducting.

The most significant part contains a proposition of an analysis path for the data obtained in experiments. It comprises of statistical evaluation of gene importance, discretisation of continuous values, finding of reducts and emerging patterns. The main idea is to compare results of different methods in problems of gene evaluation and associated genes groups finding. The notions of reduct and jumping emerging pattem are taken under formal and experimental consideration.

The important part of this thesis is Microarray Analyser application. It allows conducting analysis according to the described path. Ali presented algorithms are covered by the implementation.

Key words: gene expression, microarray, analysis of variance, reduct, emerging pattem

3