Obrót ładunków tranzytowych w 2013 r. wyniósł 11,6 min ton i zwiększył się w porównaniu z rokiem poprzednim o 70,8 %. Najwięcej ładunków tranzytowych przeładowano w portach: Gdańsk (67,2 %), Świnoujście (25,4 %) oraz Szczecin (7,2 %). Wzrost obrotów ładunków tranzytowych odnotowano w porcie Gdańsk (2-krotny), Świnoujście (o 37,8 %), natomiast spadek - w Szczecinie (o 30,6 %) oraz Gdyni (o 9,3 %). Przywóz ładunków tranzytowych wzrósł 2-krotnie w porównaniu z 2012 r., a wywóz - o 36,0 %.
Największą część ładunków tranzytowych stanowiły kontenery duże (50,9 %) oraz ładunki masowe suche (16,7 %, w tym rudy i złom - 11,6 %) oraz ładunki masowe ciekłe (15,8 %, w tym ropa naftowa - 15,6 %). Największy wzrost przeładunku ładunków tranzytowych w porównaniu z rokiem poprzednim dotyczył ropy naftowej (800-krotny), rudy i złomu (5-krotny), kontenerów dużych (o 88,0 %) oraz innych suchych ładunków masowych (o 43,2 %), natomiast największy spadek - innych ładunkach drobnicowych (o 53,8 %), wyrobów z żelaza i stali (o 51,1 %) oraz węgla i koksu - (o 43,7 %).