■ Klasyczna mikroskopia świetlna i fluorescencyjna.
■ Mikroskopia elektronowa.
■ Agarozowa i poliakrylamidowa elektorforeza żelowa.
■ Cytochemia, immunocytochemia i metody „immunoblot”.
■ Spektrofotometria i mikrocytofotometria.
Chromatografia cienkowarstwowa i jonowymienna oraz sączenie molekularne.
Analizy ilościowe metabolitów komórkowych, a w tym kwasów nukleinowych, cukrów, białek, hormonów roślinnych i aktywności enzymatycznej.