background image

1.  Trawienie pokarmów 

Trawienie zaczyna się już w jamie ustnej, pokarm jest wstępnie rozkładany przez enzymy zawarte w ślinie 

przy  pH  7.  Amylaza  ślinowa  rozkłada  wielocukry  na  dwucukry,  a  skrobię  na  maltozę.  Maltaza  rozkłada 

maltozę na glukozę, a Lizozym rozrywa wiązania glikozydowe.  

Trawienie    w  żołądku  odbywa  się  za  udziałem  soków  żołądkowych  przy  pH  1,5.  W  soku  znajdują  się 

enzymy takie jak; pepsyna, która skraca długoś łańcucha aminokwasów,  renina, produkowana jest tylko u 

młodych ssaków, Kazeina i parakazeina łączy się jonami wapnia i wytrąca z roztworu, Lipaza żołądkowa 

działa na tłuszcze.  

Trawienie w jelicie cienkim rozpoczyna się w dwunastnicy przy pH 8,5. Nie posiadają własnych enzymów, 

ale pobiera je z wątroby i trzustki. W wątrobie produkowana jest żółć, która emulguje tłuszcze, rozbija je 

w  zawiesiny  mikrokropelek,  Trzustka  produkuje  trypsynę,  chymotrypsynę,  lipaze  trzustkową  oraz 

amylazę trzustkową.  

2.  Rola gruczołów układu trawiennego 

Wyróżniamy  gruczoły  przyścienne  –  mają  mikskopijne  wymiary,  znajdują  się  w  ścianach  przewodu 

pokarmowego.  Zaliczamy  tu  gruczoły  żołądkowe)  wydzielają  sok  żołądkowy),  gruczoły  dwunastnicy 

(wydzielają sok dwunastniczy), Gruczoły jelitowe (sok jelitowy). Mamy też gruczoły pozaścienne takie jak; 

ślinianki  w  jamie  ustnej,  wątroba  i  trzustka.  W  skład  soków  trawiennych  wchodzi  woda,  enzymy, 

elektrolity oraz organiczne i nieorganiczne związki. W ciągu doby przewód wydziela ok.8-10L soku.  

3.  Enzymy trawienia białek, tłuszczów, węglowodanów i mechanizmy wchłaniania  

Trawienie  białek  –  białka  są  denaturowane  przez  soki  żołądkowe,  pepsyna  rozczepia  wiązania 

peptydowe, Endopeptydazy (trypsyna, chemotrypsyna, elastaza) katalizuje rozpad specyficznych wiązań 

peptydowych  w  jelicie,  Egzopetydazy  usuwają  końce  aminokwasów.  Gdy  „ścinają”  N-końce  są  to 

aminopeptydazy,  a  gdy  C-koniec  są  to  karboksypeptydazy,  aminokwasy  wchłaniają  się  przez  błonę 

śluzową jelita.  

Trawienie  tłuszczy  –  są  emulowane  przez  sole  kwasów  żółciowych  co  ułatwia  dalsze  trawienie  przez 

enzymy.  Odbywa  się  w  jelicie  cienkim  głównie  przez  lipaze  trójglicerydową.  Lipazy  są  stymulowane 

przez jony magnezu, kolipazę, fosfolipazę, sole kwasów żółciowych. Odcinają kolejne kwasy tłuszczowe 

aż  do  powstania  glicerolu  oraz  2-monoacyloglicerolu.  Chylomilrony  odpowiadaj  za  transport 

triglicerydów  z  jelita  do  mięśni  i  nerek,  serca,  mózgu  itp.  VLDL  są  przenośnikami  triacyloglicerole  

endogenne,  LDL  są  przenośnikami  cholesterolu  i  jego  estrów.  HDL  –  odpowiedzialny  jest  za  transport 

zwrotny cholesterolu z tkanki do wątroby.  

background image

Trawienie cukrów – rozpoczyna się w jamie ustnej, sacharydy rozkładają się przez amylazę ślinową do 

oligosacharydów,  które  następnie  są  przez  oligosacharydazy  oraz  disacharydazy  rozkładane  do 

monocukrów, a one są wchłaniane do komórki na drodze transportu wtórnego aktywnego.  

Produkty  trawienia  są  wchłaniane  przez  błony  komórkowe  nabłonka  jelitowego  do  krwi  (aminokwasy, 

cukry)  do  limfy  (witaminy,  produkty  rozkładu  tłuszczów),  do  jelita  grubego  (woda,  sole  żółciowe).  W 

jelicie cienkim występują kosmki, które zwiększają powierzchnię chłonną jelita do ok. 10m

2

. Kosmyki są 

zaopatrzone  w  naczynia  krwionośne  oraz  limfatyczne.  Wchłanianie  odbywa  się  przez  pory  w  błonie 

kosmka w procesie transportu aktywnego.  

4.  Ogólny schemat katabolizmu i anabolizmu 

 

5.  Fazy katabolizmu 

Składa się z trzech faz;  Faza 1- Substancje takie jak Tłuszcze białka, polisacharydy są trawione w układzie 

pokarmowym do mniejszych cząsteczek.  Faza 2- Wcześniej rozdrobnione cząsteczki są transportowane i 

trawione go jeszcze mniejszych cząsteczek, głównie Acetylko-CoA podczas tych przemian uwalniana jest 

niewielka  ilość  energii  swobodnej.    Faza  3-  Acetylo-CoA    jest  utleniany  w  cyklu  Krebsa,  podczas  tego 

procesu powstaje duża ilość energii swobodnej. Produktami końcowymi jest CO

2

 i H

2

O.  

background image

6.  Związki makroergiczne 

Guanozynotrifoforan  (GTP)  –  dostarcza  energię  do  procesów  syntezy  białek  .  Jest  również 
modulatorem struktury przestrzennej białka. Cytrydynotrifosforan (CTP) – jest dawcą energii 

w  procesy  syntezy  lipidów.  Urydynotrifosforan  (UTP)  –  jest  wykorzystywany  w  procesach 
syntezy polisacharydów. fosfofenylopirogronian (PEP) 

Kreatynina  –  kwas  β-metyloguanidynooctowy  –  Kreatyna  jest  stałym  składnikiem  tkanki 
mięśniowej  i  odgrywa  zasadniczą  rolę  w  przemianach  chemicznych  powodujących  skurcz 
mięśniowy. Fosfokratynina wpływa stymulująco na anabolizm.  

Acetylko-CoA – acetylokoenzym A jest tioestrem, służy jako przenośnik grup acetylowych.  

7. 

 

Glikoliza i glikogeneza,

 

przebieg i zys energetyczny 

 

Glikoliza 

Glikogeneza  

Jest to szereg reakcji prowadzących do przekształcenia 

glukozy w pirogronian.  

Jest  to  proces  syntezy  glikogenu, 
cząsteczki  glukozy  są  dodawane  do 

kolejnych 

łańcuchów 

glikogenu. 

Wpływają na ten proces hormony takie 
jak; 

adrenalina, 

noradrenalina, 

insulina. 

FAZA I – PRZEKSZTAŁCENIE GLUKOZY W 1,6-

BISFOSFORAN 

Reakcja  1  –  Fosforylacja  glukozy  przy  udziale 

heksozokinaz.  ATP    ADP     

Glukoza  ⇔  Glukozo-6-

Fosforan

 

Reakcja 2 – izomeryzacja przy udziale izomerazy 

glukozofosforanowej.  

Glukozo-6-fosforan  

Fruktozo-6-Fosforan

 

Reakcja 3 – Fosforylacja przy udziale 
fosfofruktokinazy.  

Fruktozo-6-Fosforan  1,6-

Bisfosforan

 

FAZA II – PRZEKSZTAŁCENIE 1,6-BISFOSFORANU W 

PIROGRONIAN 

Proces ten przebiega tak samo jak 
glikoliza, jedynie trzy reakcje, które nie 
są odwracalne są inne.   

Reakcja 1- Glukoza jest przyłączana się 
z udziałem ATP i przemienia się pod 
wpływem heksokinay.  

Glukoza  Glukozo-6- fosforan 

Reakcja 2- W przemianie uczestniczy 
fosfoglukomutaza.  

 

Glukozo-6- fosforan  Glukozo-1-

Fosforan  

Reakcja 3 – w przmeianie uczestniczy 

background image

Reakcja 4- Zachodzi rozczepienie 1,6-bisfosforan przy 
udziale aldolazy.  

Fruktozo-1,6-bisfosforan  Fosforan 

dihydroksyacetonu, Gliceroaldehyd 3-fosforan

 

Reakcja 5- Izoreryzacja przy udziale izomerazy 
trizofosforanowej.  

Fosfodihydroksyaceton  Aldehyd 

3-fosfogliceryacetonowy (GAP)

 

Reakcja 6- Utlenienie przy udziale dehydrogenazy 
aledehydu fosfoglicerynowego.  

GAP ⇔ 1,3-

bisfosfoglicerynian

 

Reakcja 7- defosforylacja katalizowana przez kinazy 

fosfoglicerynowe.  

1,3-bisfosfoglicerynian ⇔ 3-

fosfoglicerynian

 

Reakcja 8- Przegrupowanie wewnątrzcząsteczkowe 
przy udziale fosfogliceromutazy.   

3-fosfoglicerynian 

⇔ 2-fosfoglicerynian

 

Reakcja 9- Przemiana przy udziale enolaz.  

2-

fosfoglicerynian ⇔ Fosfoenolopirogronian

 

Reakcja 10 – Tworzenie pirogronianu przy udziale kinaz 
pirogronianowych. 

Fosfoenolopirogronian  

Pirogronian

 

pirofosforylaza UDP- glukozy  

Glukozo-1-Fosforan  UDP-Glukoza  

Reakcja 

4- 

Zachodzi 

synteza 

glikogenowa  zachodzi  przeniesienie 
glukozy  z  UDP-glukozy  do  rosnącego 
łańcucha  polisacharydowego.  Reszty 
glukozy  dołanczane  są  do  grupy-  OH, 
tworząc wiązanie α-1,4-glikozydowe.  

  

2 ATP 

 

8.  Rola hormonów w regulację procesu 

Insulina  –  aktywuje  syntezę  glikogenową  i  kilka  enzymów  glikolizy.  Insulina  jest  wydzielana 
przez  trzustkę,  bierze  udział  w  metabolizmie  białek,  węglowodanów  i  tłuszczów.  Cząsteczka 
insuliny  łączy  się  z  receptorem  insulinowym.  Napływ  insuliny  do  krwi  odbywa  się  za 
pośrednictwem specjalnych przenośników GLUT.  Receptor insulinowy składa się z α-β-β-α jest 
to  heterotetramer  połączony  wiązaniami  siarkowymi.  Receptory  licznie  występują  na 
powierzchni komórek wątroby, mięśni i adipocytów.  

Glukagon  i  adrenalina  –  indukują  enzymy  glikogenazy  i  hamują  działanie  kinazy 
pirogronianowej. Wpływa na syntezę cAMP – hamuje syntezę i aktywuje rozkład glikogenu.  

background image

Kortyzol  –  indukuje  enyzmy  glukonogenezy  i  rozkład  aminokwasów  –  prekursorów 
glukonogenezy 

Enzymy  amylolityczne  –  rozkładają  skrobię,  glikogen  i  disacharydy  w  przewodzie 

pokarmowym.    Zaliczamy  tu  enzymy  należące  do  hydrolaz  zaliczamy  tu  α-amylazę  (rozkłada 
wiązania  α-1,4-glikozydowe  wewnątrz  łańcucha  polisacharydowego,  początkowo  tworzą 
dekstryny,  które  potem  maltozy  lub  izomaltozy)  ,  α-1,6-glikozydaza  (rozkłada  wyłącznie 
wiązania α-1,6-glikozydowe) , maltozalaktozasacharazaglukoamylaza (rozkłada wiążania 
α-1,4-glikozydowe  od  nieredukującego  końca  skrobi,  jako  produkt  daje  cząstkę  glukozy  i 
dekstrynę).  

Β-amylaza  – występuje na nasionach  różnych  roślin i rozkłada  skrobię w trakcie kiełkowania. 
Hydrolizują co drugie wiązanie α-1,4-glikozydowe produktami jest dekstryna i β-maltoza.  

9. 

 

Los pirogranianu i cykl Corich  

Tworzenie pirogronianu jest katalizowane przez kinaza pirogronianowa. Glikoliza  - oddychanie 

tlenowe  zachodzi  w    mitochondrium  wyróżniamy  tworzenie  acetylo-CoA,  które  wchodzi  do 
cyklu  Krebsa,  a  następnie  transport  elektronów  i  chemiosmoza  (pirogronian  acetylo-CoA 
dalsze  utleniane
).  W  oddychaniu  beztlenowym  pirogronian  po  glikolizie  ulega  fermentacji 
alkoholowej(pirogronian    aldehyd  octowy    etanol)    i  fermentacji  mleczanowej  ( 
pirogronian  mleczan).  

Fementacja  alkoholowa  –  pirogronian  ulega  dekarboksylacji  do  aldehydu,  który  jest 
redukowany do etanolu  przy utlenieniu NADH.  

Fermentacja  mlekowa-  pirogranian  jest  redukowany  d  mleczanu  przy  jednoczesnym 
utlenieniu NADH.  

Cykl Corich 

Inaczej jest to cykl kwasu mlekowego, jest to ciąg przemian,w których mleczan powstaje w 

beztlenowej  glikolizie  w  mięśniach  i  erytrocytach,  jest  transportowany  przez  krew  do 
wątroby. Tam jest przetwarzany w procesie glukonogenezy.  

10.  Ogólny schemat szlaku pentozo-fosforanowego i fazy tego procesu 

Szlak  pentozofosforanowy  ciąg  reakcji  biochemicznych,  podczas  których  glukozo-6-fosforan 

jest utleniany do rybulozo-5-fosforanu oraz wytwarzany jest NADPH. Reakcje szlaku zachodzą w 

background image

cytozolu. Przede wszystkim w tkance tłuszczowej, gruczołach mlecznych i korze nadnerczy oraz 
cytoplazmie i plastydach komórek roślinnych. 

Faza 1 – oksydacyjna.  

 Reakcja  1;  Uczestniczą  tu  dehydrogenaza  glukozo-6-fosforanowa

glukozo-6-fosforan  + 

2NADP

 6-fosfoglukono-δ-lakton+ NADPH+H+

  

Reakcja 2 – Uczestniczy tu 6-glukonolaktonaza.  

6-fosfoglukono-δ-lakton  6-fosfoglukonian + 

H+

  

Reakcja  3  –  Uczestniczy  tu  dehydrogenaza  6-fosfoglukonianowa

6-fosfoglukonian 

rybulozo-5-fosforan + NADPH

+

 + H

+

 + CO

Faza 2 – nieoksydacyjna  

Reakcja  1  –Uczestniczy  w  tym    izomeraza  pentozofosforanowa  . 

rybulozo-5-fosforan   

rybozo-5-fosforan

 

Reakcja  2-Uczestniczy  w  tym  epimeraza  pentozofosforanowa.     

rybozo-5-fosforan   

ksylulozo-5-fosforan

 

Reakcja  3-  Uczestniczy  w  tym  transketolaza

ksylulozo-5-fosforan+  rybozo-5-fosforan   

aldehyd 3-fosfoglicerynowy + sedoheptulozo-7-fosforan

 

Reakcja  4-  Uczestniczy  w  tym  transketolaza.   

sedoheptulozo-7-fosforan  +  aldehyd  3-

fosfoglicerynowy erytrozo-4-fosforan + fruktozo-6-fosforan

 

Reakcja  5-    Uczestniczy  w  tym  transketolaza

ksylulozo-5-fosforan  +  erytrozo-4-fosforan   

aldehyd 3-fosfoglicerynowy + fruktozo-6-fosforan

 

11. Ogólna  charakterystyka  procesów  oksydacji. 

-oksydacja  i  biosynteza  kwasów 

tłuszczowych nasyconych.  

α-oksydacja  -    polega  na  2  hydroksylacji  z  udziałem  oksygenazy mieszanej,  odwodornieniu  z 
udziałem  dehydrogenazy  zależniej  od  NAD

+

  i  dekarboksylacji  oksydacyjnej  powstałego  2-

oksokwasu dając kwas tłuszczowy o łańcuchu skróconym o 1 atom węgla.  

β-oksydacja-  jest  procesem  dostarczającym  równoważników  redukcyjnych  służących  w 
łańcuchu oddechowym wytworzeniu ATP,  acetylo-CoA do cyklu Krebsa służącemu wytworzeniu 

background image

ATP,    w  wątrobie  substratów  do  syntezy  ciał  ketonowych,  zwłaszcza  w  przypadku  zaburzeń 

gospodarki  cukrami.  U  eukariotów  zachodzi  w  macierzy  mitochondrialnej,  a  u  prokariotów  w 
cytoplazmie. Reakcje β-oksydacji polegają na takich przemianach by rozczepić "dłuższy" acylo-
CoA  na  acetylo-CoA  i  acylo-CoA  "krótszy",  po  czym  rozpocząć  proces  od  początku,  aż  do 
momentu  gdy  powstają  dwie  cząteczki  acetylo-CoA  w  przypadku  kwasów  tłuszczowych  o 
parzystej  liczbie  węgli  lub  propionylo-CoA  i  acetylo-CoA  w  przypadku  kwasów  o  nieparzystej 
liczbie węgli.  

Reakcja  1  –  Utlenienie,  za  pomocą  dehydrogenazy  acylo-CoA

acylo-CoA

   

trans-Δ2-enoilo-

CoA

 z wytworzeniem FADH2. 

Reakcja  2-    Uwodnienie 

trans-Δ2-enoilo-CoA

   

3-hydroksyacylo-CoA

  za  pomocą  enzymu 

hydrataza enoilo-CoA. 

Reakcja  3-  Utlenienie 

3-hydroksyacylo-CoA

     

3-ketoacylo-CoA

  za  pomocą  dehydrogenazy 

hydroksyacylo-CoA i z wytworzeniem NADH. 

Reakcja  4-   

Tioliza  3-ketoacylo-CoA

  przez  drugą  cząsteczkę  CoA  i  wytworzenie 

acylo-CoA

 

skróconego o dwa atomy węgla oraz 

acetylo-CoA

. Katalizatorem w tej reakcji jest β-ketotiolaza. 

ω-  oksydacja  –  w  jej  wyniku  powstają  krótkie  kwasy  dikarboksylowe,  zachodzi  w  retikulum 
endoplazmatycznym. est katalizowany przez monooksygenazęcytochromu P-450 używającą tlen 
O

2

 jako substratu. 

Biosynteza  nasyconych  kwasów  tłuszczowych  -  reakcje  biochemiczne,  prowadzące  do 
powstania kwasów tłuszczowych z jednostek acetylo-CoA, zachodzi w cytoplazmie 

Reakcja  1-    syntezy  jest  karboksylacja  acetylo-CoA  do  malonylo-CoA,  katalizowana  przez 
karboksylazę  acetylo-CoA.  Następnie  acetylo-CoA  łączy  się  z  białkowym  nośnikiem  grup 
acylowych (ACP), w wyniku czego powstaje acetylo-ACP, a z malonylo-CoA powstaje malonylo-
ACP. 

Reakcja  2  -  są  cykle  elongacji,  które  można  podzielić  na  4  fazy  (kondensacja,  redukcja, 
odwodnienie, redukcja).  

Faza  1-  Kondensacja  2-węglowego  acetylo-ACP  i  3-węglowego  malonylo-ACP  do  4-węglowego 
acetoacetylo-ACP. Podczas tej reakcji zostaje odłączony jeden ACP oraz CO2. Enzym katalizujący 
ten etap to enzym kondensujący acylomalonylo-ACP 

background image

Faza  2  -  Redukcja  acetoacetylo-ACP  do  D-3-hydroksybutyrylo-ACP,  podczas  której 
wykorzystywana jest jedna cząsteczka NADPH. Enzym - reduktaza beta-ketoacylo-ACP 

Faza  3-  Odwodnienie  D-3-hydroksybutyrylo-ACP  do  krotonylo-ACP.  Enzym-  dehydrataza  3-
hydroksyacylo-ACP 

Faza 4 -   Redukcja krotonylo-ACP do butyrylo-ACP, podczas której zostaje wykorzystana kolejna 
cząsteczka NADPH. Enzym: reduktaza enoilo-ACP 

12. Degradacja białka 

Proces  ten  może  zachodzić  trzema  drogami:  przez  układ  lizosomalny,  ubikwitynowy 
(proteasomowy) oraz cytoplazmatyczny (kalpainy). 

Degradacja w lizosomach – lizosomy odpowiadają za degradację białek, maja pH 5,0. Posiadają w 
sobie  enzymy  z  grupy  hydrolaz  umożliwiające  degradację.  Degradacja  białek  przebiega 
wieloetapowo,  przez  stopniowy  rozpad  struktury  białkowej.  Degradacji  ulegają  białka 
egzogenne i „długowieczne” białka endogenne, np. białka strukturalne. 

Proteasom  rozkłada  jedynie  białka,  które  uległy  „wyznakowaniu”  w  procesie  ubikwitynacji. 
Proces  ten  polega  na  przyłączeniu  do  cząsteczki  białka  mającego  ulec  destrukcji,  cząsteczki 
małego  białka  –  ubikwityny,  będącym  swoistym  znacznikiem  molekularnym.  Białka 

„wyznakowane”  cząsteczką  ubikwityny  kierowane  są  bezposrednio  do  proteasomów.  Taki 
mechanizm  umożliwia  wybiórczy  rozkład  białek,  które  nie  są  już  potrzebne.  W  proteasomach 
degradowane są białka krótkożyjace, np. enzymy, zawierające na N-końcu określoną sekwencję 
aminokwasów,  rozpoznawalną  przez  ubikwitynę  lub  białka,  które  zostały  wadliwie 
zsyntetyzowane. 

Kalpainy  są  nielizosomowymi  proteazami  cysteinowymi  występującymi  w  cytoplazmie 
komórek. Aktywność proteolityczna kalpain jest zależna od poziomu jonów Ca2+. Degradują one 

białka nieselektywnie. Obserwuje się raczej powinowactwo do trzeciorzędowej struktury białka 
niż  jego  sekwencji  aminokwasowej  (np.  sekwencji  sygnałowej  na  N-końcu)  oraz  do  białek  i 
peptydów  zawierających  aminokwasy  hydrofobowe  (leucyna,  walina  i  izoleucyna)  i 
aromatyczne (fenyloalanina i tyrozyna).  

13. Proteosoma i rola ubikwityny 

Proteasom  jest  kompleksem  białkowym  odpowiadającym  za  degradację  białek.  Występują  w 
jądrze  i  cytoplazmie.  Zdegradowane  białka  są  oznakowane  za  pomocą  małych  białek  tzw. 

background image

Ubikwityna. Jedna cząsteczka tego białka jest przyłączana za pomocą ligazy ubikwitynowej, co 

umożliwia  identyfikacje  białka  przeznaczonego  do  degradacji.  Proteasom  ma  kształt  beczki, 
składa się z czterech pierścieni ułożonych wokół centralnego porów. Każdy z tych pierścieni jest 
złożony z siedmiu pojedynczych białek. Dwa pierścienie wewnętrzne zawierają β podjednostek 
białkowych,  tworzących  miejsca  aktywne.  Dwie  zewnętrzne  pierścienie  zawierają  α 
podjednostkę,  którego  funkcją  jest  utrzymanie  "drzwi",  przez  które  można  wprowadzić  do 

białek  lufy.  Proteoliza  komórkowa  pełni  wiele  funkcji:  uaktywnia  bądź  unieczynnia  enzymy, 
moduluje wewnątrzkomórkowe przekazywanie sygnałów, usuwa nadmiar produktów syntezy, i 
co  najważniejsze,  rozkłada  egzogenne  i  niepotrzebne  endogenne,  a  także  nieprawidłowo 
zsyntetyzowane białka i peptydy 

Ubikwityna  –  to  małe  białko,  służy  do  degradacji  białek  jako  znacznik,  które  maja  ulec 
proteolizie.  Ubikwityna  jest  peptydem  złożonym  z  76  reszt  aminokwasowych.  Potranslacyjna 
modyfikacja białek w procesie ubikwitynacji polega na przyłączaniu do reszt lizynowych danego 
białka grupy karboksylowej C-końca reszty .  

14. 

 

Rozkład aminokwasów - procesy deaminacji, dekarboksylacji, rodziny aminokwasów.  

Deaminacja  -    inaczej  nazywana  dezaminacją,  polega  na  eliminacji  grupy  aminowej  –NH

2

,  z 

wydzieleniem amoniaku. Grupa aminowa często jest przekształcana do grupy ketonowej. Jest to 
pierwszy  proces  ich  degradacji  co  umożłiwia  wykorzystanie  tych  związków  potem  jako 
substratu oddechowego. W naturalnym środowisku nie wymaga obecności tlenu ale warunkiem 
jest  odpowiednia  ilość  azotanów  i  organizmów  nitryfikujących.  Przeprowadzana  jest  przez 
bakterie E. coli wytwarzające enzymy ureazy i Deaminazy.  

Dekarboksylacja –  jest to reakcja podczas, której dochodzi do usunięcia grupy karboksylowej z 
kwasów  karboksylowych,  ich  soli  lub  estrów.  α-dekarboksylacja  –  jest  to  odrywanie  grupy 

karboksylowej  przy  α-atomie  węgla,  ω-dekarboksylacja  charakterystyczna  tylko  dla 
mikroorganizmów.  

Rodziny aminokwasów;  

Aminokwasy powstające z α-ketoglutaranu, który pochodzi z cyklu kwasu cytrynowego. Do 
tej grupy należy tzw. rodzina glutaminianu: 

glutamina, prolina i arginina

 Aminokwasy powstające ze szczawiooctanu, który pochodzi z cyklu kwasu cytrynowego. Do 
tej  grupy  należy  tzw.  rodzina  asparaginianu: 

asparagina,  metionina,  treonina

  i 

lizyna

  oraz 

izoleucyna

.  

background image

 Aminokwasy  powstające  z  3-fosfoglicerynianu,  który  pochodzi  z  glikolizy.  Do  tej  grupy 
należy tzw. rodzina seryny; 

seryna, cysteina i glicyna

    Aminokwasy  powstające  z  pirogronianu,  który  pochodzi  z  glikolizy.  Do  tej  grupy  należy 
tzw. rodzina pirogronianu; 

alanina, walina i leucyna

    Aminokwasy powstające z fosfoenolopirogronianu, pochodzącego z glikolizy i erytrozo-4-
fosforanu,  pochodzącego  ze  szlaku  pentozofosforanowego.  Do  tej  grupy  należy  tzw.  rodzina 
aminokwasów aromatycznych; 

fenyloalanina, tyrozyna i tryptofan

    Aminokwas 

powstający 

rybozo-5-fosforanu

pochodzącego 

ze 

szlaku 

pentozofosforanowego; 

histydyna

15. Cykl Krebsa i jego rola.  

Ma  za  zadanie  dostarczenie  równoważników  redukujących  zamienianych  na  energię 
magazynowaną  w  ATP  w  łańcuchu oddechowym, dostarczać ma  także energie  w  postaci  GTP, 
oraz dostarczać ważnych prekursorów do syntezy innych cząsteczek.  Jest to końcowy wspólny 
szlakiem utleniania cząsteczek będących źródłem energii dla organizmu, takich jak białka, kwasy 
tłuszczowe, węglowodany.  

Głównym substratem cyklu jest Acetylo-CoA, powstaje z pirogronianu w reakcji katalizowanej 

przez kompleks dehydrogenazy pirogronianowej w mitochondriom.  

Pirogronian  Acetylo-

CoA.  

Drugim  substratem  jest  szczaiooctan  odnawiany  w  tym  cyklu,  pod  wpływem  karboksylazy 
pirogronianowej. 

Pirogronian  szczawiooctan

 

Reakcja  1  –Jest  to  proces  kondensacji,  który  katalizowany  jest  przez  syntezę  cytrynianu
Inhibitorami tego etapu są ATP. 

Acetylo-CoA + szczawiooctan + H

2

O  Cytrynylo-CoA  wolny 

koenzym A + cytrynian 

 

Rakcja  2  –  Dehydratacja  (odwodnienie,  uwodnienie)  uczestniczy  w  tym  enzym  akonitaza.  

Cytrynian  cis-Akonityna + H

2

O  izocytrynian

  

Reakcja  3-    Utlenianie  oraz  dekarboksylacja  uczestniczy  w  tym  enzym  dehydrogenaza 
izocytrynianowa

Izocytrynian + NAD

+

szczawiobursztynian +NADH

+

 +H

+

  α-ketoglutaran + 

CO

2

.

  

background image

Reakcja  4-    Zachodzi  dekarboksylacja  i  utlenianie przy  udziale  kompleksu  dehydrogenazy  α-
ketoglutaranowej

α-ketoglutaran + NAD + CoA  Bursztynylo-CoA +CO

2

 + NADH

.   

Reakcja  5-  Zachodzi  fosforylacja  substratowa  przy  udziale  Tiokinazy  bursztynianowej

Bursztynylo-CoA +Pi +GAD  Bursztynian +GTP +CO

2

 

Reakcja  6  –  Utlenianie  przy  udziale  dehydrogenazy  bursztynianowej

Bursztynian  +  FAD   

Fumaran + FADH

2

.

  

Reakcja 7- Zachodzi addycja przy udziale fumarazy

Fumaran + H

2

O  Jabłczan

  

Reakcja  8  –  Utlenianie  przy  udziale  dehydrogenazy  jabłczanowej

Jabłczan  +  NAD

+

   

Szczawiooctan + NADH + H

+

.  

16. Cykl mocznikowy.  

Mocznik  tworzy  się  z  amoniaku  i  dwutlenku  węgla  oraz  asparaginianu.  Grupy  aminowe 

mocznika  pochodzą  z  asparaginianu.  Reakcje  cyklu  zachodzą  w  wątrobie,  przy  czym  synteza 
karbamoilofosforanu i cytruliny odbywa się w mitochondrium a synteza arginylobursztynianu i 
uwalnianie mocznika odbywa się w cytozolu. 

Bilans energetyczny syntezy mocznika: proces kosztowny energetycznie, ponieważ wytworzenie 
jednej  cząsteczki  mocznika  wymaga  wkładu  energetycznego  3  moli  ATP:  2  mole  do  syntezy 
karbamoilofosforanu (2 cząsteczki ATP przekształcają się do 2 cząsteczek ADP) i mol do syntezy 
arginilobursztynianu  (ATP  przekształca  się  w  AMP).  Cykl  jest  niezbędny  w  celu  usuwania 
toksycznego amoniaku.  

Reakcja  1  - 

Ornityna 

najpierw  jest  karbamoilowana  przez  karbamoilofosforan,  co  daje 

cytrulinę

.  

Reakcja  2  - 

Cytrulina

 ulega  kondensacji  z asparaginianem,  tworząc  argininobursztynian,  który 

jest rozszczepiany na 

argininę i fumaran

Reakcja3 - Bezpośrednim prekursorem mocznika jest 

arginina

, która z udziałem arginazy ulega 

hydrolizie do 

mocznika i ornityny

Reakcja  5.  -  Najpierw  na 

ornitynę

  zostaje  przeniesiona  grupa  karbamoilowa,  co  prowadzi  do 

otrzymania 

cytruliny

.  Reakcje  te  katalizuje  karbamoilotransferaza  ornitynowa.  Donorem 

karbamoilu  w  tej  reakcji  jest  karbamoilofosforan,  który  dzięki  wiązaniu  bezwodnikowemu 
charakteryzuje się dużym potencjałem przenoszenia. 

background image

Karbamoilofosforan  niezbędny do utworzenia cytruliny jest syntetyzowany z NH4+, CO2, ATP i 
H2O w skomplikowanej reakcji katalizowanej przez syntazę karbamoilofosforanową

Reakcja  6  -  W  następnym  etapie    syntetaza 

argininobursztynianowa

  katalizuje  kondensację 

cytruliny z asparaginianem do 

argininobursztynianu

. Reakcja ta przebiega kosztem energii ATP, 

który  ulega  przy  tym  hydrolizie  do  AMP  i  pirofosforanu,  oraz  dzięki  następnej  hydrolizie 
pirofosforanu. 

Reakcja  8  -  W  końcu  ligaza  argininobursztynianowa  rozszczepia 

argininobursztynian

  na 

argininę  i fumara

n. Szkielet  węglowy  asparaginianu  nie  zostaje  podczas  tej  reakcji  naruszony, 

natomiast grupa aminowa zostaje przeniesiona na powstającą argininę. 

Istotne  znaczenie  w  cyklu  mocznikowym  ma  synteza  fumaranu,  przez  którą  cykl  mocznikowy 
zazębia się z cyklem kwasu cytrynowego. 

17.  Transport elektronów w łańcuchu oddechowym i fosforylacja oksydacyjna

.  

Transport elektronów ;  

Oksydoreduktaza  NADH-koenzym  Q  -  jest  pierwszym  białkiem  łańcucha  transportu 
elektronów.  Reakcja  katalizowana  przez  enzym  polega  na  przeniesieniu  dwóch  elektronów  z 

NADH na koenzym Q10.  

 

Oksydoreduktaza  bursztynian-ubichinon  -  jest  drugim  punktem  wejścia  elektronów  do 

łańcucha transportu elektronów.  

 

Oksydoreduktaza  flawoproteina  przenosząca  elektron-ubichinon  -  jest  trzecim  punktem 

wejścia do łańcucha transportu elektronów 

 

Oksydoreduktaza  koenzym  Q-cytochrom  c  -  Cytochromy  są  białkami  przenoszącymi 
elektrony, zawierającymi jedną lub więcej grup hemowych. 

 

Oksydaza  cytochromu  c  -  jest  ostatnim  enzymem  łańcucha  transportu  elektronów.  Enzym 
katalizuje końcową reakcje łańcucha oddechowego, przenosząc elektrony na tlen i jednocześnie 

przemieszczając protony przez błonę 

 

 

 

Fosforylacja oksydacyjna - jest szlakiem metabolicznym, w którego wyniku energia uwalniana 

podczas utleniania zredukowanych nukleotydów przekształcana jest w energię ATP. w wyniku 
szeregu  reakcji  redoks,  elektrony  przenoszone  są  ze  zredukowanych  nukleotydów,  NADH  i 

FADH2, na pełniący funkcję akceptora elektronów tlen. Reakcji redoks zachodzi na kompleksach 
białkowych  znajdujących  się  w  mitochondriach.  Zestaw  enzymów  biorących  udział  w 

przenoszeniu elektronów określa się jako łańcuch oddechowy. Przepływ elektronów z donorów 
w  postaci  cząsteczek  NADH  na  akceptory  w  postaci  cząsteczek  tlenu,  odbywający  się  przez 

szereg  przenośników  biorących  udział  w  łańcuchu  transportu  elektronów,  jest  procesem 
egzoenergetycznym  –  uwalniającym  energię.  Synteza  ATP  jest  zaś  procesem 

endoenergetycznym który, aby zachodzić, wymaga dostarczenia energii. łańcuch oddechowy, jak 
i  synteza  ATP  zachodzi  na  błonach  białkowo-lipidowych.  Energia  z  łańcucha  transportu 

elektronów  jest  przenoszona  na  syntazę  ATP,  dzięki  wytworzeniu  różnicy  stężeń  jonów  w 

background image

poprzek  błony,  nazywanej  gradientem  elektrochemicznym.  Proces  przenoszenia  protonów 
przez  błonę  został  nazwany  chemiozmozą  Protony  są  przenoszone  z  apomocą  pompy 

protonowej. Powstający, w efekcie ich  pracy, gradient elektrochemiczny, nazywany często siłą 
protonomotoryczną,  składa  się  z  dwóch  elementów:  różnicy  stężeń  protonów  raz  różnicy 

potencjałów,  wynikającej  z  ładunków  przemieszczanych  cząsteczek.  Syntaza  ATP  zużywa 
energię  gradientu  elektrochemicznego,  pozwalając  przejść  ładunkom  (protonom)  z  powrotem 

przez błonę.