KATEDRA BIOCHEMII
Wydział Biologii i Ochrony
Środowiska
ZADANIA TEORETYCZNE
PODSTAWY
BIOTECHNOLOGII
1
ZADANIE 1: H
odowle ciągłe
W ciągłych hodowlach drobnoustrojów po wstępnym namnożeniu mikroorganizmów
rozpoczyna się stałe zasilanie hodowli świeżą pożywką z jednoczesnym odbiorem płynu
hodowlanego, przy zachowaniu stałej objętości cieczy w fermentorze.
Ze
względu na sposób kontroli i kierowania procesem hodowli ciągłej wyróżniamy dwie główne
metody jej prowadzenia oparte na:
a) zasadzie turbidostatu-
ze stałym stężeniem biomasy
b) zasadzie chemostatu-
ze stałą szybkością rozcieńczania.
Na rysunku 1 przedstawion
o schemat układu do hodowli ciągłej drobnoustrojów. W reaktorze
tego typu zakłada się idealny stan wymieszania, w wyniku czego skład płynu hodowlanego i
temperatura są w każdym punkcie reaktora identyczne. Na rysunku 2 przedstawiono graficzną
interpretację zależności pomiędzy parametrami pracy fermentora, a więc produktywnością (Dx),
szybkością rozcieńczania (D), stężeniem biomasy (x) i stężeniem substratu (S). Produktywność
jest to masa drobnoustrojów przypadająca na jednostkę objętości i jednostkę czasu [kg/(l* h)].
Stężenie biomasy i substratu jest praktycznie niezmienne w szerokich granicach wartości
szybkości rozcieńczania. Zbliżając się do wartości D
max
układ staje się niestabilny i nawet
niewielkie zmiany wartości szybkości rozcieńczania mogą powodować znaczne zmiany stężenia
biomasy i substratu. Produktywność biomasy osiąga swoje maksimum w zakresie wysokich
wartości D, w granicach których układ nie wykazuje dostatecznej stabilności.
Rys. 1. Ogólny schemat bioreaktora (chemostat)
Rys. 2.
Stężenie substratu (S), biomasa (x) i produktywność (Dx) jako funkcje szybkości rozcieńczenia
dopływ
odpływ
dopływ powietrza
odpływ powietrza
pompa
pompa
KATEDRA BIOCHEMII
Wydział Biologii i Ochrony
Środowiska
ZADANIA TEORETYCZNE
PODSTAWY
BIOTECHNOLOGII
2
Podstawową różnicą hodowli ciągłej w porównaniu z hodowlą okresową jest brak fazowości
wzrostu. Hodowle ciągłe wykazują wiele zalet w porównaniu z procesami okresowymi:
a)
wyeliminowanie zmian warunków hodowli w czasie jej trwania
b)
możliwość prowadzenia hodowli w dowolnie długim czasie
c)
możliwość regulacji stanu fizjologicznego drobnoustrojów
d)
jednorodność składu fizycznego i chemicznego hodowli
e)
możliwość automatyzacji
f)
możliwość eliminacji oddzielenia komórek od medium.
Mimo tych korzyści procesy ciągłe nie są powszechnie wykorzystywane w praktyce
przemysłowej. Przykładowo nadają się lepiej do otrzymywania biomasy i metabolitów
pierwotnych, gorzej z produkcją metabolitów wtórnych.
Problemy z prowadzeniem hodowli ciągłych wiążą się również z innymi trudnościami:
a)
możliwością degeneracji szczepów lub opanowania hodowli przez mutanty o gorszych
własnościach technologicznych
b)
wypieraniem mikroorganizmów charakteryzujących się powolnym wzrostem przez
niepożądane drobnoustroje szybciej dzielące się
c)
problemami z utrzymaniem aseptycznych warunków
d)
niesprzyjającymi warunkami produkcji niektórych substancji wytwarzanych przez komórki nie
rosnące
e) tworzeniem przez drobnoustroje wiel
okomórkowych agregatów, kłaczków oraz zarastaniem
ścian fermentora i przewodów.
2A. HODOWLA CIĄGŁA – PRZYGOTOWANIE I PROWADZENIE
Założono hodowlę szczepu Acinetobacter sp. w pożywce mineralnej z dodatkiem 2 mM
2-metylofenolu
jako jedynego źródła węgla w reaktorze o objętości 1 litra. Hodowlę inkubowano
w temperaturze pokojowe
j ze stałą prędkością mieszania 130 rpm, przy napowietrzaniu 1,5
l/min.
Po zaszczepieniu pożywki monitorowano gęstość hodowli poprzez pomiar absorbancji
przy
= 600 nm
oraz stężenie 2-MP poprzez pomiar metodą z p-nitroaniliną. Pomiary
wykonywano co 45 minut. Jednocześnie co 45 minut pobierano określoną hodowli bakteryjnej i
oznaczano suchą masę bakterii metodą filtracji na sączkach membranowych. Wyniki
umieszczono w tabeli I.
Na posta
wie przyrostu biomasy w fazie wykładniczego wzrostu obliczono maksymalną
właściwą szybkość wzrostu
max,
szybkość rozcieńczania D (przyjąć wartość D na poziomie 50%
max
) oraz natężenie przepływu pożywki F, opierając się na poniższych informacjach:
Wzrost
nieograniczony drobnoustrojów przebiega zgodnie z kinetyką procesów auto-
katalitycznych (reakcja I rzędu), w których szybkość jest wprost proporcjonalna do stężenia
autokatalizatora. W hodowli autokatalizatorem są komórki drobnoustrojów (o łącznej masie x
1
),
można więc napisać:
x/
t =
* x
1
, stąd po przekształceniu
= (1/x
1
) *
x/
t
, a także:
x/
t =(x
2
-x
1
) / (t
2
- t
1
)
KATEDRA BIOCHEMII
Wydział Biologii i Ochrony
Środowiska
ZADANIA TEORETYCZNE
PODSTAWY
BIOTECHNOLOGII
3
gdzie:
x/
t -
szybkość wzrostu, kg /h
-
właściwa szybkość wzrostu, 1 /h
x
1
–ilość biomasy w bioreaktorze w czasie t
1
, kg
x
2
–ilość biomasy w bioreaktorze w czasie t
2
, kg
t
1
- czas pierwszego pomiaru biomasy, h
t
2
- czas drugiego pomiaru biomasy, h
W chemostacie wielkością stałą jest szybkość rozcieńczania D, czyli stosunek wartości
objętościowego natężenia przepływu pożywki do objętości pożywki w fermentorze.
D = F / V,
stąd po przekształceniu F = D * V
gdzie:
F -
objętościowe natężenie przepływu pożywki, dm
3
/h
V -
objętość pożywki w fermentorze, dm
3
D -
szybkość rozcieńczania, l/h
Ponieważ założono D na poziomie 50% więc:
F=0,5 *
max
* V
Wartość natężenia przepływu pożywki wyliczoną z powyższego wzoru ustawiono na
pompie dozującej pożywkę do biostatu i odbierającej jednocześnie płyn hodowlany.
Od momentu rozpoczęcia hodowli ciągłej w odstępach 20-cio minutowych oznaczano
gęstość hodowli poprzez pomiar absorbancji przy
= 600 nm oraz
stężenie 2-MP metodą
z p-
nitroaniliną. Wyniki umieszczono w tabeli II. Na zakończenie prowadzenia hodowli ciągłej
pobrano
20 ml hodowli do oznaczenia biomasy metodą filtracji w celu wyznaczenia
współczynnika wydajności biomasy (Y). Masa suchego sączka wynosiła 0,0987 g, a masa
sączka z bakteriami 0,1062 g.
W trakcie procesu ciągłego w fermentorze wartością stałą jest także współczynnik
wydajności biomasy Y, który wiąże szybkość wzrostu z szybkością zużycia substratu. Opisuje
on więc, jaką biomasę można otrzymać po dostarczeniu do fermentora jednostkowej masy
substratu. W praktyce współczynnik ten jest mniejszy od 1, ponieważ substrat zużywany jest nie
tylko do produkcji biomasy, ale także spalany w celu dostarczenia energii. Oblicza się go ze
wzoru:
Y = -
X /
S = - (X
2
– X
1
) / (S
2
– S
1
)
gdzie:
Y -
wydajność biomasy
X -
ilość biomasy powstałej w procesie, kg
S -
ilość substratu zużytego w procesie, kg
X
1
-
ilość biomasy w pożywce mineralnej, kg
X
2
-
ilość biomasy w odpływie, kg
S
1
-
ilość substratu w pożywce mineralnej, kg
S
2
-
ilość substratu w odpływie, kg
Na podstawie otrzymanych wyników oceń, czy hodowla ciągła została założona prawidłowo.
Czy można wyznaczyć współczynnik wydajności biomasy przy tak założonej hodowli.
Odpowiedzi uzasadnij.
KATEDRA BIOCHEMII
Wydział Biologii i Ochrony
Środowiska
ZADANIA TEORETYCZNE
PODSTAWY
BIOTECHNOLOGII
4
Tabela I
Czas,
min
A
600
A
550
Rozc.
V hodowli, ml
masa sączka, g masa sączka + bakterie, g
0
0,114
0,250
10
20
0,0859
0,0862
45
0,125
0,220
10
22
0,0988
0,0990
90
0,156
0,198
10
21
0,0904
0,0928
135
0,185
0,141
10
20
0,0897
0,0901
180
0,255
0,100
10
18
0,0971
0,1008
225
0,325
0,052
5
19
0,0936
0,1019
270
0,401
0,019
1
20
0,0901
0,0987
315
0,419
0,006
1
21
0,0892
0,0978
360
0,433
0,003
1
20
0,0979
0,1082
405
0,407
0,009
1
Tabela II
Czas,
min
A
600
A
550
Rozc.
0
0,408
0,257
2
20
0,411
0,223
2
40
0,395
0,301
1
60
0,336
0,358
1
80
0,301
0,151
2
10
0,298
0,118
2
120
0,258
0,351
1
140
0,201
0,258
1
160
0,198
0,408
1
180
0,135
0,397
1
KATEDRA BIOCHEMII
Wydział Biologii i Ochrony
Środowiska
ZADANIA TEORETYCZNE
PODSTAWY
BIOTECHNOLOGII
5
ZADANIE 2:
Wyznaczanie wzrostu bakterii metodą płytkową – zadanie teoretyczne
Prowadzono hodowle periodyczne szczepu Bacillus subtilis
. w pożywce mineralnej
z dodatkiem wybranego substratu aromatycznego przez okres 12
godzin. Co godzinę
wykonywano szereg rozcieńczeń w soli fizjologicznej i z odpowiednich rozcieńczeń wysiewano
po 100
l hodowli na płytki agarowe. Po upływie 24 godzin liczono wyrosłe kolonie. Wyniki
przedstawiono w tabeli IIIa i IIIb.
Uzupełnij tabele wykonując odpowiednie obliczenia, narysuj krzywą wzrostu szczepu
Bacillus subtilis
w pożywce mineralnej z dodatkiem wybranego substratu aromatycznego oraz
oblicz liczbę podziałów, częstość podziałów i wiek osobniczy szczepu Bacillus subtilis w tych
warunkach prowadzenia hodowli.
Tabela IIIa
Czas
prowadzenia
hodowli, h
Rozcieńczenie
CFU
CFU/1 ml
Średni CFU/1 ml
Log CFU/ 1 ml
0
10
-2
305
10
-3
95
10
-4
35
1
10
-2
388
10
-3
101
10
-4
36
2
10
-4
278
10
-5
99
10
-6
37
3
10
-5
305
10
-6
188
10
-7
39
4
10
-6
248
10
-7
101
10
-8
12
5
10
-6
259
10
-7
159
10
-8
11
6
10
-6
277
10
-7
143
10
-8
29
KATEDRA BIOCHEMII
Wydział Biologii i Ochrony
Środowiska
HODOWLA CIĄGŁA
DROBNOUSTROJÓW-
PRZYGOTOWANIE
PODSTAWY
BIOTECHNOLOGII
6
Tabela IIIb
Czas
prowadzenia
hodowli, h
Rozcieńczenie
CFU
CFU/1 ml
Średni CFU/1 ml
Log CFU/ 1 ml
7
10
-6
297
10
-7
159
10
-8
29
8
10
-8
420
10
-9
289
10
-10
57
9
10
-10
257
10
-11
45
10
-12
5
10
10
-10
214
10
-11
87
10
-12
12
11
10
-10
201
10
-11
55
10
-12
16
12
10
-10
197
10
-11
55
10
-12
15