1
Pisanie strukturalnych wzorów chemicznych i równań reakcji przy użyciu programu
ISISDraw - instrukcja zaawansowana
Celem tego ćwiczenia jest nauka formatowania różnorodnych obiektów i tworzenia złożonych
obiektów w programie ISISDraw.
Uruchomić program ISISDraw. W programie należy utworzyć następujące dokumenty
Naftalen WWA.skc i Naftalen reakcje.skc. Zawartość tych dokumentów jest pokazana na
następnych stronach instrukcji. Dokumenty te zostaną wykorzystane na następnych
pracowniach do zbudowania prezentacji w programie PowerPoint, w związku z tym pierwszą
czynnością jest zmiana orientacji strony z pionowej na poziomą. Należy wykonać polecenia
File → Print Setup i w nowo otwartym oknie Ustawienia wydruku w polu Orientacja
zaznaczyć opcje pozioma i kliknąć przycisk OK.
W dokumencie Naftalen WWA.skc tworzymy 9 wzorów strukturalnych naftalenu i
wielopierścieniowych węglowodorów aromatycznych (WWA). Każdy wzór ma być
połączony z nazwą związku. Wszystkie wzory i nazwy będą wymagały dodatkowego
formatowania.
Formatowanie wzorów.
Pierwszym krokiem jest zaznaczenie wzoru,
który ma być sformatowany, następnie
prawym klawiszem myszy wywołujemy
właściwości obiektu i wybieramy z pośród
nich (lewym klawiszem) polecenie Edit
Molecule. W oknie opcji Thickness można
ustawiać grubość linii używanej do tworzenia
wiązań (standardowa grubość wynosi 0.7pt),
poniżej w oknie Color można ustawiać kolor,
którym będzie kreślony dany wzór. Grubość
wiązań ma być zmieniona na 1.5pt dla każdego
wzoru. W zakładce Bond w opcji Bond
Length można ustawiać długość wiązania
(standardowa długość wynosi 0.7cm). w
zakładce Font można wstawiać parametry
fontów użytych do tworzenia danego wzoru.
Formatowanie napisów.
Analogicznie jak przy wzorach najpierw
zaznaczany
obiekt,
potem wywołujemy
właściwości i wybieramy opcje Edit text.
Tutaj poza zakładką Font znajduje się jeszcze
zakładka Style, w której w poleceniu Fill
można dokonywać ustawień związanych z
wypełnieniem obiektu. Wybór opcji Opaque
powoduje że formatowany obiekt ma tło (opcje
Color Pattern umożliwiają wybór koloru
wypełnienia i wzoru wypełnienia), natomiast
wybór opcji Transparent powoduje, że obiekt
będzie przeźroczysty.
2
Każdy wzór wykonany w dokumencie Naftalen WWA.skc ma być
zgrupowany w jeden obiekt z odpowiednią nazwą. W ten sposób w
dokumencie powinno się znaleźć 9 obiektów.
Numerowanie atomów węgła we wzorach strukturalnych.
Używając narzędzia Atom z paska narzędzi
klikamy odpowiedni atom w cząsteczce. W
oknie, które się otworzy znajdujemy opcje
More (na samym dole okna). W zakładce
Atom ustawiamy: w oknie Atom number
odpowiedni numer atomu, w oknie Number
position odpowiednią pozycje, w której będzie
wyświetlony numer względem pozycji, na
której znajduje się numerowany atom. Po
dokonaniu
ustawień
zamykamy
okno
przyciskiem OK.
W dokumencie Naftalen reakcje.skc należy utworzyć schemat reakcji naftalenu.
Wzory części substratów i produktów reakcji są wykonane jako złożone obiekty zawierające
wzór, napis i element graficzny (prostokąt z zaokrąglonymi rogami). Kolejność tworzenia
takich obiektów jest następująca:
Najpierw tworzymy prostokąt, potem wzór i napis. Taka kolejność
umożliwia nam ułożenie wzoru i napisu na prostokącie.
Następnie formatujemy poszczególne obiekty odpowiednimi poleceniami
Edit Molecule, Edit text, Edit rectangle.
Potem ustawiamy wzajemnie wszystkie elementy, zaznaczamy i
dokonujemy grupowania.
3
Centralny wzór naftalenu ma następujące parametry: długości wiązań 1.00cm, grubość
wiązania 2.00pt. Pozostałe wzory mają długości wiązań 0.7cm, a grubość 1.5pt.
Strzałki znajdujące się w schemacie są utworzone przy pomocy narządzi Arrow, Line i Bond
(wiązania pojedyncze). Całość jest następnie formatowana, zaznaczana i grupowana.
Następnym krokiem jest utworzenie odpowiednich napisów, które po sformatowaniu są
grupowane z odpowiednia strzałką.
Na potrzeby prezentacji PowerPoint wzory chemiczne i inne obiekty graficzne zapisane w
pliku Naftalen reakcje.skc należy pogrupować w odpowiednie obiekty zgodnie z poniższymi
rysunkami.
SO
3
H
kwas 2-naftalenosulfonowy
NO
2
Br
1-nitronaftalen
1-bromonaftalen
1,4-dihydronaftalen
teralina
dekalina
COCH
3
COCH
3
2-acetylonaftalen
1-acetylonaftalen
O
O
O
O
O
1,4-naftochinon
bezwodnik ftalowy
CrO
3
, HOAc, 25
o
C
O
2
, V
2
O
5
, 460-480
o
C
H
2
, katalizator
Na, C
5
H
11
OH
Na, C
2
H
5
OH
C
2
H
2
Cl
4
C
6
H
5
NO
2
CH
3
COCl, AlCl
3
Naftalen
Br
2
, CCl
4
HNO
3
H
2
SO
4
SO
3
H
kwas 1-naftalenosulfonowy
OH
2-naftol
ONa
4
1,4-dihydronaftalen
teralina
dekalina
NO
2
Br
1-nitronaftalen
1-bromonaftalen
ONa
OH
2-naftol
O
O
O
O
O
SO
3
H
kwas 1-naftalenosulfonowy
Naftalen
Br
2
, CCl
4
HNO
3
H
2
SO
4
H
2
, katalizator
Na, C
5
H
11
OH
Na, C
2
H
5
OH
COCH
3
COCH
3
2-acetylonaftalen
1-acetylonaftalen
CH
3
COCl, AlCl
3
C
2
H
2
Cl
4
C
6
H
5
NO
2
CrO
3
, HOAc, 25
o
C
O
2
, V
2
O
5
, 460-480
o
C
SO
3
H
kwas 2-naftalenosulfonowy
1,4-naftochinon
bezwodnik ftalowy
dokument programu ISISDraw Naftalen reakcje.skc
5
antracen
chryzen
fenentren
piren
C
H
3
C
H
2
CH
2
metylocholantren
naftalen
5
10
1
2
CH
3
CH
3
5,10-dimetylo-1,2-benzantracen
3
4
1
2
3,4-benzopiren
5
6
1
2
1,2,5,6-dibenzantracen
dokument programu ISISDraw Naftalen WWA.skc