ASYMILACJA AZOTU PRZEZ ROŚLINY
BAKTERIE WOLNOŻYJĄCE
• Clostridum
• Bakterie anaerobowe, szeroko rozpowszechnione w glebach.
Wysoka odporność na niesprzyjające warunki zewnętrzne.
Szybki wzrost
• Azotobacter
• Typowy przedstawiciel bakterii wiążących azot. Szeroko
rozpowszechniony w zbiornikach wodnych i glebach. Wysoka
intensywność oddychania i intensywność wiązania azotu, ok. 1
g/m
2
w ciągu roku.
• Anaeroby fakultatywne
• Znaczenie we wzbogaceniu gleby w azot nie w pełni
wyjaśnione
• Nostocaceae, Scytonemataceae, Rivulariaceae,
Microchaetaceae (sinice)
• Ważna funkcja gospodarcza na polach ryżowych
BAKTERIE SYMBIOTYCZNE
• Większość bakterii
symbiotycznych (Rhizobium)
wykazuje zdolność do
wiązania azotu
atmosferycznego w symbiozie
z roślinami wyższymi
• Proces wiązania azotu
odbywa się w bakteroidach
brodawek
• Występująca w brodawkach
leghemoglobina
odgrywa rolę
czynnika regulującego dostęp
tlenu do bakteroidów
• Nitrogenaza
jest
odpowiedzialna za wiązanie i
redukcję azotu
NITROGENAZA
TRANSPORT ELEKTRONÓW DO NITROGENAZY
TRANSPORT ELEKTRONÓW DO NITROGENAZY
Accumulati
on of
electrons
NITROGENAZA
• U wszystkich
organizmów wiążących
azot pierwotnym
stabilnym produktem
jest amoniak
• Amoniak jest
przekazywany tkankom
brodawki i w nich
wykorzystywany na
drodze aminowania
ketokwasów
TRANSPORT AMINOKWASÓW
• Amoniak produkowany
przez bakteroidy jest
głównie wykorzystywany w
syntezie kwasu
glutaminowego w
obecności dehydrogenazy
glutaminianowej oraz w
syntezie glutaminy
katalizowanej przez
syntetazę glutaminową
• Aminokwasy i amidy
produkowane w
brodawkach są następnie
rozprowadzane po całym
organizmie rośliny-
gospodarza
PRZYSWAJANIE AZOTANÓW PRZEZ ROŚLINY WYŻSZE
• W tkankach roślin mogą
nagromadzać się duże ilości
azotanów , gdyż nie
przejawiają one w stosunku do
rośliny właściwości
toksycznych
• Jedyną formą azotu, która
może być wykorzystywana
przez rośliny do biosyntezy
związków organicznych jest
zredukowana forma azotu
(amoniak)
• W tkankach roślin występują
dwie formy reduktaz:
azotanowa i azotynowa, które
katalizują ciągły proces
redukcji azotanów do
amoniaku
REDUKTAZA AZOTANOWA
• Reduktaza azotanowa jest
kompleksem enzymatycznym
zlokalizowanym w
cytoplazmie
• FAD i Mo występują jako
grupy prostetyczne
• Masa cząsteczkowa waha się
pomiędzy 500 a 600 kDa
• Dawcą elektronów jest NADH
• Jako pierwszy enzym szlaku
redukcji azotanów odgrywa
rolę regulatorową przemian
azotanowych w roślinach
REGULACJA AKTYWNOŚCI REDUKTAZY AZOTANOWEJ
• Enzym indukcyjny tzn.
wytwarzany tylko w
obecności azotanów
• Redukcja azotanów
związana z rozpadem
cukrów i dlatego jej
aktywność zależy od
oświetlenia i stężenia
dwutlenku węgla
REDUKTAZA AZOTYNOWA
• Reduktaza azotynowa
katalizuje redukcję azotynów
do amoniaku
• Masa cząsteczkowa 60-64 kDa
• Występuje w chloroplastach
• Dawcą elektronów w tym
procesie jest ferredoksyna
• Redukcja azotanów do
amoniaku wymaga
przeniesienia 8 elektronów
• Ze względu na zużywanie
dużej ilości energii
promieniowania słonecznego
proces ten przebiega przede
wszystkim w zielonych
częściach roślin
ASYMILACJA AMONIAKU (pierwotna synteza
aminokwasów)
Dehydrogenaza glutaminianowa
.
CYKL GS-GOGAT
GS- SYNTAZA GLUTAMINIANOWA
GOGAT –AMINOTRASFERAZA GLUTAMINIAN:2-OKSOGLUTARAN
CYKL GS-GOGAT
ROZKŁAD AMINOKWASÓW
Aminokwasy występujące w organizmie w
nadmiarze
nie mogą być magazynowane. Nie są
również wydalane
• Nadmiar aminokwasów jest wykorzystywany jako
materiał energetyczny
• Grupa α-aminowa aminokwasu jest odłączana od
aminokwasu
• Powstały szkielet węglowy jest przekształcany do
głównego intermediatu metabolicznego
• Większość grup aminowych aminokwasów
występujących w nadmiarze ulega przekształceniu w
mocznik
• Szkielety węglowe aminokwasów są przekształcane
w acetylo-CoA, pirogronian lub jeden z
intermediatów TCA
Grupy α-aminowe ulegają przekształceniu w jony
amonowe przez
oksydacyjną deaminację
glutaminianu
Przeniesienie grup α-aminowych z α-aminokwasu na α-ketokwas
katalizują
aminotransferazy (transaminazy)
Ogólnie aminotransferazy skierowują spływ grup aminowych z różnych
aminokwasów na α-ketoglutaran w celu przemiany w NH
4+
Aminotransferazy
• Aminotransferaza asparaginianowa:
Asparaginian + α-ketoglutaran ↔ szczawiooctan +
glutaminian
• Aminotransferaza alaninowa
Alanina + α-ketoglutaran ↔ pirogronian +
glutaminian
Jony amonowe powstają w procesie oksydacyjnej
deaminacji glutaminianu
Reakcję tę katalizuje
dehydrogenaza glutaminianowa;
może ona
wykorzystywać
jako akceptory wodoru zarówno
NAD jak i NADP
Po zsumowaniu reakcje katalizowane przez
transaminazy i przez dehydrogenazę glutaminianową
można przedstawić równaniem:
CYKL MOCZNIKOWY
W organizmach kręgowców lądowych jony amonowe
ulegają dalszym przemianom tworząc mocznik i w tej
postaci są wydalane. Mocznik nie nagromadza się w
tkankach roślin wyższych ponieważ jest hydrolizowany
do amoniaku i dwutlenku węgla przez urazę
(amidohydrolazę mocznika).
Główna funkcja u roślin: detoksykacja jonów amonowych
oraz wytwarzanie argininy występującej w białkach
zapasowych
Grupa prostetyczna aminotransferaz, fosforan pirydoksalu tworzy
intermediaty o charakterze zasady Schiffa
CYKL MOCZNIKOWY
• Ptaki i gady lądowe przed wydaleniem
przekształcają grupy amonowe w kwas
moczowy
organizmy urykoteliczne
• Zwierzęta wodne wydalają bezpośrednio jony
amonowe
organizmy amonoteliczne
• Kręgowce lądowe wydalają nadmiar jonów
amonowych w postaci mocznika
organizmy
ureoteliczne
Cykl mocznikowy był pierwszym dobrze poznanym
cyklicznym torem metabolicznym (H. Krebs i K. Henseleit 1932)
Bezpośrednim prekursorem mocznika jest arginina, która z udziałem
arginazy ulega hydrolizie do mocznika i ornityny
Pozostałe reakcje cyklu mocznikowego prowadzą do syntezy argininy
z ornityny
Najpierw na ornitynę zostaje przeniesiona grupa karbamoilowa, co
prowadzi do
powstania cytruliny. Reakcję tę katalizuje karbamilotransferaza
ornitynowa
W następnym etapie syntetaza argininobursztynianowa katalizuje kondensację
cytruliny z asparaginianem. Reakcja ta przebiega kosztem energii ATP
Liaza argininobursztynianowa rozszczepia argininobursztynian na argininę i fumaran
Karbamoilofosforan niezbędny do utworzenia cytruliny jest
syntetyzowany z
CO
2
, NH
4+
, ATP i H
2
O w reakcji katalizowanej przez syntetazę
karbamoilofosforanową. Synteza karbamoilofosforanu jest praktycznie
nieodwracalna, gdyż zużywane są 2 cząsteczki ATP
Wrodzone wady enzymów cyklu mocznikowego
powodują hiperamonemię i mogą prowadzić do
uszkodzenia mózgu
• Główną drogą usuwania jonów amonowych z organizmu jest
synteza mocznika przebiegająca w wątrobie
• Wszystkie wady enzymów cyklu mocznikowego prowadzą do
zwiększonego stężenia jonów amonowych we krwi
(hiperamonemia)
• Brak liazy argininobursztynianowej (argininobursztynuria)
Skutki tej wady metabolicznej można częściowo złagodzić
podając choremu w diecie nadmiar argininy oraz ograniczając
ogólną zawartość białka
• Arginina w wątrobie ulega przekształceniu do mocznika i
ornityny
• W reakcji ornityny z karbamoilofosforanem tworzy się cytrulina,
która kondensując z asparaginianem daje argininobursztynian
(wydalany z organizmu):
Brak syntetazy karbamoilofosforanowej klub karbamoilotransferazy ornitynowej
Ukazuje inny możliwy sposób ominięcia wadliwego toru metabolicznego.
Dietę ograniczająca białko uzupełnia się dużą ilością benzoesanu i fenylooctanu
Hipuran i fenyloacetyloglutamina zastępują mocznik w usuwaniu azotu z organizmu