notatek pl O yhar, biologia molekularna, germinacja transkrypcji

background image

Inny aspekt kontroli germinacji : antyterminacja
)jawiska sprzyjają e wy oro poli erazy RNA, doko ywa ie wy oru ko ty ua ji lu ger i a ji
transkrypcji.
Po 1. Antyterminacja transkrypcji

– za hodzi, gdy poli erazy ig oruje syg ały ger i a ji i ko ty uuje

wydłuża ie ła u ha.

Klu zowy ele e te jest iałko a tyter i a yj e.

Miejs e a tyter i a yj e jest położo e zaraz koło iejs a pro otorowego. W ty iejs u przyłą za

się iałko. Oddziaływuje o o z poli erazą tworzą ko pleks. Skutkie oddziaływa ia jest z ia a

ko for a yj a oraz rak reak ji a syg ał ter i a yj y.
Znaczenie biologiczne:
dakteriofag la

da a ardzo krótki okres ży ia ykl i ek yj y jest ardzo krótki . dezpośred io po

w ik ię iu do ko órki do hodzi do wielu zy oś i, p. do tra skryp ji. dakteriofag la

da ie a

włas ej poli erazy. Wykorzystywa e są startery.

Sy teza a sa y po zątku daje tra skrypty „ ajw ześ iejsze”. Te tra skrypty są względ ie
kr

ótkie.

)ależą o e od iejs a ger i a ji. Te tra skyrpty kodują iałka: oro i N
N

– antyterminator – to iałko przyłą za się w ge o ie do iejs : utL i utR.

A ty ter i ator przyłą za się za pro otore .

Kolej y ykl: „opóź io e w zes e” kodują iałko Q, które jest kolej y a tyter i atore .

Ma y skoordy owa ą w zasie ekspresję ge ów zależ ą od ko órek tra skryp yj y h.
Kontrola germinacji transkrypcji
- atenuacja
Zachodzi u bbbaaakterii.
Tra skryp ja i tra sla ja jest połą zo a. RNA ie ulega dojrzewaniu.

Klu ze do zaist ie ia ate ua ji jest fakt, że ter i a ja i tra sla ja są sprzężo e. )e zjawiskie

ate ua ji a y do zy ie ia w reak ja h iosy tezy a i okwasów.

Opero tryptofa owy ulega regula ji przez ate ua ję.

Po rozpo zę iu tra skryp ji opero tra skryptu oże przyją struktury ają e dia etral ie róż e
znaczenie dla operonu:

 ) ałą spi ką – terminacja

 ) dużą spi ką – elongacja – a tyter i a ja zawiera sekwe je, w który h ie oże powsta

ała spi ka

Tylko jede z odeli oże ist ie .

Jak to się dzieje, że powstaje ktoraś z pętli?

Skład: tra skrypt, ry oso , poli eraza

Położe ie poli erazy i ry oso u jest i e w o u spi ka h.
Duzia spinka
Gdy w ko ór e jest ała iloś tryptofa u. Tra skryp ja opero u jest skute z a. W o u

tra skrypta h, są krótkie ra ki od zytu kodo u tryptofa u. W po liżu 5’ ko a tra skryptu ry oso

zatrzy uje się w iejs u ra ki od zytu tryptofa u. Skutkuje to ty , że RNA tworzy strukturę dużej

spi ki do włosów – a tyter i a ja. Ko órka wy zuwa ałą iloś tryptofa u.

Mała spi ka

Iloś tryptofa u jest duża, tak y ry oso ógł poko a opero y tryptofa owi. Ry oso przesuwa

się. Pozostaje alter atyw a struktura – ałej spi ki – syg ał ger i a ji.
Energetycznie faworyzowana struktura: duzia spinka.
Regulacja

zależ a od represora jest ajważ iejsza włą za, wyłą za opero , le z ie jest poz a a.

Ate ua ja dostraja tra skryp ję.
Atenuacja u Bacillus subtilis
- brak represora
-

ate ua ja ie zależy od ry ooso u

-

rak sprzęże ia tra skryp ji i tra sla ji

-

duża i ała spi ka.

background image

Co jest zy ikie iloś i tryptofa u?

diałko TRAP – iałko wiążą e RNA z opero e tryptofa owego. Tworzy ko pleks z tryptofa e i

RNA powstają y a opero ie tryptofa owy .

Ko pleks tworzy regular ą kulistą strukturę, która sil ie zależy od iloś i tryptofa u. Duża struktura
powstaje, gdy jest spory zapas tryptofanu.
-

ała iloś trp – rak TRAP. Tra skrypt jest prawidłowy, ie astępuje ter i a ja, powstaje duża

spinka
-

duża iloś Trp – TRAP aktyw e, powstaje ała spi ka i terminacja.

Poli eraza zase się ofa, towarzyszy te u wypar ie DNA od atry y. ’ ko ie jest odrywa y od

atry y. Może to ie fatal e skutki.

A y zapo ie pro le o , frag e t usi y od ięty.

Poli eraza RNA a aktyw oś poli erazową hydrolity z ą ie jest iągle aktyw a. Potrze e są jej

zy iki iałkowe: Gred i GreA ie posiadają właś iwoś i ukleazowy h, sty ulują poli erazę, y

jej aktyw oś yła włą za a.

Igła, a której z ajdują się wzaje

ie aładowa e a i okwasy i Mg + do hodzi do

przem

iesz ze ia e tru aktyw ego, uaktyw ie ie ukleazy. Odpowiedź jest i dukowa a a

iedo ór waru ków wzrostu. )

iejsza y jest pozio tra skryp ji.

W odpowiedzi ś isłej pośred i zą związki ppGpp i pppGpp alar o y

Są sy tezowa e w waru ka h iedo oru a i okwasu przez iałko RelA, które tworzy ko pleks z

DksA. Wyłą za tra skryp ję.

diałko DksA w ko pleksie z alar o e oddziałwyuje podo ie jak polimeraza, co hamuje

tra skryp ję.
mRNA eukariotyczne

– podlega dojrzewaniu

mRNA bakteryjne

– nie podlega procesowaniu


rRNA.
Ry oso al y RNA u E. oli i akterii jest tra skry owa y jako ałoś . Pierwotna wersja rRNA to pre-

rRNA. Występuje w kilku kopia h.

Należy wydzieli frag e ty odpowiedzial e rRNA. )a ię ie są odpowiedzial e ry o ukleazy. Miejs a

takie są harakterystyczne – dwuniciowe RNA.
Rybonukleaza III E i F tnie

– ie a właś iwoś i e do ukleazy.


tRNA
wszystkie pre-

tRNA podlegają dojrzewa iu, ieważ e, gdzie się z ajdują. Dojrzewa ie ie jest

trywialne. Pre-tRNA

przyj uje spe yfi z ą strukturę wyższego rzędu – liś ia ko i zy y z

dodatkowy i struktura i spi ki do włosów. Dojrzewa ie astępuje od ’ ko a.

Ry o ukleazy E i F od i ają struktury od ’ ko a.
RNaza D

– od udowuje kolej e reszty idą od ’ ko a 7 reszt)

RNaza P

– od i a frag e t ze spi ką przy 5’ ko u.

Powstaje dojrzała ząste zka

Na ko u ’ z ajduje się harakterysty z a sekwe ja CCA.
RNaza Z

– dobudowuje CCA – iezależ a od atry y RNazy

RNaza P

– złożo a z wielu podjed ostek, jed ą z i h jest RNA, sko pleksowa y z iałka i. diałko

hybrydowe

– relikt czasu.

tRNA i rRNA są skutkie pro esowa ia
modyfikacje chemiczne

– w większoś i z i h reszty ukrowe ulegają odyfika jo , p.:

pseudourydy a, dihydrourydy a, doty zy zasad posz zegól y h ato ów . Są także takie

odyfika je, w który h wy i a e są ałe ukleotydy.

Liczba modyfikacji

– w tRNA z ie iają i h harakter olekular y. )większa się spe yfi z oś ty h

ząste zek. ) ie io e tRNA ają zwiększo ą zdol oś do oddziaływa ia z większą iloś ią kodo ów.



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
notatek pl O yhar, biologia mol Nieznany
notatek pl O yhar, biologia mol Nieznany (2)
Ożyhar, biologia molekularna, germinacja transkrypcji
notatek pl O yhar, biologia mol Nieznany
notatek-pl-w,biologia molekularna,RAPORT
BMW05, Biotechnologia PŁ, Biologia molekularna
BMW07, Biotechnologia PŁ, Biologia molekularna
BMW03, Biotechnologia PŁ, Biologia molekularna
BMW04, Biotechnologia PŁ, Biologia molekularna
BMW02, Biotechnologia PŁ, Biologia molekularna
Notateczki, Biotechnologia PWR, Semestr 5, Biologia Molekularna - Wykład, egzamin - stare pytania, P
BMW05, Biotechnologia PŁ, Biologia molekularna
Biologia molekularna
Biologia molekularna koniugacja

więcej podobnych podstron