Domeny lipidowe to zgrupowania lipidów o tym samym ładunku, mające charakter silnie polarny.
Dwuwarstwa lipidowa jest strukturą niezwykle dynamiczną. Zmiana pH w jej obrębie prowadzi do tworzenia się silnie polarnych domen lipidowych. Gdy pH maleje - rośnie liczba ujemnie naładowanych cząsteczek lipidów, które tworzą domeny lipidowe; gdy pH rośnie - maleje liczba ujemnie naładowanych cząsteczek lipidów i powstałe wcześniej domeny lipidowe ulegają rozpadowi.
Przykładem substancji, która zdolna jest tworzyć domeny jest kwas fosfatydowy w lecytynie.
Do domen lipidowych mogą przyłączać się jony wapnia. Przyłączenie się jonu wapniowego do cząsteczki kwasu fosfatydowego powoduje usztywnienie dwuwarstwy lipidowej w miejscu dołączenia się jonów wapniowych.