1.

Punkty: 1

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących kinaz białkowych są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Jeśli dana kinaza białkowa fosforyluje reszty serylowe w docelowych białkach, to zwykle jest zdolna także do fosforylacji reszt treonylowych.
	b. Do sygnałów aktywujących niektóre kinazy białkowe należy m.in. diacyloglicerol.
	c. Do sygnałów aktywujących niektóre kinazy białkowe należy m.in. cykliczny AMP.
	d. Jeśli dana kinaza białkowa fosforyluje reszty tyrozylowe w docelowych białkach, to zwykle jest zdolna także do fosforylacji reszt fenyloalanylowych.
	e. Kinazy białkowe fosforylują białka lub ich fragmenty zlokalizowane we wnętrzu komórki, jak i poza nią.
	f. Jeśli dana kinaza białkowa fosforyluje reszty serylowe w docelowych białkach, to zwykle jest zdolna także do fosforylacji reszt tyrozylowych.

2

Punkty: 1

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących kanałów i pomp błonowych są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Szybkość transportu jonów przez pompy jest znacznie większa niż transportu tych samych jonów przez kanały błonowe, ponieważ pompy zużywają w tym celu energię, a kanały przeprowadzają transport w sposób bierny.
	b. Pompy jonowe zawierają w swojej strukturze fragment transbłonowy.
	c. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	d. Kanały błonowe bramkowane ligandem umożliwiają transport jonów wbrew gradientowi ich stężeń.
	e. Zadaniem fizjologicznym pomp błonowych jest wyrównywanie stężeń określonej substancji na zewnątrz i wewnątrz komórki.
	f. W układach biologicznych kanały błonowe występują w postaci otwartej i są zamykane jedynie na krótką chwilę.

3

Punkty: 2

Na poniższym rysunku przedstawiono schematycznie system transportu czterech substancji chemicznych: X, Y, Z oraz S, który realizowany jest przez trzy białka, oznaczone literami A, B i C, zlokalizowane w błonie komórkowej.
Które z poniższych stwierdzeń na temat tego systemu transportu i jego elementów są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Białko A jest kanałem jonowym utrzymującym gradient stężenia substancji X oraz Y w poprzek błony komórkowej.
	b. Białko B jest antyporterem substancji Y względem substancji Z.
	c. Substancja Z może być transportowana do wnętrza komórki aktywnie z wykorzystaniem gradientu stężenia substancji Y, utworzonego przez pompę A.
	d. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	e. Jeśli transportowanymi w tym układzie substancjami X, Y, Z oraz S są odpowiednio: K^+, Na^+, glukoza oraz Ca^2+, to aktywność białka C ma wpływ na import glukozy (Z) do komórki.

Poprawnie

Ocena dla tego zadania: 2/2.

4

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń na temat aktywności katalitycznej chymotrypsyny w funkcji pH są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. W warunkach pH wyższego lub równego 8, skuteczność katalityczna enzymu w przekształcaniu substratu w produkt jest maksymalna i pozostaje stała, ponieważ w zasadowym środowisku aktywna reszta serylowa spontanicznie ulega deprotonacji.
	b. W warunkach pH wyższego niż 8, spada powinowactwo enzymu do substratu, a przez to spada stacjonarne stężenie kompleksu ES.
	c. Krzywa zależności prędkości maksymalnej (Vmax) tej reakcji od pH ma kształt dzwonu z maksimum w okolicy pH 8.
	d. Dla niewysycających stężeń substratu, krzywa zależności prędkości reakcji od pH ma kształt dzwonu z maksimum w okolicy pH 8.
	e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	f. Krzywa zależności wartości kkat enzymu od pH ma kształt dzwonu z maksimum w okolicy pH 8.

5

Punkty: 3

Błonowy potencjał równowagowy dla jonów K⁺ można zdefiniować jako wartość napięcia, które ustali się w poprzek błony wtedy, gdy strumień jonów K⁺ wpływających do komórki będzie równy strumieniowi jonów K⁺ wypływających z komórki. Wiadomo, że wartość potencjału równowagowego dla jonów potasowych w przypadku pewnego neuronu wynosi - 85 mV w temperaturze 37°C. R = 8.31 J·K^-1·mol^-1, F = 96.5 kJ·V^-1·mol^-1. Proszę wskazać te z poniższych stwierdzeń, które są prawdziwe.

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. W podanych warunkach w stanie równowagi stężenie jonów K^+ wewnątrz komórki i na zewnętrz jest takie samo.
	b. W podanych warunkach stężenie jonów K^+ wewnątrz komórki jest około 24,2 razy wyższe od tego, które występuje w stanie równowagi na zewnątrz komórki.
	c. W podanych warunkach stosunek stężenia jonów K^+ wewnątrz komórki do stężenia stężenia jonów K^+ na zewnętrz komórki w stanie równowagi wynosi około 0,041.
	d. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	e. W podanych warunkach stężenie jonów K^+ wewnątrz komórki jest około 24,2 razy niższe od tego, które występuje w stanie równowagi na zewnątrz komórki.

6

Punkty: 1

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących białek błonowych są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Rodopsyna bakteryjna jest białkiem peryferyjnym.
	b. Aspiryna blokuje aktywność kanału potasowego.
	c. Obecność helis transbłonowych w białku można przewidzieć na podstawie jego sekwencji aminokwasowej.
	d. Do oddzielenia białka integralnego od błony konieczne jest detergentu.
	e. Białka błonowe mają ściśle określoną orientację ponieważ są dostarczane od strony cytozolowej komórki.
	f. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.

7

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących przedstawionego etapu reakcji katalizowanej przez chymotrypsynę są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Kowalencyjny kompleks reszty 3 enzymu oraz substratu 4 widoczny na rysunku to tzw. acyloenzym.
	b. Na rysunku przedstawiono powstawanie tetraedrycznego stanu przejściowego, o którym wiadomo, że jest stabilizowany przez tzw. dziurę oksyanionową.
	c. Reszty oznaczone na rysunku cyframi od 1 do 3 stanowią triadę katalityczną enzymu.
	d. Na tym etapie reakcji udział reszty 1 stanowi przykład specyficznej katalizy zasadowej.
	e. Grupy łańcucha peptydowego substratu, które stanowią bezpośrednie otoczenie naładowanego ujemnie atomu tlenu reagenta oznaczonego cyfrą 4, tworzą tzw. dziurę oksyanionową.
	f. Na tym etapie reakcji udział reszty 2 w katalizie polega na znaczącym obniżeniu pK reszty 3, dzięki czemu reszta 3 staje się silnym nukleofilem.

8

Punkty: 2

Szlaki kataboliczne i anaboliczne właściwe danej cząsteczce biologicznej są niemal zawsze odrębne ponieważ:

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. byłoby niezwykle trudno regulować szlak metaboliczny, gdyby pełnił on zarówno funkcję kataboliczną jak i anaboliczną.
	b. reakcje w układach biologicznych są z reguły w stanie równowagi termodynamicznej.
	c. ΔG°' dla obydwu reakcji byłaby dodatnia.
	d. reakcje te nigdy nie przebiegają w komórkach tego samego typu.
	e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	f. reakcje katalizowane przez enzymy są nieodwracalne.

9

Punkty: 1

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących białek przedstawionych schematycznie na rysunku są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Oba białka są serpinami.
	b. Białko B jest istotnym klinicznie czynnikiem zwiększającym prawdopodobieństwo przeżycia zawału mięśnia sercowego (ataku serca).
	c. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	d. Niedobór białka B prowadzi do hemofilii typu A.
	e. Dzięki aktywności enzymatycznej zawartej w domenie gla, białko B katalizuje karboksylację ważnych czynników krzepliwości krwi.
	f. Oba białka są enzymami, lecz w postaci przedstawionej na schemacie są nieaktywne.

Punkty: 2

10

Które ze stwierdzeń dotyczących glikoprotein są prawdziwe ?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Wszystkie oligosacharydy połączone wiązaniem O-glikozydowym z białkiem zawierają wspólny pięciocukrowy rdzeń.
	b. W trakcie glikozylacji typu O, reszty cukrowe mogą być przyłączone do reszty asparaginy.
	c. Niektóre lektyny funkcjonują jako białka opiekuńcze w procesie zwijania białek.
	d. Struktury białkowe w glikoproteinach są specyficznie rozpoznawane i wiązane przez lektyny.
	e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	f. W komórkach ludzkich glikozylacja typu O jest przeprowadzana jedynie w aparacie Golgiego.

11

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń na temat przenoszenia impulsu nerwowego wywołanego związaniem acetylocholiny z jej receptorem są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. W punkcie czasowym „1” mamy do czynienia ze związaniem acetylocholiny z receptorem w błonie postsynaptycznej neuronu.
	b. W punkcie czasowym „2” inicjowane jest otwarcie kanału potasowego bramkowanego ligandem.
	c. W punkcie czasowym „3” inicjowane jest otwarcie kanału potasowego bramkowanego potencjałem.
	d. W punkcie czasowym „4” inicjowane jest otwarcie kanału sodowego bramkowanego ligandem, podczas gdy w punkcie „5” - kanału sodowego bramkowanego potencjałem.
	e. W punkcie czasowym „6” zarówno kanały sodowe, jak i potasowe są już całkowicie zamknięte.
	f. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.

12

Punkty: 2

Jednym z modeli, za pomocą których opisujemy właściwości allosteryczne karbamoilotransferazy asparaginianowej (ATCazy) jest tzw. model jednoprzejściowy. Model ten zakłada istnienie dwóch stanów konformacyjnych enzymu: R oraz T. Na rysunku - dla przypomnienia - zdefiniowano podstawowy parametr L tego modelu. Opierając się o zamieszczony wykres aktywności enzymu w funkcji stężenia substratu i wiedząc, że dla krzywej B, wyznaczonej w nieobecności regulatorów allosterycznych, parametr L=200, wskaż te z poniższych stwierdzeń, które są prawdziwe.

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Krzywa A może odpowiadać ATCazie poddanej działaniu inhibitora allosterycznego.
	b. Wszystkie krzywe charakteryzuje ta sama wartość L, ponieważ regulatory allosteryczne nie mają wpływu na ten parametr modelu.
	c. Krzywa C odpowiada ATCazie, która wykazuje wartość L<200, stąd niższa aktywność enzymu niż w przypadku krzywej B.
	d. Krzywa C może odpowiadać ATCazie rozdysocjowanej na podjednostki.
	e. Krzywa C może odpowiadać ATCazie w obecności GTP.
	f. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.

13

Punkty: 2

Na schemacie przedstawiono wyniki mutagenezy ukierunkowanej pewnej proteazy serynowej. Zaznaczone reszty tworzące triadę katalityczną zastępowano alaniną i mierzono aktywność zmutowanego punktowo enzymu (zielone słupki) wyznaczając wartość log₁₀(k_kat). Podobnie zbadano enzym zawierający alaninę we wszystkich trzech pozycjach triady (niebieski słupek). Dla porównania na schemacie przedstawiono wynik pomiaru aktywności dla enzymu niezmutowanego (czerwony słupek) oraz szybkość reakcji niekatalizowanej (czarny słupek).

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących roli poszczególnych reszt w katalizie uważasz za najbardziej prawdopodobne na podstawie danych uzyskanych w tym eksperymencie? Załóż, że każda z wprowadzonych mutacji zmienia wyłącznie strukturę pierwszorzędową enzymu.

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Najprawdopodobniej mutant podwójny, w którym reszty His i Asp zostałyby zamienione na Ala wykazywałby aktywność na poziomie kkat = 10^-4 [s^-1].
	b. Najprawdopodobniej mutant podwójny, w którym reszty His i Ser zostałyby zamienione na Ala wykazywałby aktywność na poziomie kkat = 10^-4 [s^-1].
	c. Mutacja reszty histydylowej na alaninę praktycznie uniemożliwia atak reszty serylowej na wiązanie peptydowe substratu.
	d. Mutacja reszty aspartylowej na alaninę praktycznie uniemożliwia atak reszty serylowej na wiązanie peptydowe substratu.
	e. Najprawdopodobniej w centrum aktywnym tego enzymu w pobliżu reszty Ser występuje inna reszta, która może pełnić rolę nukleofila wspomaganego pozostałymi resztami triady katalitycznej.
	f. Pewien wkład w katalizę mają także inne mechanizmy niż te związane bezpośrednio z triadą katalityczną.

14

Punkty: 1

Które z poniższych białek syntetyzowane są w postaci nieaktywnej i podlegają aktywacji na drodze proteolitycznej?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Enteropeptydaza.
	b. Lipaza trzustkowa.
	c. Kolagen.
	d. Chymotrypsyna.
	e. Czynnik X krzepliwości krwi.
	f. Żadne z podanych.
	g. Warfaryna.

15

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu reakcji katalizowanej przez enzym restrykcyjny EcoRV są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Reaktywnym nukleofilem (Nu), który tworzy kowalencyjny produkt pośredni z atomem fosforu substratu jest reszta tyrozylowa.
	b. Kataliza zachodzi zgodnie z mechanizmem przedstawionym na rysunku.
	c. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	d. EcoRV zawiera jon metalu, który uczestniczy w aktywacji nukleofila (Nu).
	e. Eksperymentalnie wykazano, że reakcja hydrolizy wiązania fosfodiestrowego zachodzi z odwróceniem konfiguracji stereochemicznej na atomie fosforu.
	f. Prawdziwość udziału w tej reakcji nukleofila (Nu) można zweryfikować za pomocą analizy stereochemicznej produktów hydrolizy chiralnych, tiofosforanowych pochodnych DNA, które zamiast jednego atomu tlenu w wiązaniu fosfodiestrowym zawierają atom siarki.

16

Punkty: 1

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących katalizy enzymatycznej są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Kataliza kowalencyjna to taka kataliza enzymatyczna, podczas której zachodzi zmiana układu wiązań kowalencyjnych w substratach reakcji, co prowadzi do powstania produktów.
	b. Enzymy katalizują reakcje chemiczne poprzez preferencyjne wiązanie stanu przejściowego reakcji w porównaniu z jej substratami i produktami.
	c. Podczas katalizy enzymatycznej jon metalu pełni najczęściej rolę nukleofila.
	d. Podczas katalizy enzymatycznej zachodzącej z przeniesieniem protonu rolę donora lub akceptora protonu pełni zawsze cząsteczka wody.
	e. Istotny wkład w katalizę enzymatyczną ma przybliżanie oraz odpowiednie wzajemne orientowanie substratów reakcji wielosubstratowych.
	f. Kataliza elektrostatyczna polega na ułatwieniu powstania lub stabilizacji stanu przejściowego za pomocą naładowanych grup enzymu lub za pomocą kofaktorów obdarzonych ładunkiem.

17

Punkty: 1

Każdemu z aktywnych przenośników wymienionych w lewej kolumnie przyporządkuj odpowiednią przenoszoną grupę.

lipoamid
FADH2
pirofosforan tiaminy
ATP
S-adenozylometionina

18

Punkty: 2

Które ze stwierdzeń dotyczących związku przedstawionego na rysunku są prawdziwe ?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Przedstawiony disacharyd to maltoza.
	b. Reszty cukrowe połączone są wiązaniem -1-6 -glikozydowym.
	c. Przedstawiony disacharyd to laktoza.
	d. Reszty cukrowe połączone są wiązaniem -1-6 -glikozydowym.
	e. Reszty cukrowe połączone są wiązaniem -1-4 -glikozydowym.
	f. Reszty cukrowe połączone są wiązaniem -1-4 -glikozydowym.
	g. Reszty cukrowe połączone są wiązaniem -1-2 -glikozydowym.
	h. Reszty cukrowe połączone są wiązaniem -1-2 -glikozydowym.
	i. Przedstawiony disacharyd to sacharoza.

19

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu katalitycznego chymotrypsyny są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Katalityczna reszta serylowa chymotrypsyny jest znacznie silniejszym nukleofilem niż wolna seryna, ponieważ w jej bezpośredniej bliskości w enzymie znajduje się reszta histydylowa, która stabilizuje uprotonowaną formę grupy hydroksylowej tej reszty serylowej.
	b. Związkiem pośrednim w reakcji katalizowanej przez chymotrypsynę jest acyloenzym.
	c. Kluczowa reszta katalityczna chymotrypsyny ulega modyfikacji w obecności organicznych fluorofosforanów, takich jak diizopropylofluorofosforan, co nieodwracalnie inaktywuje enzym.
	d. Reakcja hydrolizy rozpoczyna się od nukleofilowego ataku atomu tlenu grupy hydroksylowej reszty serylowej na atom azotu hydrolizowanego wiązania peptydowego.
	e. Ładunek ujemny tetraedrycznego produktu pośredniego reakcji katalizowanej przez chymotrypsynę jest stabilizowany dzięki oddziaływaniom z grupami NH białka w miejscu nazywanym dziurą oksyanionową.
	f. Proces hydrolizy wiązania peptydowego katalizowany przez chymotrypsynę jest reakcją dwufazową, przy czym szybkość fazy drugiej jest wyraźnie wyższa niż fazy pierwszej.

20

Punkty: 3

Stężenie jonów Na⁺ na zewnątrz i w środku komórki wynosi odpowiednio: 143 i 14,0 mM, a stężenie jonów K⁺ odpowiednio: 4,0 i 157 mM. Potencjał transbłonowy układu w temperaturze 37°C wynosi - 50 mV. R = 8.31 J·K^-1·mol^-1, F = 96.5 kJ·V^-1·mol^-1.
Proszę wskazać te z poniższych stwierdzeń, które są prawdziwe.

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Gdyby potencjał transbłonowy był równy zeru, transport jonów K^+ do wnętrza komórki wymagałby mniejszego nakładu energetycznego, niż przy potencjale wynoszącym - 50 mV.
	b. Równoczesny transport jonów Na^+ na zewnątrz komórki oraz jonów K^+ do środka komórki w tych warunkach może przeprowadzać wyłącznie pompa Na^+-K^+ hydrolizująca ATP.
	c. W podanych warunkach zmiana entalpii swobodnej transportu jonu Na^+ na zewnątrz komórki wynosi około +10.8 kJ·mol^-1, a transportu jonu Na^+ do środka komórki około -10.8 kJ·mol^-1.
	d. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	e. Wymieniony w tym zadaniu potencjał transbłonowy mógłby być wytwarzany przez kanał błonowy jonów Na^+ oraz niezależny kanał błonowy jonów K^+.

Punkty: 1

21

Na załączonym rysunku określone struktury błony komórkowej zostały opisane numerami. Wybierz, które z poniższych struktur mogą przedstawiać białko peryferyczne zakotwiczone w błonie za pomocą grupy palmitoilowej

22

Punkty: 2

Które z następujących stwierdzeń na temat aktywnego transportu jonów Na⁺, K⁺ oraz Ca²⁺ są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Pompa Ca^2+ jest zdolna do utrzymania nawet tysiąckrotnie niższego stężenia jonów Ca^2+ w cytozolu komórki mięśniowej niż w retikulum sarkoplazmatycznym.
	b. Wymiennik sodowo-wapniowy wykazuje znacznie wyższe powinowactwo do jonów Ca^2+ niż ATPaza Ca^2+ jednak jego zdolność do usuwania jonów wapnia z cytoplazmy jest znacznie mniejsza.
	c. Zarówno pompa Na^+-K^+, jak i pompa Ca^2+, należą do ATPaz typu P.
	d. Pompa Na^+-K^+ przyjmuje cztery stany konformacyjne, z których jeden jest ufosforylowane na reszcie aspartylowej.
	e. Pompa Na^+-K^+ generuje bezpośrednio różnicę potencjału chemicznego jonów Na^+ i K^+ w poprzek błony, ale ponieważ transportuje jony o identycznym znaku w przeciwnych kierunkach, nie wpływa na wartość potencjału elektrycznego błony.
	f. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.

23

Punkty: 1

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących struktury ATP są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. ATP zawiera dwa bezwodnikowe wiązania fosforanowe.
	b. ATP zawiera dwa wiązania fosfoestrowe.
	c. Jednostka cukrowa w ATP jest połączona z trifosforanem za pomocą wiązania fosfodiestrowego.
	d. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	e. Aktywną formą ATP jest zazwyczaj kompleks ATP z jonami Mg^2+ lub Ca^2+.
	f. Zasada azotowa wchodzącą w skład ATP to adenozyna.

.

24

Punkty: 1

Które z poniższych reakcji mogą być katalizowane przez kinazy NMP?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. AMP + ATP ↔ 2ADP.
	b. ATP + H2O ↔ ADP + Pi.
	c. Żadna z podanych reakcji.
	d. AMP + GTP ↔ ADP + GDP.
	e. GMP + ADP ↔ GDP + AMP.
	f. CDP + ATP ↔ CTP + ADP.

25

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących kaskady krzepnięcia krwi są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Aktywne czynniki kaskady krzepnięcia krwi działają krótko, m.in. dlatego, że mogą być zatrzymywane w wątrobie oraz degradowane proteolitycznie przez serpiny.
	b. Do syntezy funkcjonalnej protrombiny wymagana jest obecność witaminy K.
	c. Antytrombina III hamuje trombinę i niektóre z pozostałych czynników kaskady krzepnięcia krwi.
	d. Skrzepy fibrynowe są hydrolizowane przez aktywność enzymatyczną TPA.
	e. Białko C jest aktywowaną przez trombinę proteazą, która degraduje czynniki krzepliwości Va i VIIIa.
	f. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	g. Aktywacja protrombiny do trombiny wymaga dekarboksylacji reszt γ-karboksyglutamylowych.

26

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń na temat chymotrypsynogenu (ChTg) oraz procesu jego aktywacji są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Stabilną formą aktywnego enzymu jest tzw. chymotrypsyna π.
	b. Kluczowym zjawiskiem dla nabycia aktywności katalitycznej przez ChTg jest proteolityczne utworzenie nowego końca aminowego, który przemieszcza się do wnętrza białka i tworzy dodatkowe wiązanie jonowe z obecną tam ujemnie naładowaną grupą karboksylową.
	c. ChTg jest nieaktywny, ponieważ ani triada katalityczna, ani wnęka wiążąca substrat, nie są w nim zupełnie ukształtowane.
	d. ChTg jest pojedynczym łańcuchem polipeptydowym.
	e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
	f. ChTg posiada szczątkową aktywność katalityczną, która jest istotna w procesie jego aktywacji.
	g. Pierwsza aktywna forma chymotrypsyny powstaje z ChTg po rozcięciu dwóch wiązań peptydowych.

27

Punkty: 1

Aktywacja zymogenów trzustkowych rozpoczyna się od:

Wybierz jedną odpowiedź

	a. przekształcenia trypsynogenu w trypsynę przez enteropeptydazę w żołądku.
	b. Żadna z odpowiedzi nie jest prawidłowa.
	c. przekształcenia prokarboksypeptydazy w karboksypeptydazę przez trypsynę w dwunastnicy.
	d. autoproteolizy chymotrypsynogenu do trypsynogenu w dwunastnicy.
	e. autoproteolizy pepsynogenu do pepsyny w żołądku.
	f. przekształcenia chymotrypsynogenu w chymotrypsynę przez trypsynę w dwunastnicy.

28

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu reakcji katalizowanej przez ludzką anhydrazę węglanową II są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Rola jonu cynku polega na zwiększeniu zasadowego charakteru aktywnej reszty aminokwasowej obecnej w centrum katalitycznym anhydrazy.
	b. Rola jonu cynku polega na obniżeniu pKa z wartości >15 dla samej wody do wartości rzędu 7 dla kompleksu [His3Zn^2+]H2O.
	c. Kataliza wymaga aktywacji cząsteczki wody przez jon Zn^2+.
	d. Ponieważ podczas reakcji katalizowanej przez anhydrazę następuje zmiana stopnia utlenienia atomu węgla w CO2, konieczny jest udział jonu Zn^2+, który uczestniczy tu w przeniesieniu elektronu.
	e. Istotny wkład w szybkość reakcji katalizowanej przez anhydrazę węglanową wnosi mechanizm nazywany wahadłem protonowym, ułatwiający transfer protonu pomiędzy dwiema aktywnymi katalitycznie resztami aminokwasowymi.
	f. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.

29

Punkty: 1

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących lipidów błon biologicznych są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. Fosfoglicerydy są fosfolipidami błonowymi zbudowanymi na bazie kwasu fosfatydowego.
	b. Podobnie jak sfingomieliny, glikolipidy zawierają w swej budowie resztę kwasu fosforowego.
	c. Fosfatyd to najprostsza sfingomielina.
	d. Zarówno gangliozydy, jak i cerebrozydy są sfingolipidami.
	e. Glikolipidy są sfingolipidami i zawierają fragmenty cukrowe.
	f. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.

30

Punkty: 2

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących enzymów wykorzystujących jedną z reszt aminokwasowych jako silny nukleofil do hydrolizy wiązania peptydowego są prawdziwe?

Wybierz co najmniej jedną odpowiedź

	a. W przypadku niektórych proteaz w powstawaniu silnie reaktywnego nukleofilu zamiast histydyny uczestniczy bezpośrednio pierwszorzędowa grupa aminowa pochodząca z reszty lizylowej lub z aminowego końca enzymu.
	b. Jedną z istotnych strategii generowania silnego nukleofilu jest tzw. triada katalityczna.
	c. Mimo, iż karboksypeptydaza II z ziaren pszenicy wykorzystuje triadę katalityczną złożoną z takich samych reszt co chymotrypsyna, enzymy te nie wykazują ogólnego podobieństwa strukturalnego.
	d. Podobną do chymotrypsyny strategię triady katalitycznej wykorzystują proteazy uczestniczące w kaskadzie krzepnięcia krwi.
	e. Rolę kluczowego nukleofilu w niektórych proteazach pełni reszta treonylowa.
	f. Chymotrypsyna, trypsyna i elastaza są białkami homologicznymi, ale wykazują odmienną specyficzność substratową z powodu różnic w budowie kieszeni S1 wiążącej substrat.

Odp:

Zamieszczam odpowiedzi do testu zamieszczonego przez eleonorę, (by me and Kalit zwany Guru, momentami z drobną pomocą Styera), powinno być more or less ok:
1. a,b,c
2. b
3. brak rysunku
4. a,b,c
5. c,e
6. c,d
7. brak rysunku
8. a,f
9. brak rysunku
10.c,f
11.brak rysunku (obstawiane: b,c)
12.brak rysunku (obstawiane: f)
13.c,f
14.b,c,d,e
15.brak rysunku (obstawiane: d,e,f)
16.b,e,f
17.acylowa,elektrony,aldehydowa,fosforanowa,metylowa
18.brak rysunku
19.b,c
20.b
21.brak rysunku
22.a,c
23.a,f
24.a,d
25.b,c,e
26.b,d
27.b
28.b,c
29.a,d
30.a,b,d,e,f

Mała errata, przynajmniej tyle co wyłapałem


5 - b
6 - c,d,e
7 - b,c,f
8 - a
15 - e,f
19 - b,c,e
20 - b,c
21 - a,c
25 - a,b,c,d,e (a przynajmniej tak mi się wydaje)
29 - a,d,e

5. Niby jak przeliczyłam to ze wzoru wychodzi, że masz rację ale mi się to nielogiczne wydaje...
7. i 21. Zazdroszczę że Ci się obrazki pokazują. Jeśli Ci się nie pokaząły to zważ iż były różnice w numerowaniu.
8.Wytłumacz mi czemu reakcje enzymatyczne są odwracalne Twoim zdaniem? Czy nie byłyby odwracalne czasem tylko wtedy gdyby w drugą stronę przeprowadzały je te same enzymy?
15.Jon Mg nie aktywuje czasem cząsteczki wody która atakuje atom fosforu? Aktywowana czasteczka wody jest nukleofilem.
6., 19. i 20. Mój bład.
25. a) serpiny to inhibitry proteaz a nie proteazy - nie degradują
d) jest głupio sformuowane ale obstaję przy tym, że TSA aktywuje plazminogen ale sam skrzepów nie hydrolizuje, więc moim zdaniem to fałsz.
29. Pewien jesteś że glikolipidy musza zawierać sfingozynę? Bo z tego co wiem niekoniecznie.

8. Reakcje enzymatyczne są zwykłymi reakcjami tyle, że uczestniczy w nich enzym zwiękrzający ich szybkość, ale jako tako mają stałą równowagi czyli reakcja przebiega w obie strony, a więc są odwracalne

15. Ale w przedstawionym przebiegu reakcji Nu nie jest wodą, a jeżeli uważasz inaczej to nie zaznaczeniem b przeczysz sama sobie

25. a) racja rozpędziłem się

d) jak piszesz dziwnie sformułowane i zależy od interpretacji, bo aktywność enzymatyczną TPA jest wymagana, choć TPA jako takie hydrolizy nie przeprowadza

29. Przynajmniej w Stryer-ze tak pisali

7 i 21. powiedzmy, że miałem dostęp do tych obrazków

Ok. W 8 masz chiba rację. Po prostu jakoś mi nie pasi, żeby się enzym łączył z produktem i przekształcał go w substrat...
15. Poprawny mechanizm "jest analogiczny do stosowanego przez metaloproteazy, zaktywowana cząsteczka wody atakuje bezpośrednio atom fosforu" (S str.247) A to że na poprawnym obrazku nie ma zaznaczonego nukleofila moim zdaniem o niczym nie swiadczy. Enzymu też tam nie zaznaczyli

29.W Styerze pisali, że "W komórkach zwierzęcych" glikolipidy są pochodnymi sfingozyny. U roślin, glonów i czegoś tam jeszcze występują glikoglicerolipidy. Po za tym jeśli się nie mylę to kwas sjalowy jest glikoglicerolipidem. Może przesadzam z drążeniem ale ja bym powiedziała, że nie muszą mieć sfingozyny.

Jesli mówiąc że miałeś dostep do obrazków masz na myśli że Ci się trafiły na kole to wcale nie zdaczy, że np. przy 21 kolejnośc odpowiedzi nie była różna u różnych osób. Zresztą taka odpowiedź na temat nieistniejącego obrazka średnio ma cel bo jeśli ktoś go nie wylosował to nie wie o co chodzi.

8. Ale enzym nie zna kierunków, on jest nastawiony na produkt pośredni który w przypadku obu reakcji jest taki sam, a kierunek reakcji wyznacza stała równowagi która może preferować produkt ale nie może negować istnienia substratu

15. Wiadomo, że zadanie odnosi się do danego schematu, którego niestety nie widzimy, lecz jeśli przyjmujemy, że nukleofilem pokazanym na obrazku jest woda to musimy także zaznaczyć, że odpowiedź "b" jest poprawna gdyż taki schemat jest poprawny, więc albo oba albo żaden

29. Możliwe, że masz racje z tymi roślinami i glonami, ale według systemu odpowiedź "e" jest poprawna, a z systemem nie wygrasz

z 21 to nie zauważyłem tego zadania i dałem odpowiedź do 22 myśląc, że to 21

---