55. Przemiany puli aminokwasów.
SkÅ‚ad puli ulega ciÄ…gÅ‚ej wymianie - jedne aminokwasy sÄ… wbudowywane w biaÅ‚ka lub ulegajÄ… utlenieniu i znikajÄ… z puli, a inne sÄ… uwalniane z rozpadajÄ…cych siÄ™ biaÅ‚ek komórkowych i wchodzÄ… do puli, wspólnie z aminokwasami wchÅ‚oniÄ™tymi z przewodu pokarmowego, a pochodzÄ…cymi z biaÅ‚ek pożywienia oraz biaÅ‚ek endogennych, rozÅ‚ożonych przez enzymy trawienne. Wymianie takiej podlega w ciÄ…gu doby Å›rednio 80-100g biaÅ‚ek endogennych i jest ona najbardziej nasilona w bÅ‚onie Å›luzowej jelita, a praktycznie zerowa w kolagenie. Aminokwasy powstajÄ…ce z rozÅ‚ożenia biaÅ‚ek endogennych sÄ… identyczne z aminokwasami z biaÅ‚ek pokarmowych. Można powiedzieć, że aminokwasy „przepÅ‚ywajÄ…” jakby przez wolnÄ… ich pulÄ™ w organizmie. Tempo tego przepÅ‚ywu to u czÅ‚owieka 4g/ kg masy ciaÅ‚a/ 24godz. U czÅ‚owieka okres półtrwania poszczególnych aminokwasów w ich wolnej puli jest bardzo zmienny i np. dla leucyny w mięśniu wynosi ok. 45 minut a dla lizyny ok. 10 godzin; w wÄ…trobie wartoÅ›ci te sÄ… wielokrotnie mniejsze. Można przyjąć, że w ciÄ…gu doby w organizmie czÅ‚owieka wymianie ulega ok. 5% biaÅ‚ek. Niewielka ilość biaÅ‚ek na każdym etapie życia jest tracona w postaci wÅ‚osów, zÅ‚uszczajÄ…cego siÄ™ nabÅ‚onka, potu oraz z kaÅ‚em i moczem. Wszystkie te straty pokrywane sÄ… dziÄ™ki syntezie z puli aminokwasowej.
Transaminacja - przekształcenie jednego aminokwasu w odpowiedni keto kwas z jednoczesnym przekształceniem innego ketokwasu w aminokwas. Transaminacji nie ulegają lizyna, treonina i prawdopodobnie histydyna
Oksydacyjna deaminacja zachodzi w wątrobie. Powstający po usunięciu jonu wodorowego aminokwas jest hydrolizowany do odpowiedniego ketokwasu z równoczesnym wytworzeniem NH4, który pozostaje w równowadze z NH3. Może on także być przyłączany przez aminokwasy, w wyniku czego powstają odpowiednie amidy. Odwrotna reakcja zachodzi w nerkach, gdzie NH4 jest przekształcany do wydzielanego do moczu NH3. W moczu NH3 reaguje z jonami wodorowymi, tworząc NH4 , co umożliwia wydzielenie z moczem większej ilości wodoru. Leucyna, izoleucyna, fenyloalanina i tyrozyna to aminokwasy ketogenne, bo mogą być przekształcane w acetooctan (ciało ketonowe). Alanina i wiele innych to glukogenne.
Większość NH4 powstającego w wątrobie jest przekształcana w wydalany z moczem mocznik. Jon NH4 tworzy karbamoilofosforan, który po przekształceniu w mitochondriach do ornityny tworzy cytrulinę. Po przekształceniu cytruliny do argininy dochodzi do odszczepienia mocznika i odtworzenia ornityny (cykl mocznikowy).
Puryny i pirymidyny (nukleozydy) powiązane z rybozą są składnikami koenzymów, DNA i RNA. Dostarczane z dietą kwasy nukleinowe ulegają strawieniu a ich składowe - puryny i pirymidyny- wchłanianiu, ale przeważająca część puryn i pirymidyn jest syntetyzowana z aminokwasów, głównie w wątrobie. Następnie dochodzi do syntezy nukleotydów, RNA i DNA. RNA jest w dynamicznej równowadze z pulą aminokwasów, a raz wytworzony DNA jest metabolicznie stabilny przez całe życie. Puryny i pirymidyny uwalniane podczas rozpadu mogą być ponownie wykorzystane dosyntezy kwasów nukleinowych lub katabolizowane. Mniejsze ich ilości są wydzielane w postaci niezmienionej z moczem. Pirymidyny są katabolizowane do CO2 i NH3, a puryny są przekształcane w kwas moczowy.
Kwas moczowy powstaje m.in. w wyniku degradacji puryn.
Kwas moczowy powstaje m.in. w wyniku degradacji puryn.
Transaminacja, aminacja, deaminacja to wspólna pula metaboliczna
5 tez związanych z pulą wolnych aminokwasów:
A wolne aminokwasy przedstawiają mały ułamek wszystkich aminokwasów znajdujących się w organizmie,
B większość wolnych grup aminowych należy do czterech aminokwasów: alaniny, kwasu glutaminowego, glutaminy i glicyny,
C połowa lub więcej puli każdego z wolnych aminokwasów znajduje się w mięśniach szkieletowych,
D stężenie aminokwasów, zwłaszcza nie niezbędnych jest większe w komórkach aniżeli w osoczu krwi,
E względne ilości różnych wolnych aminokwasów pozostają w niewielkim związku z przeciętnym składem białek tkankowych czy białek pożywienia, ani też ze znanym nam zapotrzebowaniem organizmu na aminokwasy niezbędne.
Aminokwasy mogą być użyte jako materiał do budowania białek i innych cząsteczek, lub też - po utlenieniu do mocznika, wody i dwutlenku węgla - jako źródło energii. Proces oksydacji zaczyna się od usunięcia grupy aminowej podczas transaminacji. Wchodzi ona w cykl mocznikowy, pozostawiając szkielet węglowy w postaci ketokwasu. Niektóre z tych kwasów pełnią później różne role w cyklu kwasu cytrynowego, na przykład deaminują glutaminian - kwas alfa-ketoglutarowy]. Aminokwasy glukogenne mogą również przekształcić się w glukozę w procesie glukoneogenezy.
BiaÅ‚kaÂ
Poszczególne organizmy mogą różnić się pod względem umiejętności syntezy 20 podstawowych aminokwasów. Większość bakterii i rośliny może syntezować wszystkie z nich, jednak ssaki posiadają zdolność syntezy jedynie 10. Pozostałe 10 aminokwasów, niezbędnych dla funkcjonowania organizmu, musi być dostarczane wraz z pożywieniem. Wszystkie one powstają dzięki procesom glikolizy, cyklu kwasu cytrynowego lub szlaku pentozofosforanowego. Azot dostarczany jest przez kwas glutaminowy i glutaminę. Synteza aminokwasów uzależniona jest od uformowania się odpowiednich cząsteczek alfa-ketokwasów, przechodzących w aminokwasy po transaminacji.
Aminokwasy przechodzą w białka w procesie łączenia ich wiązaniami peptydowymi w łańcuchy. Każde białko posiada unikalną sekwencję aminokwasów. Aminokwasy przed połączeniem muszą zostać aktywowane poprzez połączenie z cząsteczką tRNA za pomocą wiązania estrowego. Aminoacyl-tRNA powstaje w zależnej od ATP reakcji katalizowanej przez enzym - syntazę aminoacylu tRNA[81]. Ten aminoacyl-tRNA jest następnie włączany do powstającego łańcucha białkowego według informacji zawartej w mRNA[82].
Synteza i utylizacja nukleotydów.
Nukleotydy powstają z aminokwasów, dwutlenku węgla i kwasu mrówkowego w procesach wymagających dużej ilości energii metabolicznej[83]. Z tego powodu większość organizmów wykształciła mechanizmy powtórnego wykorzystywania nukleotydów[83][84]. Puryny syntezowane są tak jak nukleozydy. Zarówno adenina, jak i guanina powstają z pierwotnego nukleozydu inozyny, tworzonego z aminokwasów glicyny i glutaminy oraz kwasu asparaginowego i jonów mrówczanowych pochodzących z koenzymu tetrahydrofolianu. Pirymidyny zaś syntezowane są z kwasu orotowego, który powstaje z glutaminy i kwasu asparaginowego[85].
Biosynteza aminokwasów - procesy biochemiczne, zachodzące w organizmie, prowadzące do powstania aminokwasów. Aminokwasy, które organizm jest w stanie zsyntetyzować, zwane są aminokwasami endogennymi. Szlaki biosyntezy aminokwasów różnią się w zależności od aminokwasu i od organizmu. Wszystkie aminokwasy biogenne, w zależności odmetabolitu pośredniego, z którego się wywodzą, można podzielić na 6 grup:
Aminokwasy powstające z α-ketoglukaranu, który pochodzi z cyklu kwasu cytrynowego. Do tej grupy należy tzw. rodzina glutaminianu. W jej skład wchodzi glutaminian oraz wywodzące się z niego: glutamina, prolina i arginina.
Aminokwasy powstające ze szczawiooctanu, który pochodzi z cyklu kwasu cytrynowego. Do tej grupy należy tzw. rodzina asparaginianu. W jej skład wchodzi asparaginian, wywodzące się z niego: asparagina, metionina, treonina i lizyna oraz izoleucyna, powstająca z treoniny.
Aminokwasy powstające z 3-fosfoglicerynianu, który pochodzi z glikolizy. Do tej grupy należy tzw. rodzina seryny, w skład której wchodzi seryna oraz wywodzące się z niej cysteina iglicyna.
Aminokwasy powstające z pirogronianu, który pochodzi z glikolizy. Do tej grupy należy tzw. rodzina pirogronianu, w skład której wchodzi alanina, walina i leucyna.
Aminokwasy powstające z fosfoenolopirogronianu, pochodzącego z glikolizy i erytrozo-4-fosforanu, pochodzącego ze szlaku pentozofosforanowego. Do tej grupy należy tzw. rodzina aminokwasów aromatycznych, w skład której wchodzi fenyloalanina, tyrozyna i tryptofan.
Aminokwas, powstający z rybozo-5-fosforanu, pochodzącego ze szlaku pentozofosforanowego. Aminokwasem tym jest histydyna.
Cykl ornitynowy, zwany też cyklem mocznikowym lub mocznikowym cyklem Krebsa - cykl przemian biochemicznych (reakcji enzymatycznych) trzech aminokwasów: ornityny,cytruliny i argininy prowadzący do powstania mocznika.
Na powstawanie mocznika w organizmach zwierzęcych po raz pierwszy zwrócił uwagę Marceli Nencki, natomiast przebieg jego syntezy (powstawania) przedstawił Hans A. Krebs w 1932roku.
Przebieg cyklu [edytuj]
Do cyklu wprowadzany jest karbamoilofosforan powstały z amoniaku i dwutlenku węgla. Cykl przebiega w mitochondriach i cytoplazmie komórek wątroby (hepatocytów) i wymaga dostarczenia energii w postaci ATP, a jego produktem końcowym jest mocznik.
Reakcje zużywania aminokwasów rozpoczynają się od odłączenia grupy aminowej w procesie deaminacji. Produktami tych reakcji są łańcuchy węglowe (tzw. ketokwasy) oraz jon amonowy. W komórkach człowieka łańcuchy węglowe po przemianach mogą być włączone w glikolizę lub do cyklu Krebsa. Jon amonowy jest silnie toksyczny. W organizmie człowieka jest więc szybko przekształcany w substancję mniej toksyczną i dobrze rozpuszczalną w wodzie - mocznik. W ciągu doby człowiek wydala średnio kilkanaście gramów mocznika w postaci stężonego moczu.
W rzeczywistości w komórkach zużycie większości aminokwasów rozpoczyna się od przeniesienia reszty aminowej (-NH2) (reakcja transaminacji) z rozkładanego aminokwasu na jedną z dwóch cząsteczek: glutaminian lub pirogronian. Ten pierwszy przekształca się wówczas w glutaminę, drugi w alaninę. Aminokwasy te są wydzielane do krwi i wędrują do wątroby. W komórkach wątroby glutamina ulega deaminacji, a powstający jon amonowy natychmiast przetwarzany jest w tak zwany karbamylofosforan. Ten włączony jest do cyklu mocznikowego (ornitynowego). Zachodzi częściowo w cytoplazmie, częściowo w mitochondrium, gdzie sprzężony jest z cyklem Krebsa. Cykl mocznikowy jest silnie endoergiczny - do wytworzenia 1mola mocznika zużywane są 4 mole wiązań wysokoenergetycznych.
Mocznik z krwią wędruje do nerek, gdzie jest wydalany. Tak więc nadmiar azotu z aminokwasów jest usuwany przez cykl ornitynowy. Inaczej przedstawia się rozkład nadwyżki zasad azotowych. W komórkach człowieka puryny przekształcane są w kwas moczowy, pirymidyny natomiast są rozkładane do mniejszych cząsteczek, które następnie są włączane do szlaków podstawowych.
kreatyna
Wydalanie z moczem
Pula aminokwasowa
pokarm
aminacja
Puryny i pirymidyny
Białka ustrojowe
transaminacja
Hormony i neurotransmittery
deaminacja
Białka nieaktywne, np. włosy