IMMOBILIZACJA ENZYMÓW
PODSTAWOWE SPOSOBY IMMOBILIZACJI BIAŁKA:
Adsorpcja na nierozpuszczalnych nośnikach
Wiązanie kowalencyjne z nośnikiem zwykle aktywowanych przez czynnik sprzęgający
Inkluzja w strukturze żelu lub w półprzepuszczalnych błonach
Immobilizacja to przestrzenne ograniczenie czegoś np. składnika E w układzie. Istnieje immobilizacja powierzchniowa (1 i 2) i objętościowa (3).
Metoda 1 i 3 dotyczy tez immobilizacji organicznej i tkanek (biofilm). Z kolei 3 pozwala też na zamknięcie mikroorganizmów żywych.
ZALETY PRACY Z ENZYMAMI IMMOBILIZOWANYMI
łatwość izolacji katalizatora od mieszaniny reakcyjnej z możliwością jego wielokrotnego wykorzystania – układ dwufazowy: ciało stałe-ciecz
możliwość prowadzenia reakcji w systemie ciągłym
systemy okresowe
układ stacjonarny
Kiedy reakcja wolna, a wrażliwa na mieszanie
układ z mieszaniem
Układ pseudojednorodny – takie same warunki panują w całej objętości, brak lokalnych gradientów stężeń. Pseudo – bo to heterogeniczny układ
Proces (pół)ciągły
charakteryzuje się tym, że w sposób ciągły dozujemy do roztwór substratu do bioreaktora (np. kolumna z wypełnieniem)
tam gdzie jest biokatalizator – tam jest reakcja czyli reaktor
żeby był tylko „odbiór produktu” bez substratu należy zmienić (zwiększyć) długość kolumny (czas przebywania w reaktorach) lub natężenie (wolniej dozować)
półciągły, gdy strumień jest dzielony: jest odbiór produktu + zawracanie mieszaniny reakcyjnej
dla E natywnego nie stosuje się procesu ciągłego, bo będzie „wychodził” z kolumny
wysoka stabilność katalizatora zmiana struktury
zmiana specyficzności substratowej białka
ADSORPCJA
wiązania wodorowe
oddziaływania van der Waalsa
oddziaływania elektrostatyczne
oddziaływania hydrofobowe
Rzadko nośnikiem jest Caktywny, raczej polimer akrylowy, tworzywa sztuczne, granit czy szkło.
Silny wpływ środowiska
wartość pH, siła jonowa roztworu białka (oddziaływanie elektrostatyczne)
stężenie enzymu w roztworze (liczba miejsc wiązania enzymu)
temperatura (dyfuzja T, aktywność enzymu T )
Powierzchnia właściwa, porowatość nośnika (średnica porów. ½ średnica białka)
Adsorpcja
duża dostępność do czyszczenia (-)uwzględnia niską trwałość,
nośników (-) enzymu (+) silny wpływ środowiska(pH),
odrywanie się nośnika (desorpcja)
Nośniki:
Nieorganiczne:
krzemionka
wodorotlenek glinu/tytanu
glinokrzemiany
szkło porowate
węgiel aktywny
materiały ceramiczne
Organiczne:
polisacharydy (agar, celuloza, skrobia –dekstran)
polimeryczne żywice jonowymienne
kolagen
Modyfikacje nośników
Odpowiednie uwodnienie
Zmiana pH
Przyłączenie grup hydrofobowych (alkilowych, fenolowych)
IMMOBILIZACJA PRZEZ WIĄZANIA CHEMICZNE
Znajomość struktury białka
Grupy obecne w białku, potencjalnie tworzące wiązania z nośnikiem:
tiolowe (Cys)
grupy wodorotlenowe (Ser, Tyr, Thr)
karboksylowe (Glu, Asp, C’-końcowe COO-)
guanidynowe (Arg) łatwo dobrać
imidazowe (His) aktywator
aminowe (Lys, N’-końcowe NH3+):
występują licznie
występuje wysoce reaktywna – ilość i jakość reakcji
II-rzędna funkcja w utrzymywaniu struktury, aktywności białka
Prościej dobrać aktywator od nośnika
Przykłady:
immobilizacja przez wiązania amidowe C-N
czynnik acylujący (aktywator) to chlorobezwodnik kw. karboksylowego
immobilizacja przez wiązanie –C=N-
IMMOBILIZACJA NA DRODZE CHEMICZNEJ
duża trwałość, mały wpływ środowiska zewnętrznego (+)
oddalenie enzymu od nośnika (-), zmniejszenie wpływu dyfuzji (substratu)
zmiana właściwości immobilizowanego katalizatora (+/-)
INKLUZJA W ŻELU/BŁONACH PÓŁPRZEPUSZCZALNYCH
monomer polimer
Efektywność immobilizacji na drodze inkluzji
zawartość enzymu charakter polimerycznej matrycy
w żelu (+kopolimer)
rozmiary porów w żelu
(skład sieciujący) rozmiary cząsteczek żelu
Polimeryzacja – połączenie się cząsteczek monomeru w proste lub rozgałęzione polimery.
Zachodzi samorzutnie lub/z dodatkiem kopolimeru, który pomaga
w polimeryzacji np. skrobia
Stężenie i jakość monomeru i kopolimeru > wpływają na polimeryzację (zwarty polimer,
ale nie za bardzo, bo substrat nie dotrze
do wnętrza polimeru)
MIKROKAPSUŁKOWANIE
Roztwór enzymu + eter dietylowy (emulgator) + monomer eterowy roztwór polimeru np. azotan celulozy
Po zetknięciu z powierzchnię zemulgowanych kropelek nierozpuszczalnych w wodzie – monomer polimeryzuje tworząc cienką warstewkę
Stężenie emulgatora wpływa na ∅ kapsułki:
małe utrudniają transport S/P
duże ulegają destrukcji
Wielkość porów polimeru decyduje o transporcie substancji i produktu – małe utrudniają.
ZAMKNIĘCIE WE WŁÓKNACH
Roztwór enzymu w organicznym roztworze monomeru, który polimeryzując tworzy włókno pochodne celulozy, polichlorek winylu, poli-L-metyloglutaminian
Dysze przytłaczające roztwór do cieczy organicznych (np. toluen), w której następuje polimeryzacja.
Rola kopolimeru:
wiązanie pośrednie z monomerami
stwarza środowisko, które ułatwia łączenie się z monomerami
SIECIOWANIE np. aldehyd glutarowy
wiąże się po grupach –NH3
reaguje z grupami aminowymi
łapie grupy NH3 i łączy je z grupami enzymu
najprostsza metoda – jeżeli enzym jest aktywny
OZNACZENIA PO IMMOBILIZACJI – BADANIE PARAMETRÓW
wydajność wiązania
ile enzymu się związało w stosunku do masy enzymu, która podaliśmy – metoda Lowry’ego – zadawalająca ≥ 70%
aktywność enzymu po immobilizacji
porównuje się z aktywnością enzymu natywnego, wyrażana w g lub molach białka (jak aktywny jest g białka) np. amylazy hydroliza skrobi aktywność > 50%
stabilność aktywności preparatu
powtarza się co pewien czas h/24h/miesiąc, test na aktywność, spadający procent aktywności w czasie
czas połowicznego zaniku
+ uniwersalność względem enzymów komórki (systemy wieloenzymatyczne)
+ wysoka odporność preparatów (chemiczna, termiczna, mechaniczna)
+ wysoka odporność na zakażenia mikrobiologiczne (decyduje porowatość)
utrudniona dyfuzja substratów- pobiera substancje wielkocząsteczkowe
Inkluzja pozwala na przeprowadzenie procesu z wieloma cząsteczkami enzymu róznych np. hydroliza skrobi wymaga 3 enzymów