I AMINOKWASY PEPTYDY BIAŁKA
Aminokwasy - budowa, właściwości fizyko-chemiczne, wzory
Aminokwasy jako jony dwubiegunowe
Aminokwasy powszechnie występujące w białkach
AK naturalnie nie wyst. W białkach
kryteria podziału AK
testy wykrywające AK: aromatyczne (phe, tyr, trp) siarkowe (cysteina, cystyna)
reakcje AK (gr. aminowa i karboksylowa)
metody wykrywania ilościowego - miareczkowanie formolowe
wnioski wynikające z pK niektórych AK
omówić wiąz. Peptydowe
Peptydy - budowa, podział, nazewnictwo
właściwości fizyko-chemiczne peptydów
biologicznie aktywne peptydy - przykł, znaczenie
identyfikacja grup NH2 - końcowych i COOH - końcowych w PEP
oznaczanie sekwencji AK w PEP
Laboratoryjna synteza łańcuchów poliPEP
klasyfikacja białek: proste i złożone/ doborowe i niedoborowe
Białka osocza (funkcja i właściwości)
Struktura białek
Wielkość alfaHelisy i struktura fałdowej
wiązania w białkach
Właściwości fizyko-chem. Białek
punkty izoelektryczny i izojonowy
właściwości białka w punkcie izoelektrycznym
mechanizm wsalania i wysalania
czynniki denaturujące białko
wpływ soli metali na białko
II ENZYMY I KOENZYMY
Enzymy jako biokatalizatory
Pojęcia termodynamiczne: r. egozo, endoergiczna/ prawo działania mas/ stała równowagi chemicznej/ energia: swobodna, aktywacji/ entropia i entalpia
Mechanizm katalizy enzymatycznej na przykł. Lizozymu
specyficzność katalizy enz. (spec. działania i spec. wobec substratu)
podział i nomenklatura enz.
Izoenz. I heteroenz.
Jednostki enzymatyczne
Typy budowy centrów aktywnych
kinetyka enzymatyczna
Stała Michaelisa - co to i o czym stanowi
warunki aktywności enz.: temp, optimum pH, stężenie enz/substr, aktywatory i inhibitory
typy hamowań enzymatycznych
koenz. A grupy prostetyczne
koenz. Witaminowe - udział w przemianach
budowa, funkcja i podział koenz:
- przenoszące wodór: NAD(w), NADP(w), PNG(w), FAD(w), koenz. Q, kw. Liponowy
- przenoszące gr. atomów: ATP(w) CDP, UDP, aktywny siarczan PAPS, aktywny metyl, biotyna, koenzym A, pirofosforan tiaminy, PLP(w), kw. Tetrahydrofoliowy FH4
III KWASY NUKLEINOWE I BIOSYNTEZA BIAŁKA
Puryna i pirymidyna - wzory i numeracja atomów w pierścieniu
zas. Purynowe i pirymidynowe w kwasach nukleinowych - wzory
zas. Pur. I piry. Rzadko wyst. W kw. Nukleinowych
pochodne adeniny i guaniny - ksantyna, hipoksantyna, kw. Moczowy - wzory
budowa nukleotydów i nukleozydów + przykłady
funkcje zw. O budowie nukleotydowej nie wchodzących w skł. kw. Nukl.
zw. wysokoenergetyczne nukleotydowe - przykł.
zw. wysokoenerg. Nienukleotydowe - przykł.,
kw. rybonukleinowy/ kw. Deoksyrybonukleinowy → rodzaje, budowa, struktura przestrzenna, funkcje, właściwości
replikacja DNA
cechy kodu genetycznego
transkrypcja
biosynteza białek: rola DNA w biosynt., budowa operonu, aktywacja AK(w), rola t-RNA
Translacja (inicjacja, elongacja, terminacja)
czynniki uczestniczące w biosynt. Białek
mutacje, uszkodzenia i naprawa DNA (substytucja, delecja, insercja)
wpływ antybiotyków na biosynt. Białek
metody rozdziału mat. Biologicznego- chromatografia, elektroforeza, spektrofotometria
IV PRZEMIANY BIAŁEK I KW. NUKLEINOWYCH
Bilans azotowy
pula aminokwasowa: pochodzenie AK ustrojowych
ogólne przemiany AK: transaminacja(w), dekarboksylacja(przykł. Amin i ich rola), transamidacja(w), przegrup. W rodniku, oksydacyjna deaminacja(w)
cykl mocznikowy(w)
synteza glutaminy i jej rola w ustroju (w)
przemiany glicyny, seryny i alaniny
przemiany AK siarkowych
przeminy fenyloalaniny i tyrozyny(w)
bloki metaboliczne w przemianach fenyloalaniny i tyrozyny
choroba metaboliczna - pojęcie i przykłady
metabolizm kw. Asparaginowego i glutaminowego
końcowe metabolity AK: tryptofan, histydyna, treonina, leucyna, izoleucyna
aminokwasy z których powst: pirogr, szczawiooct, alfa-ketoglut, acetooct, bursztynyloCoA
trawienie białek - enz, proteolityczne(podział, mechanizm), funkcja proteaz i lokaliz.
Drogi wprowadzania szkieletów węglowych AK do cyklu krebsa
Rozkład puryn (w)
rozkład pirymidyn
biosynteza nukl. Pirymidynowych (w)
biosynteza nukl. Purynowych (zw. Z których powst. Pierścień + enzymy i koenzymy)
V PRZEMIANY WĘGLOWODANÓW
Trawienie i wchłanianie WW - losy wchłoniętych WW
Synteza glikogenu z glukozy, znaczenie
Aktywacja fosforylazy glikogenowej
kontrola aktywności syntetazy glikogenowej w mięśniu
kontrola akt. Fosforylazy mięśniowej
rozkład glikogenu do glukozy
glikoliza (w)
efekty energetyczne beztlenowej i tlenowej przemiany glukozy
przemiany pirogronianu
cykl Cori
specyfika glikolizy w erytrocytach i w mięśniach
glukoneogeneza (w) i glukoneogeneza z AK (w)
cykl pentozowy (w)
zasadnicze różnice między szlakiem Embdena-Mejerchofa a pentozowym
Hormonalna regulacja przemiany węglowodanów
Cykl krebsa (w)
Utlenianie biologiczne
Łańcuch oddechowy
Fosforylacja oksydacyjna i substratowa
VI LIPIDY
Lipidy o znaczeniu fizjologicznym
trawienie i wchłanianie lipidów
losy wchłoniętych lipidów
biosynteza kwasów tłuszczowych (w)
biosynteza tłuszczów (w)
beta-oksydacja kwasów tłuszczowych (w)
aktywacja kw. Tłuszczowych i wejście do matriks
efekt energetyczny beta oksydacji na przykładzie utleniania palmitynianu
przemiany glicerolu
podobieństwa i różnice: anabolizm / katabolizm kw. Tłuszczowych
ketogeneza (w)
ketoza patologiczna
Szlaki metaboliczne acetylo CoA
Ogólny zarys syntezy cholesterolu
współzależność przemiany węglowodanowej i tłuszczowej
powiązanie przemian węglowodanów i tłuszczy w cyklu krebsa
VII PŁYNY USTROJOWE, BIOCHEMIA NARZĄDÓW I REGULACJA PROCESÓW BIOCHEMICZNYCH
Wymiana i transport gazów oddechowych
równowaga kwasowo-zasadowa
-skład płynów ustrojowych
-węglanowy układ buforowy osocza i płuc
-kwasica i zasadowica
Definicja i funkcje krwi
Budowa i znaczenie hemu
Procesy degradacyjne hemoglobiny
Omówić dokładnie skład osocza (białka i niebiałkowe składniki)
biologiczna rola białek krwi
krzepnięcie krwi
funkcja nerek
omówić kolejne etapy powstawania moczu
współczynnik oczyszczania i próg nerkowy
Omówić dokładnie składniki moczu fizjologicznego, w jakich procesach powstają
patologiczne składniki moczu
budowa i podział hormonów
mechanizm działania hormonów
różnica: enzymy/hormony
Budowa i klasyfikacja witamin
Awitaminozy, hipowitaminozy i hiperwitaminozy
funkcje katalityczne witamin (koenzymy)
biochemia widzenia
kwasy żółciowe - skład, znaczenie
wątroba - funkcja biochemiczna i detoksykacyjna
układ pokarmowy - funkcja biochemiczna
profil metaboliczny - mięśnie, tkanka tłuszczowa
mleko - podstawowe składniki
metabolizm ksenobiotyków - biotransformacja i detoksykacja