Szlak metaboliczny – uporządkowana, skoordynowana sekwencja przemian biochemicznych, prowadząca od substratu do produktu.
Katabolizm i anabolizm.
ATP – krótkotrwały, uniwersalny przenośnik energii.
Glikogen:
długotrwały rezerwuar energii,
tworzenie – glikoliza,
rozkład – glikogenoliza,
znajduje się w większości tkanek zwierzęcych, głównie w wątrobie i mięśniach.
Tłuszcze:
materiał zapasowy komórek zwierzęcych,
jako materiał zapasowy występują też w roślinach, głównie w nasionach, biorą udział w kiełkowaniu,
możliwość zmagazynowania ok. 2x więcej energii, niż w glikogenie,
energia trudniej dostępna,
Skrobia – rezerwuar energii u roślin.
Konwersja energii przez błonę
Biokatalizatory – determinują reakcje zachodzące w organizmie.
Białkowe – czasem wymagają dodatkowych struktur (koenzymy, grupy prostetyczne).
Obniżają energię aktywacji. Schemat!
Sposoby obniżania energii aktywacji
związanie dwóch substratów w jednym miejscu,
wiązanie cząsteczki przez enzym i „wygięcie” jej tak, aby miejsce reakcji było lepiej wyeksponowane,
przyłączenie do miejsca obdarzonego ładunkiem
Specyficzność
substratów,
reakcji,
regionu substratu,
chiralności,
Enzym posiada centrum aktywne i wiążące.
Inhibicja enzymów
Inhibitor kompetencyjny – wiąże się z centrum aktywnym, blokując enzym
inhibitor niekompetencyjny
wiąże się z enzymem częściowo blokując centrum aktywne,
wiąże się z enzymem w miejscu innym niż centrum aktywne, zmieniając konformację enzymu.
Regulowanie szlaków metabolicznych
sprzężenie zwrotne
dodatnie
ujemne
operon laktozowy
Nazewnictwo enzymów
-aza
Rdzeń nazwy – nazwa substratu lub reakcji, np. dekarboksylaza.
-lity, gdy rozkłada substrat proteolityczny.
Nazwy zwyczajowe, np. trypsyna
Klasy enzymów